生物医学语义学杂志，第7卷
2016年第7卷
兰迪·维塔 
, 詹姆斯·奥弗顿 , 艾米丽·西摩 , 约翰·西德尼 , 吉姆·卡法曼 , 丽贝卡·塔尔马奇 , 舍丽·艾丽丝 , 哈蒙德 , 杰夫·W·布彻 , 亚历山德罗·塞特 , 比约恩·彼得斯 :
主要组织相容性限制的本体。 1 安妮卡·奥利希 , 特伦斯·F·米恩 , 海伦·E·帕金森 , Sirarat Sarntivijai公司 , 杰奎琳·怀特 , 娜塔莎·A·卡普 :
将体型视为潜在混杂因素时，报告小鼠模型中的表型。 2 费迪南德·多姆布里斯 , 奥利维尔·博登瑞德 :
研究和医疗术语中表型之间的互操作性-研究HPO和SNOMED CT之间的部分映射。 三 乔戈斯·班帕罗普洛斯 , 埃夫多基莫斯·康斯坦蒂尼迪斯 , 查拉兰波斯·布拉萨斯 , 巴米迪斯Panagiotis D.Bamidis :
走向游戏通用：组成游戏本体，用于发布开放游戏数据。 4 康威 , 阿特姆·霍约扬 , 法里巴法纳 , 威廉·斯库巴 , 梅丽莎·卡斯廷 , 丹妮尔·莫维 , 温迪·查普曼 , 西蒙·朱普 :
开发基于web的SKOS编辑器。 5 崔涛 , 何永群 , 西瓦兰·阿拉班迪 :
疫苗和药物本体研究（VDOS 2014）。 6 乔什·汉纳 , 江边 , 威廉·R·霍根 :
药物成分的准确表示。 7 Sirarat Sarntivijai公司 , 德拉什蒂·瓦桑特 , 西蒙·朱普 , 加里·桑德斯 , A.Patrícia便当 , 丹尼尔·冈萨雷斯 , 乔安娜·贝茨 , 萨米乌尔·哈桑 , 戈蒂尔·科斯切尔尼 , 伊恩·邓纳姆 , 海伦·E·帕金森 , 詹姆斯·马龙 :
将罕见和常见疾病联系起来：在治疗靶点验证中将临床疾病表型映射到本体论。 8 蒋国谦 , 员伊万斯 , 科里·M·恩德尔 , 哈罗德·索尔布里格 , 克里斯托弗·G·丘特 :
使用语义Web技术生成特定于域的模板，以支持临床研究元数据标准。 10 张耀云 , 吴恒一 , 荆城渡 , 徐军（Jun Xu） , 王京琦 , 崔涛 , 郎丽 , 华旭 :
从文献中提取药物-酶关系作为药物-药物相互作用的证据。 11 帕特里克·L·雷 , 亚历山大·考克斯 , 马克·延森 , 特拉维斯·艾伦 , 威廉·邓肯 , 亚历山大·迪尔 :
代表视力和失明。 15 西蒙·朱普 , 托尼·伯德特 , 丹妮尔·韦尔特 , Sirarat Sarntivijai公司 , 海伦·E·帕金森 , 詹姆斯·马龙 :
Webous和Webous Google Add-On—一个基于模板构建本体的web服务和应用程序。 17 Carrine E.空白 , 洪翠（音） , 丽莎·摩尔 , 雷蒙娜·沃尔斯 :
MicrO：原核生物分类描述中发现的表型和代谢特征、分析和培养基的本体论。 18 Kei-Hoi Cheung先生 , Shivakumar Keerthikumar公司 , 保拉·隆卡利亚 , 赛拉克什米苏布拉曼尼亚语 , 马修·罗斯 , 莫妮莎·塞缪尔 , 苏希玛·阿南德 , 拉赫鲁·甘戈达（Lahiru Gangoda） , 斯蒂芬·古尔德 , 罗杰·亚历山大 , 大卫·加拉斯 , 马克·B·戈尔斯坦 , 安德鲁·希尔 , Robert R.厨房 , 扬·洛特瓦尔 , 图沙·帕特尔 :
在细胞外RNA和囊泡通讯的背景下扩展基因本体。 19 于林 , 杰正 , 何永群 :
VICO：基于本体论的疫苗接种知情同意书表示和综合分析。 20 张耀云 , 吴恒毅 , 荆城渡 , 徐军（Jun Xu） , 王京琦 , 崔涛 , 郎丽 , 华旭 :
勘误表：从文献中提取药物-酶关系作为药物-药物相互作用的证据。 21 萨米尔·古普塔 , 凯伦·罗斯 , 卡特琳娜·O·都铎 , 凯西·H·吴 , 卡尔·施密特 , K.Vijay-Shanker先生 :
miRiaD：一种文本挖掘工具，用于检测microRNA与疾病的关联。 9 Aleksandra Sojic公司 , 沃尔特·特卡吉 , 乔治亚·孔蒂尼 , 马可萨柯 :
模块化本体和设计推理模式以个性化健康状况评估：肥胖案例。 12 杜景成 , 易才 , 陈勇（音） , 崔涛 :
基于MedDRA术语的三价流感疫苗不良症状分析，使用2011年的VAERS数据。 13 苏珊·M·贝洛 , 贾南·T·埃皮格 :
在小鼠基因组信息学中推断基因-表型和基因-疾病关系：挑战和解决方案。 14 Masashi Yokochi先生 , 小林直弘 , 埃尔登·尤里奇 , 阿基拉·R·金珠 , 岩田武史 , 扬尼斯·约阿尼迪斯 , 米伦·利夫尼 , 约翰·马克利 , 中村春树 , 小岛卓一郎 , 藤原俊一 :
利用语义网技术发表核磁共振实验数据及其在蛋白质生物医学研究中的应用。 16 徐涵 , 金正杰 , Chee Keong Kwoh先生 :
主动学习用于本体事件提取，包括命名实体识别和未知词处理。 22 马蒂亚斯·布罗赫豪森 , 杰正 , 大卫·L·伯特威尔 , 海瑟·威廉姆斯 , 安娜·玛丽亚·马斯奇 , 海伦娜法官埃利斯 , 克里斯蒂安·斯托克特（Christian J.Stoeckert Jr.）。 :
OBIB是一种新的生物银行本体。 23 黄景山 , 凯伦·艾尔贝克 , 巴瑞·史密斯 , 朱迪思·布莱克 , 《德京斗》 , 黄伟力 , 达伦·纳塔莱 , 阿兰·拉特伯格 , 君欢 , 迈克尔·齐默尔曼 , 蒋国谦 , 于林 , 吴斌（Bin Wu） , 哈里森·斯特拉坎 , 何永群 , 张绍杰 , 王晓伟 , 刘子星 , 格伦·M·博尔切特 , 明坛 :
非编码RNA本体（NCRO）：非编码RNA生物学统一的综合资源。 24 黄景山 , 费尔南多·居特雷斯 , 哈里森·斯特拉坎 , 《德京斗》 , 黄伟力 , 巴瑞·史密斯 , 朱迪思·布莱克 , 凯伦·艾尔贝克 , 达伦·纳塔莱 , 于林 , 吴斌（Bin Wu） , 尼桑萨·德·席尔瓦 , 王晓伟 , 刘子星 , 格伦·博尔切特 , 明坛 , 阿兰·拉特伯格 :
OmniSearch：一个基于MIcroRNA靶标本体（OMIT）的语义搜索系统，用于微RNA靶标基因交互数据。 25 丹妮尔·莫维 , 布莱恩·查普曼 , 康威 , 布雷特·R·南 , 艾琳·麦登 , 萨洛梅·基哈尼 , 温迪·查普曼 :
从退伍军人卫生管理局临床报告中提取中风表型风险因素：信息内容分析。 26 Farrokh Mehryary公司 , 苏维萨·凯文 , 凯·哈卡拉 , 菲利普·金特 :
使用有监督和无监督学习组合过滤大规模事件集合，以进行事件触发分类。 27 西蒙·朱普 , 詹姆斯·马龙 , 托尼·伯德特 , Jean-Karim Hériché , 埃莉诺·威廉姆斯 , 简·埃伦伯格 , 海伦·E·帕金森 , 加布里埃拉·鲁斯蒂奇 :
细胞显微镜表型本体。 28 阿布拉·郭 , 丽贝卡·拉茨 , Junguk Hur公司 , 于林 , 左双香 , 赵丽丽（Lili Zhao） , 乔丹·林德 , 蒋国谦 , 钱朱 , 何永群 :
基于本体的药物相关神经病变不良事件的收集、表征和分析。 29 沃伦·里德 , 乔治·德米特里奥 , 戈兰·内纳迪奇 , 诺埃尔·鲁多克 , 史蒂文斯 , 杰里·温特 :
生物中心知识库：可持续生物资源的本体和知识库。 30 乔戈斯·班帕罗普洛斯 , 埃夫多基莫斯·康斯坦蒂尼迪斯 , 查拉兰波斯·布拉萨斯 , 巴米迪斯Panagiotis D.Bamidis :
勘误表：走向游戏通用：组成游戏本体以发布开放游戏数据。 31 玛丽亚·德尔·卡门·莱加兹·加西亚 , 何塞·安东尼奥·米尼亚罗·吉梅内斯 , 马科斯·梅纳格斯·托托萨 , 杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯 :
通过本体驱动的转换和集成过程生成开放的生物医学数据集。 32 梅赛德斯·阿圭洛·卡斯特莱罗 , 朱莉·克莱因 , 史蒂文斯 :
Proteasix本体论。 33 杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯 , 千叶弘子 , 玛丽亚·德尔·卡门·莱加斯·加西亚 , Ikuo Uchiyama先生 :
正畸本体论：发展与应用。 34 所罗门·阿德巴约 , 肯尼思·麦克劳德 , 伊琳卡·塔多斯 , 大卫·奥苏米·萨瑟兰 , 托尼·伯德特 , 理查德·巴尔多克 , 阿尔伯特汉堡 , 海伦·E·帕金森 :
PhenoImageShare：图像注释和查询基础设施。 35 阿卜杜勒·阿齐兹·阿拉马 , 蒂文森 :
心血管研究摘要中潜在矛盾研究主张的语料库。 36 蒂凡尼·I.梁 , 米歇尔·杜蒙蒂尔 :
临床实践指南和药物结构产品标签适应症之间的药物疾病相关性重叠。 37 汉娜·M·费舍尔 , 罗伯特·霍恩多夫 , 布鲁诺·S·巴泽拉托 , Soheil S.Dadras公司 , 劳埃德·E·金 , 乔治奥斯·格库托斯 , 约翰·P·桑德伯格 , 保罗·N·斯科菲尔德 :
DermO； 描述皮肤病的本体。 38 杰文·博勒曼 , 克里斯托弗·蒙格尔 , 弗朗西斯科·斯特罗齐 , 约阿希姆·巴兰 , 米歇尔·杜蒙蒂尔 , 拉乌尔·让·皮埃尔·博纳尔 , 罗伯特·布尔斯 , 罗伯特·霍恩多夫 , 藤泽隆本 , 片山俊一 , 彼得·J·A·科克 :
FALDO：描述核苷酸和蛋白质特征注释位置的语义标准。 39 卡迪姆·德拉姆 , 弗勒·莫金 , Gayo Diallo公司 :
大规模生物医学文本分类：基于kNN和ESA的方法。 40 雨果·巴斯托斯 , 利塞特·索萨 , 卢卡·A·克拉克 , 弗朗西斯科·库托 :
蛋白质家族中的功能一致性度量。 41 威廉·斯库巴 , 梅丽莎·塔普 , 丹妮尔·莫维 , 尤金·泽特林 , 杨柳 , 弗兰克·德鲁斯 , 温迪·查普曼 :
知识作者：促进用户驱动的领域内容开发，以支持临床信息提取。 42 丹妮尔·莫韦里 , 布雷特·R·南 , 李·M·克里斯滕森 , 冷建伟 , 劳拉·玛丽亚·佩尔顿 , Sanna Salanterä , 汉娜·索米宁 , 大卫·马丁内斯 , 苏米思拉·维卢皮莱 , 不，埃米·埃尔哈达德 , 格尔加纳·萨沃娃 , 萨米尔·普拉丹 , 温迪·查普曼 :
规范首字母缩写词和缩写词以帮助患者理解临床文本：ShARe/CLEF eHealth Challenge 2013，任务2。 43 亚历山大·迪尔 , 特伦斯·F·米恩 , 伊冯·布拉德福德 , 马修·H·布鲁斯 , 瓦西拉·达杜尔 , 大卫·S·道格尔 , 何永群 , 大卫·奥苏米·苏特兰 , 阿兰·拉特伯格 , Sirarat Sarntivijai公司 , 塞里·范·斯莱克 , 尼科尔·瓦西列夫斯基 , 梅丽莎·海德尔 , 朱迪思·A·布莱克 , 克里斯托弗·蒙格尔 :
Cell Ontology 2016：增强了内容、模块化和本体互操作性。 44 阿南迪·伊亚潘 , Shweta Bagewadi Kawalia公司 , 塔玛拉·拉什卡 , 马丁·霍夫曼-阿皮提乌斯 , 菲利普·森格 :
NeuroRDF：对高度精选的数据进行语义整合，以优先考虑阿尔茨海默病中的候选生物标记物。 45 马丁·沙姆 , 达格马尔·沃尔特马 , 柏度·文迪斯 , 奥拉夫·沃尔肯豪尔 :
COMODI：描述生物计算模型版本差异的本体。 46 阿曼达·希克斯 , 乔什·汉纳 , 丹尼尔·韦尔奇 , 马蒂亚斯·布罗赫豪森 , 威廉·R·霍根 :
医学相关社会实体的本体：最新发展。 47 阿斯玛·本·阿巴查 , 朱利奥·塞萨尔·多斯·里斯 , 亚辛·姆拉贝特 , 塞德里克·普鲁斯基 , 马科斯·达·西尔维拉 :
面向本体论和映射验证的自然语言问题生成。 48 卢克·斯莱特 , Georgios V.Gkoutos公司 , 保罗·N·斯科菲尔德 , 罗伯特·霍恩多夫 :
使用AberOWL对BioPortal本体进行快速和可扩展的推理。 49 威廉·R·霍根 , 迈克尔·瓦格纳 , 马蒂亚斯·布罗赫豪森 , 约翰·利万德 , 肖恩·布朗 , 尼古拉斯·米利特 , 杰·德帕斯 , 乔什·汉纳 :
阿波罗结构化词汇：用于流行病模拟的传染病流行病学和人口生物学现象的OWL2本体。 50 詹多梅尼科·波扎 , 斯特凡诺·博戈 , 亚历山德罗·奥尔特拉马利 , 劳拉·康塔尔布里戈 , 斯特凡诺·马兰贡 :
公共卫生机构中的信息和组织：基于本体论的接收分析报告阶段实体建模。 51 克里斯托弗·芬克 , K.Bretonel Cohen公司 , 劳伦斯·亨特 , 卡琳·M·弗斯普尔 :
基因本体同义词生成规则提高了生物医学概念识别的性能。 52 杰正 , 马塞琳·哈里斯 , 安娜·玛丽亚·马斯奇 , 于林 , 阿尔弗雷德·奥·赫罗三世 , 巴瑞·史密斯 , 何永群 :
用于标准化和可复制统计分析的生物和临床统计本体（OBCS）。 53 威廉·霍根 , 沃纳·切斯特斯 :
诊断、误诊、侥幸猜测、传闻等：本体论分析。 54 Seung-Cheol Baek先生 , Jong-Chan公园 :
调整事件注释以改进生物事件提取。 55 巴勃罗·洛佩斯·加西亚 , 斯特凡·舒尔茨 :
SNOMED CT可以在不变形的情况下挤压吗？ 56 Luigi Buttigieg码头 , 埃文格洛斯·帕菲利斯 , 苏珊娜·刘易斯 , 马克·席尔德豪尔 , Ramona L.沃尔斯 , 克里斯托弗·蒙格尔 :
2016年的环境本体：将领域与范围、语义密度和互操作联系起来。 57 马格努斯·阿尔托普 , 玛丽亚·斯凯普斯特特 , 北岛喜浩 , 阿伦·亨利克森 , 拉斐尔·泽普卡 , 荒木贤治 :
在日本患者博客上使用分布式语义扩展医学词汇。 58 普鲁登斯·穆托沃·梅勒内特 , A.帕特里夏·本托 , 内森·德曼 , 安娜·高尔顿 , 安妮·赫西 , 简·洛马克斯 , 约翰·奥弗林顿 :
药物靶点细长：使用基因本体和基因本体注释在ChEMBL中导航蛋白质和靶点空间。 59 伊多娅·伯吉斯 , 大卫·安顿 , 杰苏斯·贝穆德斯 , 阿尔弗雷多·戈尼 , 阿兰扎·伊拉拉门迪 :
TrhOnt：建立一个本体来帮助康复过程。 60 尼古拉斯·塔彭 , 多纳尔·斯蒂芬·西米 , 克里斯·汉金 :
早起者抓住了这个词：将推特和新闻数据结合起来，用于事件检测和态势感知。 61 玛丽亚·德尔·玛丽·罗尔丹·加西亚 , 玛丽亚·杰苏斯·加西亚·戈多伊 , 何塞·弗朗西斯科·阿尔达纳·蒙特斯 :
Dione：ICD-10-CM的OWL表示，用于对患者疾病进行分类。 62 阿斯特里德·杜克·拉莫斯 , 曼努埃尔·奎萨达·马丁内斯 , 米吉拉·伊涅斯塔·莫雷诺 , 杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯 , 史蒂文斯 :
通过OQuaRE中静态和动态缩放功能的组合，支持对本体演化过程的分析。 63 马丁·博克 , 法国法比奥 , 彼得·布朗塞特 , 斯特凡·舒尔茨 :
TNM-O：恶性肿瘤分期的本体支持。 64:1-64:11 罗伯特·霍恩多夫 , 莫娜·阿尔沙赫拉尼 , 乔治奥斯·格库托斯 , 乔治·戈斯林 , 昆廷新郎 , 托马斯·哈曼 , 延斯·凯特格 , 西尔维亚·莫塔·德·奥利维拉 , 马可·施密特 , 索拉亚·塞拉 , 埃里克·斯梅茨 , 罗格斯A.沃斯 , 克劳斯·威兰德 :
植物区系表型本体（FLOPO）：整合维管植物形态特征和表型的工具。 65:1-65:11 卡林·弗斯波尔 , 安妮卡·奥利希 , 奈杰尔·科利尔 , 都铎·格罗扎 , 菲利普·罗卡·塞拉 , 拉里萨·索尔达托娃 , 米歇尔·杜蒙蒂尔 , 尼甘·沙阿 :
第二届生物个体学和表型联合研讨会的主题问题。 66:1-66:4 马西耶·里宾斯基 , 何塞·弗朗西斯科·阿尔达纳·蒙特斯 :
tESA：计算语义相关性的分布度量。 67:1-67:14
