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生物医学语义学杂志，第4卷

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2013年第4卷

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斯蒂芬·T·吴,维诺德·卡加尔,德米特里·德利加赫,詹姆斯·马桑兹,裴J.Chen,李·贝克尔,温迪·韦伯·查普曼,格尔加纳·萨沃娃,刘洪芳,克里斯托弗·G·丘特:
临床自然语言处理的通用类型系统。 1
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米凯尔·埃加尼亚·阿兰古伦,杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯,埃里克·安塔扎纳,克里斯·蒙格尔,亚历杭德罗·罗德里格斯-冈萨雷斯,马克·威尔金森:
OPPL-Galaxy，一个用于增强本体开发的Galaxy工具，作为生物信息学工作流的一部分。 2
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卡维什瓦·瓦格利卡尔,Manabu Torii公司,悉达多·乔纳拉加达,刘洪芳:
汇集注释语料库以提取临床概念。三
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托·约翰米凯尔·卡尔松,奥斯瓦尔多·特雷尔斯:
MAPI：分布式生物医学应用程序的软件框架。 4
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  - 期刊/biomedsem/BoyceHHWSLRL13
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理查德·博伊斯,约翰·霍恩,奥基·哈桑扎德,安妮塔·德瓦德,乔迪·施耐德,乔安娜·卢西亚诺,马吉德·拉斯特加尔·莫哈拉德,玛丽亚·利亚卡塔:
动态增强药品标签以支持药物安全性、疗效和有效性。 5
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第三届DBCLS生物黑客马拉松：利用语义Web技术改进生命科学数据集成。 6
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乔治奥斯·科托纳齐奥斯,Ioannis Korkontzelos公司,巴拉克里希纳·科卢鲁,保罗·汤普森,索菲亚·阿纳尼亚杜:
将U-Compare工作流部署和共享为web服务。 7
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山本雅素,山口敦子,Akinori Yonezawa公司:
构建链接开放数据，将生物医学科学文献与DBpedia集成。 8
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亚历山大·里亚扎诺夫,阿尔乔姆·克莱恩,阿拉什·沙班·内贾德,格雷戈里·罗斯,阿兰·福斯特,大卫·巴克利奇,克里斯托弗·J·O·贝克:
临床智能关系数据的语义查询：一种基于语义web服务的方法。 9
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帕特里克·兰布里克斯,瓦伦蒂娜·伊万诺娃:
调试的统一方法是网络分类法中的结构和映射。 10
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蒋国谦,哈罗德·索尔布里格,克里斯托弗·G·丘特:
使用语义Web技术支持icd-11文本定义创作。 11
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玛丽亚·佩雷斯·加泰隆,拉斐尔·贝兰加·拉沃里,伊斯梅尔·桑兹,玛丽亚·何塞·阿拉姆布鲁:
BioUSeR：基于语义的工具，用于检索由文本丰富的用户需求驱动的生命科学网络资源。 12
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卡里萨·帕克,苏珊·M·贝洛,辛西娅·史密斯,胡志良,戴安·蒙森梅尔,拉杰尼·尼甘姆,詹妮弗·史密斯,玛丽·下山,贾南·T·埃皮格,詹姆斯·里西:
脊椎动物特征本体：用于注释跨物种特征数据的受控词汇。 13
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赛义德·哈桑普尔,马丁·奥康纳,阿马尔·达斯:
从科学出版物中提取概念定义的基于语义的方法：自闭症表型领域的评估。 14
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特里·F·哈亚米祖,迈克尔·N·威克斯,邓肯·戴维森,阿尔伯特汉堡,马丁·林沃尔德,理查德·巴尔多克:
小鼠发育解剖学EMAP/EMAPA本体：2013年更新。 15
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黄檀,埃尔维拉·米特拉卡,Vicky Dritsou女士,伊曼纽尔·戴利纳斯,克里斯托斯·路易斯:
IDOMAL：重新审视疟疾本体论。 16
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奥利维尔·达梅隆,保罗·贝萨那,乌萨马·泽克里,安娜贝尔·伯德,安妮塔·布尔根,马克·库贾:
临床试验合格标准的OWL模型与部分已知信息兼容。 17
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保罗·N·斯科菲尔德,约翰·P·桑德伯格,贝斯·桑德伯格,科林·麦凯利,乔治奥斯·格库托斯:
小鼠病理本体论；结构和应用。 18
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迪特里希·雷霍尔兹·舒曼,塞内·卡夫卡斯,Jee-Hyub Kim先生,安东尼奥·吉梅诺·耶佩斯,伊恩列文:
监控命名实体识别：排行榜。 19
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保拉·隆卡利亚,玛丽安·E·马顿,大卫·P·希尔,塔尼亚·贝拉迪尼,丽贝卡·福勒,法希姆·T·伊玛目,哈罗德·德拉布金,克里斯托弗·蒙格尔,简·洛马克斯:
基因本体（GO）细胞成分本体：与SAO（亚细胞解剖本体）和其他最新发展的集成。 20
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卡蒂亚·马查多,安娜·T·弗里塔斯,弗朗西斯科·库托:
富集分析在疾病预后中的应用。 21
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伯纳德·博诺,皮埃尔·格雷农,理查德·巴尔多克,彼得·亨特:
多尺度生理学中的功能组织单元及其主要组织基序。 22
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马蒂亚斯·布罗赫豪森,马丁·弗兰森,尼丁·卡纳斯卡,米凯尔·埃里克森,罗克萨娜·梅里诺·马丁内斯,罗杰·霍尔,洛雷娜·诺林,萨内拉·凯尔奎斯特,玛丽亚·霍特伦德,乌米特·托帕洛格鲁,威廉·霍根,1月-埃里克·利顿:
为生物银行管理领域开发语义丰富的本体。 23
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克里斯蒂安·克努普费尔,克莱门斯·贝克斯坦:
动态模型在系统生物学中的作用：将结构与行为联系起来。 24
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乔治·费伦,Ludger Jansen公司,乌尔夫·莱瑟,安德烈亚斯·库尔茨:
使用本体论来研究细胞迁移。 25
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詹妮弗·史密斯,卡里萨·帕克,拉杰尼·尼甘姆,Stanley J.F.Laulederkind先生,G.托马斯·海曼,王树仁,蒂莫西·劳里,维多利亚·佩特里,杰夫·德·庞斯,马雷克·图塔吉,刘伟松,伊丽莎白·A·沃特,玛丽·下山,梅琳达·德温内尔:
临床测量、测量方法和实验条件本体：扩展、改进和新应用。 26
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Irena Spasic公司,罗伯特·马克·格林伍德,阿伦·D·普雷塞,尼克·弗朗西斯,格林·埃尔文:
FlexiTerm：一种灵活的术语识别方法。 27
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迪特里希·雷霍尔兹·舒曼,塞内·卡夫卡斯,Jee-Hyub Kim先生,陈丽,安东尼奥·吉梅诺·耶佩斯,罗伯特·霍恩多夫,罗尔夫·巴科芬,伊恩列文:
根据基因/蛋白质标记解决方案和词汇资源评估金标准语料库。 28
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安妮卡·奥利希,克里斯托夫·格拉布米勒,迪特里希·雷霍尔兹·舒曼:
自动转换前合成表型到后合成表型：EQ型HPO和MP。 29
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大卫·奥苏米·苏特兰,史蒂文·马里戈尔德（Steven J.Marygold）,吉莉安·米尔本,彼得·麦克奎尔顿,劳拉·庞廷,雷蒙·斯特凡西克,凯瑟琳·福尔斯,尼古拉斯·H·布朗,乔治奥斯·格库托斯:
果蝇表型本体。 30
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埃里克·塞格德尔,维吉利奥·蓬弗雷达,克里斯蒂娜·詹姆斯·佐恩,凯文·伯恩斯,约书亚·D·福特里德,瓦西拉·达杜尔,彼得·维泽,亚伦·M·佐恩:
增强的XAO：爪蟾解剖和发育的本体支持对基因表达和Xenbase查询进行更准确的注释。 31
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玛尔塔·科斯塔,岁的芮夫,加里·格鲁布林,大卫·奥苏米·苏特兰:
果蝇解剖本体论。 32
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张玉吉（Yuji Zhang）,崔涛,何永群,普拉迪普·坎贾马拉,刘洪芳:
基于网络的疫苗相关关联分析揭示了与疫苗本体论一致的知识。 33
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彼得·米德福德,托马斯·德切奇,詹姆斯·巴尔霍夫,瓦西拉·达杜尔,尼扎尔·伊伯拉希姆,希尔马尔·拉普,约翰·伦德伯格,保拉·马比,保罗·塞雷诺,蒙特·韦斯特菲尔德,托德·J·Vision,大卫·C·布莱克本:
脊椎动物分类本体：一个跨模式生物和物种表型进行推理的框架。 34
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迈克尔·甘德尔,额尔凡·尤尼斯,阿舒托什·马霍特拉,王佳丽,李慧（音）,张碧君,伯纳德·博诺,海因茨·特奥多尔·梅维森,马丁·霍夫曼-阿皮提乌斯:
HuPSON：人类生理学模拟本体论。 35
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拉杰尼·尼甘姆,戴安·蒙森梅尔,伊丽莎白·A·沃特,梅琳达·德温内尔,玛丽·下山,霍华德·J·雅各布:
大鼠菌株本体：结构化受控词汇表，旨在促进RGD菌株数据的访问。 36
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保罗·西卡雷塞,Stian Soiland眼睛,哈立德·贝哈杰姆,阿拉斯代尔·J·G·格雷,卡罗尔·高布尔,提姆-克拉克:
PAV本体：起源、创作和版本控制。 37
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凯文·利文斯顿,迈克尔·巴达,劳伦斯·亨特,卡琳·维斯普尔:
表示语义Web的注释组成和起源。 38
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木下清子F.青木,杰文·博勒曼,马修·P·坎贝尔,新川野,金东金（Jin-Dong Kim）,托马斯·吕特克,Masaaki Matsubara公司,大田修二郎,勒内·兰辛格,Hiromichi Sawaki先生,Toshihide Shikanai公司,大辅新町,铃木吉诺里,菲利普·图卡赫,Issaku Yamada公司,尼科尔·帕克,Narimatsu先生:
将糖组学数据引入语义网。 39
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艾丽卡·马科斯,Bin Zhao（赵斌）,何永群:
疫苗不良事件本体论（OVAE）及其在表示和分析与美国许可人类疫苗相关的不良事件中的应用。 40
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丹尼尔·库克,麦克斯韦尔·刘易斯·尼尔,弗雷德·布克斯坦,约翰·根纳里:
生物学物理本体：表示物理依赖性，作为生物过程的基础。 41
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马克·延森,亚历山大·考克斯,纳维德·乔杜里,马库斯·吴,多纳特·苏尔,威廉·邓肯,帕特里克·雷,比安卡·温斯托克·格特曼,巴瑞·史密斯,阿兰·拉特伯格,金加·西盖蒂,亚历山大·迪尔:
神经疾病本体论。 42
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Luigi Buttigieg码头,诺曼·莫里森,巴瑞·史密斯,克里斯托弗·蒙格尔,苏珊娜·刘易斯:
环境本体论：将生物和生物医学实体联系起来。 43
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乔什·汉纳,埃里克·约瑟夫,马蒂亚斯·布罗赫豪森,威廉·霍根:
基于RxNorm和其他来源构建药物本体。 44

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