吕迪·阿贝尔索德
人员信息
附属: 苏黎世ETH,瑞士系统生物学研究所
优化列表
2020年–今天
2023 [公元22年] 王芳(Fang Wang) , 范扬 , 黄龙凯 , 魏丽 , 宋江宁 , 罗宾·B·加斯(Robin B.Gasser) , 吕迪·阿贝尔索德 , 王国华 , 姚建华 :
用于组织蛋白质组分析中细胞类型混合物反褶积的深域对抗性神经网络。 Nat.Mac公司。 智力。 5 ( 11 ) : 1236-1249 ( 2023 ) 2022 [公元21年] 瓦伦·沙尔马 , 安德里亚·福萨蒂 , 鲁道夫·齐瓦 , 马里亚·布尔扬 , 埃文·威廉姆斯 , 甄晨 , 邵文光 , 帕特里克·G·A·佩德里奥利 , 安东尼·普赛尔 , 玛丽亚·罗德里格斯·马丁内斯 , 宋江宁 , 马蒂奥·马尼卡 , 吕迪·阿贝尔索德 , 陈丽 :
PCfun:蛋白质复合物功能系统表征的混合计算框架。 生物信息简报。 23 ( 4 ) ( 2022 ) 2021 [公元20年] 乔里斯·卡多 , 马蒂奥·马尼卡 , 罗兰·马蒂斯 , 郭天南 , 吕迪·阿贝尔索德 , 玛丽亚·罗德里格斯·马丁内斯 :
关于使用原始质谱数据进行深度学习应用的可行性。 生物信息。 37 ( 补充 ) : 245-253 ( 2021 )
2010 – 2019
2018 [j19] 邵文光 , 帕特里克·G·A·佩德里奥利 , 维托尔德·沃尔斯基 , 克里斯蒂安·斯库特斯库 , 伊曼纽尔·施密德 , 胡安·安东尼奥·维兹卡诺 , 马修·库塞尔 , 海科·舒斯特 , 丹尼尔·科瓦列夫斯基 , 法比奥·马里诺 , 塞西莉亚·林德斯塔姆·阿勒哈姆 , 凯里·沃恩 , 比约恩·彼得斯 , 亚历山德罗·塞特 , 汤姆·H·M·奥滕霍夫 , 克里斯塔·梅杰加丹 , 娜塔莉·尼乌文惠岑 , 斯特凡·H·E·考夫曼 , 拉尔夫·施拉普巴赫 , 约翰·C·卡斯尔 , 阿列克谢·内斯维兹斯基 , 莫滕·尼尔森 , 埃里克·W·多伊奇 , 大卫·S·坎贝尔 , 罗伯特·莫里茨 , 罗马人A.祖巴列夫 , 安德斯·吉米·伊特伯格 , 安东尼·普赛尔 , 米盖尔·马西拉 , 阿尔贝托·帕拉德拉 , 王琦(Qi Wang) , 凯瑟琳·科斯特洛 , 尼古拉·特内特 , 彼得·范·韦伦 , 塞西尔·范·埃尔斯 , 阿尔伯特·J·R·赫克 , 古斯塔沃·A·德·苏扎 , Ludvig Magne Sollid公司 , 阿里·阿德蒙 , 斯特凡·斯特瓦诺维奇 , 汉斯·乔治·拉姆西 , 皮埃尔·蒂鲍特 , 克劳德·佩雷奥 , 迈克尔·巴萨尼·斯滕伯格 , 吕迪·阿贝尔索德 , 艾蒂安·卡隆 :
SysteMHC Atlas项目。 核酸研究。 46 ( 发布数据库 ) : D1237-D1247 ( 2018 ) [公元18年] 尼古拉斯·亨利 , 伊娃·马里亚·克拉默 , 弗洛里安·斯坦格尔 , 昆汀·亚当斯 , 弗朗索瓦·范·利弗林格 , 艾伦·湖滨 , Rui Chaves公司 , 鲁斯兰·埃夫雷莫夫 , 吕迪·阿贝尔索德 , 盖·范登巴斯(Guy Vandenbussche) , 玛蒂娜·普雷沃斯特 , 文森特·劳森斯 , 圣埃芬妮·德鲁 :
脂溶性载脂蛋白E4结构及其受体结合机制由交联耦合质谱和分子动力学方法确定。 公共科学图书馆计算。 生物。 14 ( 6 ) ( 2018 ) 2016 [公元17年] 吕迪·阿贝尔索德 , 马蒂亚斯·曼 :
蛋白质组结构和功能的质谱研究。 国家。 537 ( 7620 ) : 347-355 ( 2016 ) 2015 [公元16年] 汉内斯·洛斯特 , 乔治·罗森伯格 , 吕迪·阿贝尔索德 , 拉尔斯·马尔姆斯特罗姆 :
高通量靶向蛋白质组学实验的高效可视化:TAPIR。 生物信息。 31 ( 14 ) : 2415-2417 ( 2015 ) [公元15年] 林阳成 , 刘燕生(Yansheng Liu) , 张庆云 , 汉内斯·洛斯特 , 吕迪·阿贝尔索德 , 奥尔加·维泰克 :
在与数据相关的光谱采集实验中,通过统计消除具有较大中间变异的光谱特征,可以增强定量蛋白质水平的结论。 BMC生物信息。 16 ( S-2段 ) : A4 ( 2015 ) [公元14年] 纳迪纳斯·尼列戈达 , 珍妮·柯尔斯坦 , 安娜·斯拉契奇 , 米哈伊洛·贝林斯基 , 安东尼娅·斯坦克 , 弗洛里安·斯坦格尔 , 克里斯汀·阿恩斯伯格 , 高学潮 , 安妮卡·西奥 , 吕迪·阿贝尔索德 , D.莱斯·吉尔布里德 , 丽贝卡·韦德 , 理查德·森本理查 , 马蒂亚斯·梅耶尔 , 伯恩德·布考 :
关键的HSP70协同伴侣复合体解锁后生动物蛋白质的分解。 国家。 524 ( 7564 ) : 247-251 ( 2015 ) [i2] 鲁道夫·埃伯索尔德 , 奥利弗·科尔巴赫 , 奥尔加·维泰克 :
计算质谱(Dagstuhl研讨会15351)。 达格斯图尔报告 5 ( 8 ) : 9-33 ( 2015 ) 2014 [j13] 乔治·罗森伯格 , 克里斯蒂娜·路德维希 , 汉内斯·洛斯特 , 吕迪·阿贝尔索德 , 拉尔斯·马尔姆斯特罗姆 :
aLFQ:从无标签LC-MS/MS蛋白质组学数据估计绝对蛋白质量的R包。 生物信息。 30 ( 17 ) : 2511-2513 ( 2014 ) 2013 [i1] 吕迪·阿贝尔索德 , 奥利弗·科尔巴赫 , 奥尔加·维泰克 :
计算质谱(达格斯图尔研讨会13491)。 达格斯图尔报告 三 ( 12 ) : 1-16 ( 2013 ) 2012 [公元12年] 蒂莫西·克劳夫 , 萨菲娅·塔米尼 , 苏珊娜·拉格 , 吕迪·阿贝尔索德 , 奥尔加·维泰克 :
复杂设计的无标签LC-MS实验中的统计蛋白质定量和显著性分析。 BMC生物信息。 13 ( 第16页 ) : S6系列 ( 2012 ) 2011 [公元11年] 阿卜杜拉·卡拉曼 , 拉尔斯·马尔姆斯特罗姆 , 吕迪·阿贝尔索德 :
Xwalk:计算和可视化交联实验中的距离。 生物信息。 27 ( 15 ) : 2163-2164 ( 2011 ) [公元10年] Mi-Youn K.Brusniak先生 , 宋达国 , 克里斯琴森 , 大卫·S·坎贝尔 , 卢卡斯·雷特 , 保拉·皮科蒂 , 乌尔里克·库斯巴赫 , 赫克托·拉莫斯 , 埃里克·W·多伊奇 , 陈敬春 , 罗伯特·莫里茨 , 吕迪·阿贝尔索德 :
ATAQS:用于高通量过渡优化和验证选定反应监测质谱的计算软件工具。 BMC生物信息。 12 : 78 ( 2011 ) [公元9年] 安吉拉·鲍奇 , 伊莎贝拉·阿达姆齐克 , 彼得亚·布泽克 , 弗朗兹·约瑟夫·埃尔默 , 卡洛扬·埃尼马涅夫 , Pawel Glyzewski公司 , 曼纽尔·科勒 , 托马斯·皮拉克 , 安德烈亚斯·昆特 , Chandrasekhar Ramakrishnan公司 , 克里斯蒂安·贝塞尔 , 拉尔斯·马尔姆斯特罗姆 , 吕迪·阿贝尔索德 , 伯恩德·林恩 :
openBIS:一个灵活的框架,用于管理和分析生物学研究中的复杂数据。 BMC生物信息。 12 : 468 ( 2011 ) [j8] 曼弗雷德·克拉森 , 吕迪·阿贝尔索德 , 约阿希姆·M·布曼 :
综合蛋白质组学数据集的蛋白质组覆盖率预测。 J.计算。 生物。 18 ( 三 ) : 283-293 ( 2011 ) 2010 【c2】 曼弗雷德·克拉森 , 吕迪·阿贝尔索德 , 约阿希姆·M·布曼 :
综合蛋白质组学数据集的蛋白质组覆盖率预测。 重组 2010 : 96-109 [第1页] 亨利·林 , 吕迪·阿贝尔索德 :
串联质谱技术用于肽鉴定的光谱库搜索。 蛋白质组生物信息学 2010 : 95-103
2000 – 2009
2009 [j7] 尼尔斯·格伦堡 , 魏燕 , Inyoul Y.Lee公司 , Hyuntae Yoo(贤泰佑) , 凯·尼塞尔特 , 大河黄 , 吕迪·阿贝尔索德 , 莱诺伊·胡德 :
Prequips-一个可扩展的软件平台,用于LC-MS/MS蛋白质组学数据的集成、可视化和分析。 生物信息。 25 ( 5 ) : 682-683 ( 2009 ) [j6] 曼弗雷德·克拉森 , 吕迪·阿贝尔索德 , 约阿希姆·M·布曼 :
基于无限马尔可夫模型的蛋白质组覆盖预测。 生物信息。 25 ( 12 ) ( 2009 ) [j5] Sandra N.Loevenich公司 , 埃里希·布伦纳 , 尼科尔·L·金 , 埃里克·W·多伊奇 , 斯蒂芬·斯坦因 , 吕迪·阿贝尔索德 , 恩斯特·哈芬 :
果蝇肽Atlas促进了肽数据的使用,以改进苍蝇蛋白质组学和基因组注释。 BMC生物信息。 10 ( 2009 ) 2008 【j4】 赫克托·拉莫斯 , P.香农 , 吕迪·阿贝尔索德 :
蛋白质信息和属性浏览器:一个易于使用的富客户端web应用程序,用于蛋白质组数据的管理和功能分析。 生物信息。 24 ( 18 ) : 2110-2111 ( 2008 ) [j3] 大河黄 , 张宁(Ning Zhang) , 胡肯·李 , 尤金·易 , 张慧(音) , Inyoul Y.Lee公司 , 莱诺伊·胡德 , 吕迪·阿贝尔索德 :
MS-BID:一个Java包,用于基于LC-MS的无标签比较蛋白质组分析。 生物信息。 24 ( 22 ) : 2641-2642 ( 2008 ) [注2] Mi-Youn K.Brusniak先生 , 伯恩德·博登米勒 , 大卫·S·坎贝尔 , 凯利·库克 , 詹姆斯·埃德斯 , 安德鲁·加布特 , 刘玉玲(Hollis Lau) , 西蒙·莱塔特 , 卢卡斯·穆勒 , 瓦吉莎·夏尔马 , 奥尔加·维泰克 , 张宁(Ning Zhang) , 吕迪·阿贝尔索德 , 朱利安·瓦茨 :
Corra:LC-MS发现和基于靶向质谱的蛋白质组学的计算框架和工具。 BMC生物信息。 9 ( 2008 ) 2007 【c1】 多米尼克·佐索 , 迈克尔·波德维内克 , 马库斯·米勒 , 吕迪·阿贝尔索德 , 曼努埃尔·C·佩奇 , 托尔斯滕·施威德 :
基于PC网格的串联质谱蛋白质鉴定。 健康网格 2007 : 3-12 2006 [j1] 弗兰克·德西埃尔 , 埃里克·W·多伊奇 , 尼科尔·L·金 , 阿列克谢·内斯维兹斯基 , 帕拉格·马利克 , 吉米·K·英 , 人莎伦·陈 , 詹姆斯·埃德斯 , Sandra N.Loevenich公司 , 吕迪·阿贝尔索德 :
PeptideAtlas项目。 核酸研究。 34 ( 发布数据库 ) : 655-658 ( 2006 )