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化学信息学杂志，第5卷-增补

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第5卷，编号S-12013年3月

第八届德国化学信息学会议：26 CIC-车间

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乌里·费什内尔:
第八届德国化学信息学会议。 1

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托尔斯滕·迈恩,格雷戈里·兰德鲁姆:
用KNIME让你的化学反应正确。 1
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丽贝卡·韦德:
药物设计中的靶向蛋白质动力学。 1
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费利克斯·劳什,沃尔夫冈·布兰特,马丁·希希特,拉尔斯·布劳尔,泡尔生:
两种新型表面活性剂蛋白质的蛋白质建模和分子动力学研究。 2
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拉尔斯·帕克希斯,乔治·伯肯豪尔,德克·布兰克,塞巴斯蒂安·布鲁尔斯,安德烈·布林克曼,伊内斯·多斯·桑托斯·维埃拉,格雷戈·费尔斯,桑德拉·格辛,理查德·格兰斯克,Sonja Herres-Pawlis公司,奥利弗·科尔巴赫,延斯·克鲁格,马丁·克鲁斯,乌尔里希·朗,拉尔夫·穆勒·普费弗科恩（Ralph Müller-Pfefferkorn）,帕特里克·施费尔,托比亚斯·施莱默,托马斯·斯坦克,克劳斯·迪特尔·瓦尔泽查,安德烈亚斯·辛克:
MoSGrid-e-science网关：分布式计算环境中的分子模拟。三
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格雷戈里·兰德鲁姆:
化学信息学和计算化学研究的再现性：当然我们可以做得更好。 4
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弗格特,尤尔根·巴约拉斯:
虚拟筛选中相似系数值分布的统计建模及其在预测指纹搜索性能中的应用。 5
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安德鲁·戴克,詹娜·黑斯廷斯:
FMCS：多MCS问题的一种新算法。 6
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芭芭拉·桑德,奥利弗·科尔布,杰森·科尔,乔纳森·埃塞克斯:
如何挑选获胜团队：为基于集合的虚拟筛选选择计算衍生蛋白质结构的方法。 7
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马蒂亚斯·拉里,阿德里安·科洛齐克,萨沙·乌尔巴切克:
让我们来谈谈戒指。 8
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理查德·谢霍德,瓦莱丽·吉列,蒂埃里·汉瑟,菲利普·贾德森,乔纳森·维西:
通过从毒性数据中挖掘新兴模式来发现毒理学知识。 9
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卢西奥·恰奇:
原子级非均匀界面性质的计算预测。 10
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凯·斯图肯施奈德,朱利安·默兹,维克托·米尔曼,格哈德·申比克:
氨基酸与MFI型分子筛pH依赖性相互作用的理论和实验研究。 11
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约翰·柯奇马尔,安德鲁·霍利特,胡里奥·佩罗塞利（Julio E.Peironcely）,丹尼尔·穆雷尔,马克·J·威廉姆森,塞缪尔·亚当斯,托马斯·汉克梅耶,利奥·范布伦,古斯·杜恰图,沃纳·克拉夫克,罗伯特·C·格伦:
量化小有机分子代谢引起的物理化学性质空间的变化。 12
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保罗·托斯卡,安德烈亚斯·克拉姆:
3D-QSAR已重新加载：Open3DALIGN符合COSMOsar3D。 13
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安德烈亚斯·霍勒:
数据集重叠密度分析。 14
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罗杰·A·赛尔,何塞·巴蒂斯塔,J.安德鲁·格兰特:
大型化学数据库的高效最大公共子图（MCS）搜索。 15
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格恩特·格雷特,乔纳森·古德曼,乍得·H·G·艾伦:
化学反应的国际化学标识符。 16
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克劳斯·吉尔根·施莱弗:
农药设计的挑战。 17
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夏洛塔·谢尔菲,约阿希姆·泰格,佩吉·路透社,尼娜·费舍尔,延斯·克鲁格,伯恩德·维辛格,奥利弗·科尔巴赫:
针对突变体交通缺陷CNG通道的药物伴侣的药物载体模型的开发。 18
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马丁·莫西什,简·西蒙斯,卢兹·希尔特豪斯,安德鲁·托尔达:
工业应用葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的改性：预测和试验。 19

论文大字报展示

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巴哈勒赫·霍纳帕瓦尔,亨德里克·克鲁格,马哈茂德·索利曼,格伦·马奎尔,塔文德兰·戈文德:
合成的五环-甘蔗肽作为潜在HIV-1野生型C-SA蛋白酶抑制剂的分子模拟研究。 1
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迪拉吉·辛哈,莫泰扎·卡比里,大卫·雷哈,Rüdiger Ettrich公司:
大肠杆菌运动亚单位的电子鉴定。限流修正系统EcoR1241。 2
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克里斯汀·施瓦尔费尔,坦尼娅·舒尔兹·加斯赫,马蒂亚斯·拉里:
TorsionAnalyzer：探索构象空间。三
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安德烈亚斯·特鲁斯科夫斯基,安娜玛丽亚·菲伊森,休伯特·库恩,阿希姆·齐勒斯尼,马蒂亚斯·埃普尔:
利用分子片段动力学（MFD）对肽和蛋白质进行分子模拟。 4
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亚历山大·科斯:
将少量配体自动对接到大量结合位点。 5
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弗洛里安·科林:
PREDatar-一种新的基于结构的交叉反应性预测方法。 6
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彼得·施密特克,Ciantar Marine公司,伊莎贝尔·特里特,皮埃尔·杜克洛:
实现hERG通道的完整结构。 7
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Krzysztof Rataj公司,贾格娜·维特克,斯特凡·莫达尔斯基,托马斯·科西奥莱克,安德烈·博贾尔斯基（Andrzej J.Bojarski）:
模板选择在同源建模中的重要性。A 5-羟色胺₆R案例研究。 8
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安娜·卡勒,安塞尔姆·H·C·霍恩,海因里希·斯蒂希特:
单层和双层纤维淀粉样β低聚物的稳定性。 9
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艾琳·索彻,安塞尔姆·H·C·霍恩,海因里希·斯蒂希特:
新型淀粉样蛋白-β四聚体折叠是否为稳定构象？ 10
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迈克尔·沙菲,马丁·皮佩尔,沃尔夫冈·西普:
ParaDockS——一个开放源代码的分子对接框架：目标类特定评分方法的实现。 11
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雅库布·斯泰潘,彼得·库拉内克,米兰蓝科,佐拉·斯特雷尔科娃,亚历斯·克雷内克,雅罗斯拉夫·科卡:
复仇女神-一个分子建模软件包。 12
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卡琳娜·杰恩,弗兰克·施密特·达尔:
建筑材料中运输过程和化学反应的模拟。 13
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Lennart Heinzerling公司,马蒂亚斯·拉里:
眨眼间基于力场的蛋白质-甘氨酸复合物最小化。 14
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索尼娅·利吉,亚历克谢斯·库苏卡斯,亚萨曼·莫塔梅迪,罗伯特·C·格伦,安德烈亚斯·本德:
用路径注释目标：将方法扩展到行动模式分析。 15
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斯蒂芬·马金,安德鲁·亨利,保罗·拉布特,约翰内斯·梅尔,内尔斯·托尔斯汀森:
高效挖掘蛋白激酶结构数据。 16
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萨布丽娜·沃伦豪普,克努特·鲍曼:
结合指纹和基于MCS的（inSARa）网络进行结构-活动-关系分析。 17
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鲁查·奇达沃,安德烈亚斯·本德,塞巴斯蒂安·罗勒:
在电子靶预测中：识别作物保护剂的开靶和离靶。 18
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沃尔夫·迪特里希·伊伦菲尔德:
下一代化学数据库盒式磁带。 19
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沃尔夫·迪特里希·伊伦菲尔德:
将PubChem网络素描器提升到一个新的水平。 20
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本杰明·默吉特,大卫·齐利安,托比亚斯·米勒,克里斯托夫·索特里弗:
MycPermCheck：结核分枝杆菌小分子渗透性预测工具。 21
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巴斯蒂卡·维鲁帕克沙,古普特阿尔帕纳,卡德克·普拉申特,乌代·德什潘德,亚历山德罗·德西德里:
使用基于片段的QSAR分析萘醌衍生物作为拓扑异构酶I抑制剂。 22
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Sergii Novotarskyi公司,尤里·苏什科,罗伯特·科纳,伊戈尔·特特科:
提高五种主要P450亚型抑制活性QSAR建模准确性的化学组学方法。 23
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沙杜尔·帕里查拉克,汤姆·克伦卡,马丁·奥古斯丁,乌梅什·A·帕特尔,安德烈亚斯·本德:
基于生物活性数据修订的激酶分类：数据密度和可视化选择的重要性。 24
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萨宾娜·斯穆斯,拉法尔·库尔扎布,安德烈·博贾尔斯基（Andrzej J.Bojarski）:
散列指纹密度对机器学习方法性能的影响。 25
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亚历克谢斯·库苏卡斯,风疹Torella,乔治·德拉卡基斯,安德烈亚斯·本德,罗伯特·C·格伦:
基于配体化学相似性的相关GPCR药理空间。 26
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大卫·齐利安,克里斯托弗·索特里弗:
将SFCscore与Random Forests相结合可以提高蛋白质-甘氨酸复合物的亲和力预测。 27
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贾格娜·维特克,Krzysztof Rataj公司,斯特凡·莫达尔斯基,萨宾娜·斯穆斯,托马斯·科西奥莱克,安德烈·博贾尔斯基（Andrzej J.Bojarski）:
结构相互作用指标（SIFts）在对接后分析中的应用——深入了解活性和选择性。 28
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蒂莫·克罗茨基,托马斯·福伯,马可·默恩伯格,格哈德·克莱布,埃克·Hüllermier:
用于增强Cavbase中相似性检索的扩展的基于图的模型。 29
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拉斐尔·库尔察布,萨宾娜·斯穆斯,安德烈·博贾尔斯基（Andrzej J.Bojarski）:
训练活动/非活动比率对机器学习性能的影响。 30
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伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺,亚历克谢斯·库苏卡斯,奥尔加·阿比安,安德烈亚斯·本德,阿德里安·维拉兹奎兹·坎波伊（Adrián Velázquez-Campoy）:
协同蛋白靶的电子靶预测的实验验证。 31
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芭芭拉·兹德拉齐尔,安德烈亚斯·朱里克,哈拉尔德·H·赛特,格哈德·埃克尔:
噻加宾类似物的成对结构比较为其蛋白质结合模式提供了新的见解。 32
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德西雷·鲍曼,克努特·鲍曼:
QSAR模型外部验证预测误差的可靠估计。 33
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乔治·德拉卡基斯,亚历克谢斯·库苏卡斯,苏珊·克莱尔·布鲁沃顿,大卫·A·埃文斯,安德烈亚斯·本德:
使用机器学习技术对大鼠睡眠模型的表型读数进行合理化。 34
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苏珊·埃里希,托比亚斯·吉希克,格林特·罗斯,塞德里克·卡林斯基,弗拉基米尔·哈扎克,卢兹·韦伯:
PriaXplore公司^®-一种识别蛋白质相互作用小分子调节剂的新技术平台。 35
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安德鲁·戴克:
FPS指纹格式和chemfp工具包。 36
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斯蒂芬·R·海勒:
InChI-全球化学结构标准。 37
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沃尔克·哈恩克,埃文·博尔顿,斯蒂芬·布莱恩特:
PubChem：分子标准化的原子环境。 38
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塞巴斯蒂安·雷德斯托克:
优化化学信息工作流：集成Reaxys-用例和应用程序。 39
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罗伯特·甘瑟,温妮·德瑟·康拉德,Rares摩尔多瓦,斯特芬·费舍尔,彼得·布鲁斯特:
大麻素受体（CB2）配体的3D-QSAR模型源自对齐的药效剂。 40
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卢卡·卡里诺,马丁·施密特,曼弗雷德·荣格,沃尔夫冈·西普:
新型组蛋白去甲基化酶抑制剂的基于配体和基于结构的设计。 41
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A.祖马尼斯,乔治亚·梅拉格拉基,Antreas Afantis公司:
Enalos KNIME节点：探索环境耐久性、耐老化性和缓蚀性。 42
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詹娜·黑斯廷斯,巴勃罗·科内萨,阿德里亚诺·德克尔,马库斯·埃尼斯,肯尼思·豪格,卡莱·瓦尼·贾亚西兰,纳姆拉塔·卡莱,Tejasvi Mahendraker公司,巴勃罗·莫雷诺,文卡特斯·穆图克里希南,加雷思·欧文,雷扎·M·萨利克,史蒂夫·特纳,克里斯托夫·斯坦贝克:
扩大EBI的天然产品化学资源。 43
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法兹林·福齐,亚历克谢斯·库苏卡斯,罗伯特·洛,Kalpana Joshi公司,泰平风机,安德烈亚斯·本德:
化学生成组学方法用于合理化中药和阿育吠陀药物的复合作用。 44
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奥利弗·科赫:
不仅仅是一个刚性框架：利用二级结构元素信息进行分子设计。 45
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V.阿鲁尔莫齐,雷古纳丹·拉杰什:
利用人工神经网络预测蛋白质定位位点。 46
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V.阿鲁尔莫齐,雷古纳丹·拉杰什:
基于神经网络的邻苯二甲酸酯对肥头小须鲸急性毒性分类。 47
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斯蒂芬·马金,保罗·拉布特,阿兰·阿贾米安,克里斯托弗·威廉姆斯:
非绑定交互的合理化和可视化。 48
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亚历山大·科斯,汉斯·吉尔根·希姆莱:
使用普通的三字母序列码在互联网上发现不寻常的肽。 49
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费萨尔·萨伊德,内奥米·萨利姆,阿马尔·阿卜多,哈姆扎·亨塔利:
使用基于图形的一致性聚类结合异质化学结构的K均值聚类。 50
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艾哈迈德·阿卜杜拉齐兹,亚历山大·萨芬亚耶夫,弗拉基米尔·帕柳林,伊戈尔·V·特科:
建立HTS体外检测的QSAR——预测芳基烃受体活化剂的研究。 51
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彼得·卡塞,扬·斯沃博达,特雷扎·卢齐洛娃,卡米拉·西斯洛娃,马雷克·库兹马:
带有大疏水配体的铂（II）和铂（IV）配合物：新潜在细胞抑制剂的研究。 52
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菲利普·泰尔,丽莎·佩尔塔森,克里斯蒂安·奥特曼,奥利弗·科尔巴赫:
可用化学空间的确定聚类。 53

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