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硅生物学，第11卷

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2012年第11卷第1-2期

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王晓生:
基于基因集富集分析的常见肿瘤特征识别。 1-10
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Dikla Dotan-Cohen公司,达纳月光,莫西·纳丹,约纳特·谢默尔·阿夫尼,Avraham A.梅尔克曼:
表达式数据集成GO。 11-17
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阿尼尔班·穆霍帕迪亚,乌杰瓦尔·毛利克,桑哈米特拉·班多帕提亚:
基于SVM集成的多目标聚类改进的基因表达数据分析。 19-27
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尼尼·弗里马安蒂,谢里夫丁·穆德。扎因,Vannajan Sanghiran Lee公司,哈比巴·A·瓦哈布,罗哈娜尤索夫,努萨达·阿卜杜勒·拉赫曼:
基于片段的新竞争性登革热Den2 Ns2b/Ns3抑制剂的分子设计，来自指根成分（Boesenbergia rotunda）。 29-37
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拉贾什·古哈,加里·威金斯,大卫·J·怀尔德,穆云白,马龙·E·皮尔斯,杰弗里·查尔斯·福克斯:
通过网络基础设施和教育提高化学家化学信息学工具的可用性和可访问性。 41-60
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杰奎琳·休斯·奥利弗,阿蒂娜·布鲁克斯,威廉·J·韦尔奇,莫特扎·哈利迪（Morteza G.Khaledi）,道格拉斯·霍金斯,S.斯坦利·杨,柯蒂斯·帕蒂尔,加里·豪厄尔,雷蒙德·T.Ng,穆迪·T·楚:
ChemModLab：基于网络的化学信息学建模实验室。 61-81
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阿尔贝托·戈比,马修·拉迪,孙海金（Sun-Hee Kim）,弗兰克·鲁布萨姆,马丁·特兰,斯蒂芬·韦伯,艾伦·X·项:
照明器：增加药物和计算化学家之间的协同作用。 83-93

2012年第11卷第3-4期

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J.恩斯特·范登·恩德:
讣告。 95
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Y.Y.瓦斯金,I.V.科米切娃,埃琳娜·伊格纳蒂耶娃,叶夫根尼·维提亚耶夫:
ExpertDiscovery和UGENE集成系统用于基因调控区的智能分析。 97-108
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康斯坦丁·V·冈宾,瓦伦丁·V·苏斯洛夫,米哈伊尔·杰纳耶夫,德米特里·阿丰尼科夫:
分子进化模式分析计算机系统（SAMEM）：在系统发育树的深层内部分支中分析分子进化模式。 109-123
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谢尔盖·拉申,尤里·马图什金:
单倍体进化构造器：新特征和进一步挑战。 125-135
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安德烈·帕利亚诺夫,谢尔盖·凯鲁林,斯蒂芬·D·拉尔森,亚历山大·迪伯特:
走向虚拟秀丽线虫：在3D物理环境中模拟和可视化神经肌肉系统的框架。 137-147
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帕维尔·德门科夫,蒂莫菲·伊万尼森科,尼古拉·科尔沙诺夫,弗拉基米尔·伊万尼森科:
ANDVise:ANDSystem中挖掘关联基因网络的文献图形可视化和分析新工具。 149-161

2012年第11卷，数字5-6

分子流行病学计算进展研讨会，美国佐治亚州亚特兰大，2011年11月12日

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伊琳娜·V·阿斯特拉汉塞娃,大卫·S·坎波,奥夫拉·阿劳霍,Chong-Gee Teo先生,尤里·库德亚科夫,萨利姆·卡米利:
丙型肝炎病毒（HCV）高变区1在急性和慢性感染阶段的变异性差异。 163-173
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大卫·S·坎波,佐亚·迪米特洛娃,詹姆斯·拉拉,迈克·珀迪,洪泰语,苏马提·拉马钱德兰,莉莉娅·加诺瓦·雷娃,X.翟,约瑟夫·福比,Chong-Gee Teo先生,尤里·库德亚科夫:
乙型肝炎病毒聚合酶的协同进化。 175-182
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佐亚·迪米特洛娃,大卫·S·坎波,苏马提·拉马钱德兰,吉尔伯托·沃恩,莉莉娅·加诺瓦·雷娃,林玉林,约瑟夫·C·福比,郭连霞,Pavel Skums公司,布莱恩·皮尔曼,尤里·库德亚科夫:
使用新一代测序、终点限制稀释和质谱法评估病毒异质性。 183-192
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Austin Huang（奥斯汀·黄）,拉米·坎特,艾利森·德隆,利安·施赖尔,索林·伊斯特拉尔:
QColors：一种根据短且非接触的下一代测序读数重建保守病毒准种的算法。 193-201
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詹姆斯·拉拉,尤里·库德亚科夫:
抗原特性与丙型肝炎病毒NS3蛋白结构的关联。 203-212
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詹姆斯·拉拉,约翰·塔维斯,莫林·J·唐林,威廉·M·李,何俊元,布莱恩·皮尔曼,吉尔伯托·沃恩,约瑟夫·福比,郭连霞,尤里·库德亚科夫:
丙型肝炎病毒基因组位点之间的协同进化与宿主因子和干扰素耐药性相关。 213-224
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李平龙,昌河苑,蔡志鹏,徐慧萍,秀凤湾:
反映2009年H1N1流感大流行病毒种群多样性动态的混合模型分析。 225-236
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尼古拉斯·曼库索,巴萨姆·托克,Pavel Skums公司,莉莉娅·加诺瓦·雷娃,离子I.Mandoiu,亚历克斯·泽利科夫斯基:
从NGS扩增子读数重建病毒准种。 237-249
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谢尔盖·曼古尔,阿德里安·卡奇乌拉,奥尔加·格里波娃,离子I.Mandoiu,亚历克斯·泽利科夫斯基:
使用部分注释改进RNA-Seq读取的转录组量化和重建。 251-261
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铺路石头骨,大卫·S·坎波,佐亚·迪米特洛娃,吉尔伯托·沃恩,Daryl T.Lau,尤里·库德亚科夫:
数值检测、测量和分析单个HCV宿主内变异的干扰素耐药性差异及其对治疗反应的影响。 263-269
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达尼舒丁教区,阿萨德·U·汗:
β-内酰胺酶与抑制剂的分子建模和对接分析：一项比较研究。 273-280
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萨兰亚·德瓦拉吉,杰库马尔·纳塔拉扬:
miRNA-mRNA网络检测肺癌中的中心mRNAs和癌症特异性miRNAs。 281-295

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