IEEE/ACM计算生物学和生物信息学汇刊，第7卷
第7卷第1期，2010年1月
埃斯特·迪亚斯 , 吉列尔莫·阿亚拉 
, 玛丽亚·迪亚兹·费尔南德斯 , 梁公 , 德里克·图姆 :
分泌细胞中大密度核心囊泡的自动检测及其细胞内分布的统计分析。 2-11 卡罗尔·卢什鲍（Carol Lushbough） , 迈克尔·K·伯格曼 , 卡罗琳·劳伦斯 , 道格拉斯·M·詹纽因 , 沃尔克·布伦德尔 :
BioExtract服务器-访问和分析异构分布式生物分子数据的集成工作流支持系统。 12-24 生火朱 , 王丁丁 , Kai Yu公司 , 陶莉 , 龚一红 :
基于模型熵的基因表达特征选择。 25-36 佩特里·佩科宁 , 王永吉 , 彼得里·特罗宁 :
启发式贝叶斯分割在基因组区域内发现共表达基因。 37-49 拉斐尔·库斯特拉 , 亚当·扎格丹斯基 :
聚类微阵列数据中的数据融合：平衡发现和可解释性。 50-63 奥利弗·吕贝尔 , 冈瑟·H·韦伯 , 黄敏宇 , E.韦斯·贝瑟尔 , 马克·D·比金 , 查尔斯·福克斯 , 克里斯·卢恩戈·亨德里克斯 , 土壤V.E.Keränen , 迈克尔·艾森 , 大卫·W·诺尔斯 , 吉坦德拉·马利克 , 汉斯·黑根 , 伯恩德·哈曼 :
集成数据聚类和可视化以分析3D基因表达数据。 64-79 居汉（Ju Han） , 恒昌 , 库马里·安达拉韦瓦 , 保罗·亚斯温 , 玛丽·海伦·巴赛洛斯·霍夫 , 巴赫拉姆·帕文 :
细胞表面蛋白质和核标记物的多维图谱。 80-90 Bogdan完成 , Purvesh Khatri公司 , Arina完成 , 索林·德拉吉奇 :
使用语义分析预测新的人类基因本体注释。 91-99 刘振秋 , 林世丽 , 明坛 :
生物标记识别的L_{p}惩罚稀疏支持向量机。 100-107 Yukyee Leung先生 , 杨山雄 :
基因选择和微阵列数据分类的多重过滤-多重包装方法。 108-117 西奥多·帕金斯 , 迈克尔·哈利特 :
从时间序列数据学习布尔网络时样本复杂性和计算复杂性之间的权衡。 118-125 理查德·佩利坎 , 米洛斯·奥斯克雷希特 :
全样品质谱蛋白质组学的高效峰值标记算法。 126-137 普丽塔·马哈塔 :
黑色素瘤和乳腺癌分级聚类的探索性共识。 138-152 萨拉·马德拉 , 米盖尔·特谢拉 , 伊莎贝尔·萨科雷亚 , 阿林多·L·奥利维拉 :
使用线性时间双聚类算法识别时间序列基因表达数据中的调节模块。 153-165 埃尔沙南·莫塞尔 , 塞巴斯蒂安·罗奇 :
不完全谱系分类：来自多个位点的一致系统发育估计。 166-171 亚历克斯·阿尔夫斯·弗雷塔斯 , 丹妮拉·维瑟 , 罗尔夫·阿普韦勒 :
蛋白质功能预测中可理解分类模型的重要性。 172-182 诺加·艾伦 , 本尼·乔尔 , 法比奥·帕迪 , 阿纳特·拉波波特 :
近似最大节俭和祖先最大似然。 183-187
第7卷第2期，2010年4月
玛丽-法国Sagot :
EIC编辑。 193-194 斯特凡诺·洛纳尔迪 , 杰克·岳·陈 :
生物信息学中的数据挖掘：来自BIOKDD的论文选集。 195-196 亚伦·M·斯马特 , 君欢 , 易佳 , 杰拉尔德·卢辛顿 :
GPD：用于精确图形分类的图形模式扩散核，在化学信息学中应用。 197-207 佩特科·博格达诺夫 , 安布吉·K·辛格 :
利用邻域特征进行分子功能预测。 208-217 Luay Nakhleh公司 :
简化系统发育网络空间的度量。 218-222 Gunjan Gupta公司 , 亚历山大·刘 , 乔伊迪普·戈什 :
自动分层密度调整：一个用于大型生物数据集的稳健自动聚类和可视化框架。 223-237 道格拉斯·W·雷福德 , 丹·克莱恩 , 特拉维斯·E·末日 , 迈克尔·L·雷默 :
自动分离抵抗GC（AT）内容混淆效应的翻译效率偏差。 238-250 阿瑟·特内豪斯 , 文森特·吉列莫特 , 泽维尔·吉德罗 , 文森特·弗罗因 :
利用基于PLS回归的偏相关正则估计从微阵列数据中获得的基因关联网络。 251-262 朱泽轩 , Yew-Soon Ong公司 , 雅切克·M·祖拉达 :
全类和部分类相关基因的鉴定。 263-277 兰吉特·兰哈瓦 , 克利福德·A·沙弗 , 约翰·泰森 :
高分子调控网络的模型合成。 278-287 沙希德·博哈里 , 丹尼尔·詹妮斯 :
用于研究分段病毒进化的重组网络。 288-298 特蕾西·贝杰曼 , 赵璐萍（Lue Ping Zhao） :
cDNA微阵列数据的信号质量测量。 299-308 纪尧姆百叶窗 , 阿兰·丹尼斯 , 谢尔盖·杜卢克 , 克莱尔·赫尔巴赫 , 赫莱恩·图泽特 :
RNA结构的排列。 309-322 江明辉 :
用任意伪结预测RNA二级结构的近似算法。 323-332 涉谷铁雄 :
柔性蛋白质结构的快速铰链检测算法。 333-341 西尔万·吉列莫特 , 文森特·贝里 :
最大一致超树问题的固定参数可拓性。 342-353 刘晓文 , 李金燕 , 王路生 :
用拟生物液模拟蛋白质相互作用基团：复杂性、算法和应用。 354-364 兴钦奇 , 李国军 , 李曙光 , 应旭 :
按相互易位、插入和删除对基因组进行排序。 365-374 乔拉·昂格尔 , 本尼·乔尔 :
基因表达数据集的线性可分性。 375-381
第7卷第3期，2010年7月
弗洛里安·莱特纳 , 斯科特·马尔迪斯 , 马丁·克莱林格 , 吉安尼·塞萨里尼 , 勒奈特·赫希曼 , 阿方索·巴伦西亚 :
生物创意概述II.5。 385-399 阿特米·科尔钦斯基 , 阿拉·阿比·海达尔 , 贾斯琳·考尔 , 艾哈迈德·阿卜丁·哈米德 , 路易斯·马特乌斯·罗查 :
使用文本和引文网络特征对蛋白质相互作用全文文档进行分类。 400-411 戴洪杰 , 波廷莱 , 理查德·宗才 :
全文文章中蛋白质相互作用体提取的多阶段基因归一化和基于SVM的排序。 412-420 曼兰 , 苏健（Jian Su） :
BioCreative II.5挑战中全文蛋白质相互作用文章分类任务（ACT）的实证研究。 421-427 陈一飞 , 刘峰（音） , 伯纳德·曼德里克 :
BioLMiner系统：BioCreative II.5挑战中的交互规范化任务和交互对任务。 428-441 符文Stre , 吉田和弘 , Makoto Miwa公司 , 松崎拓哉 , 卡诺吉野 , Jun’ichi Tsujii先生 :
使用统一的AkaneRE事件提取系统从文本中提取蛋白质相互作用。 442-453 曹永刚 , 李左凤 , 刘飞凡 , 沙申克·阿加瓦尔 , Qing Zhang（张青） , 洪宇 :
BioCreative II.5挑战的IR-Aided机器学习框架。 454-461 卡林·弗斯波尔 , 克里斯托夫·罗德 , 海伦·L·约翰逊 , K.布雷顿·科恩 , 威廉·鲍姆加特纳。 , 劳伦斯·亨特 :
探索基于物种的基因规范化策略。 462-471 法比奥·里纳尔迪 , Gerold Schneider公司 , Kaarel Kaljurand公司 , 西蒙·铁线莲 , 塞雷斯·瓦雄 , 马丁·罗马克 :
生物创意II.5中的OntoGene。 472-480 约尔格·哈肯伯格 , 罗伯特·莱曼 , 阮河沃 , 悉达多·乔纳拉加达 , 瑞安·沙利文 , 克里斯·米勒 , 路易斯·塔里 , 奇塔·巴拉尔 , 格雷西拉·冈萨雷斯 :
从全文文章中有效提取蛋白质-蛋白质相互作用。 481-494 雷扎尔·阿拉姆·乔杜里 , 海森乐 , 维贾亚·拉马钱德兰 :
生物信息学的缓存式动态编程。 495-510 莱昂纳多·蒂尼尼 , 保拉·贝托拉齐 , 亚历山德拉·戈迪 , 朱塞佩·兰西亚 :
CollHaps：简约主义对单倍体推理的启发式方法。 511-523 罗纳德·杰库普斯（Ronald Jackups Jr.）。 , 梁洁 :
短序列片段中序列和空间主题发现的组合分析。 524-536 韩晓旭 :
癌症分子模式发现的非负主成分分析。 537-549 贾曾 , 赵晓宇 , 曹晓琴 , 洪燕 :
SCS：全基因组人类启动子识别的信号、上下文和结构特征。 550-562 亚瑟·齐梅克 , 费比安·布奇瓦尔德 , 艾比·弗兰克 , 斯特凡·克莱默 :
蛋白质的层次和平面分类研究。 563-571 玛丽亚·路易莎·博内 , 凯瑟琳·圣约翰 :
关于uSPR距离的复杂性。 572-576
第7卷第4期，2010年10月
离子I.Mandoiu , 吉里·纳拉辛汉 , 易潘 , 张延庆 :
特邀编辑介绍生物信息学研究和应用专题。 577-578 阿德里亚娜·穆尼奥斯 , 大卫·桑科夫 :
Contig形式基因组的系统发育重排。 579-587 巴拉吉·文卡塔卡拉姆 , 吉姆·苹果 , 凯瑟琳·圣约翰 , 丹·古斯菲尔德 :
解开七巧板：通过绘画来比较树木。 588-597 保拉·博尼佐尼 , 吉安卢卡·德尔拉·维多瓦 , 里卡多·唐迪 , 尤里·皮罗拉 , 罗密奥·里兹 :
纯粹简朴的X或单倍型。 598-610 吴玉凤 :
无限位模型下泛种群和细分种群聚集可能性的精确计算。 611-618 Sangustevar Rajasekaran公司 , 萨哈尔·塞西 , 雷达·A·阿马尔 :
ESLTAGs解析的改进算法：适用于RNA伪结的语法模型。 619-627 纪尧姆百叶窗 , 弗洛里安·西科拉 , Stéphane Vialette酒店 :
使用反馈顶点集查询蛋白质相互作用网络中的图。 628-635 强诚（Qiang Cheng） :
高维数据稀疏学习机及其在微阵列基因分析中的应用。 636-646 威廉·兰登 , 格雷厄姆·J·G·厄普顿 , 雷娜塔·达席尔瓦·卡马戈 , 安德鲁·哈里森 :
智人Affymetrix基因芯片空间缺陷调查。 647-653 李刚（音译） , Tak-Ming Chan先生 , Kwong Sak Leung先生 , 李建宏（Kin-Hong Lee） :
一种用于Motif发现的聚类细化算法。 654-668 周建军 , 约格·桑德 , 蔡志鹏 , 王路生 , 林国辉 :
使用较小距离计算查找生物数据库中的最近邻居。 669-680 梁成煌 , 连富来 , 迈克尔·格罗米哈 :
用于整合氨基酸序列信息和突变蛋白质稳定性的人类可读规则生成器。 681-687 克里斯托夫·戈丁 , 帕斯卡·费拉罗 :
量化树木的自嵌套程度：在植物结构分析中的应用。 688-703 萨吉·斯尼尔 , 萨蒂什·拉奥 :
四分位数最大切割：一种分治四分位数算法。 704-718 新路 , 安东尼·加姆斯特 , 徐荣辉 :
RDCurve：评估排名程序稳定性的非参数方法。 719-726 赫伯特·H·曾 , 凯·C·威斯 :
SARNA预测：使用基于置换的模拟退火提高RNA二级结构预测的准确性。 727-740 李文友 , 弗拉基米尔·布鲁西奇 , 马库斯·加拉赫 , 米凯尔·博登 :
用高斯过程剔除试验检测病原基因组中的T细胞表位。 741-751 阿尔贝托·阿波斯托利科 , 马泰奥·科明 , 拉克米·帕里达 :
VARUN：发现饱和约束下的可扩展模式。 752-762 伊斯特万·米克洛斯 , 本斯·梅里库蒂 , 克里斯特·斯文森 :
都市部分重要性抽样MCMC在最小反向重排路径上缓慢混合。 763-767
