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生物数据挖掘，第5卷

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2012年第5卷

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西奥多罗斯·G·索尔达托斯,塞恩·奥多诺休,文卡塔·萨塔戈帕姆,阿德里亚诺·巴博萨·席尔瓦,乔治奥斯·帕夫洛普洛斯,安娜·卡罗莱纳·旺德利-诺奎拉,尼娜·达莫塔·索雷斯·卡瓦尔坎蒂,莱因哈德·施耐德:
凯皮里尼：使用基因集对文献进行排名。 1
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约翰内斯·图伊卡拉,海蒂·瓦哈马,佩卡·萨梅拉,Olli Nevalainen公司,特罗·艾托卡利奥:
一种用于可视化物理和遗传交互网络的多级布局算法，重点是其模块化组织。 2
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戴红英,马杜苏丹·班达里,玛拉·贝克尔,J.史蒂文·利德,罗杰·盖迪克,艾莉森·莫辛格·雷夫（Alison A.Motsinger-Reif）:
在选择目标基因的最佳数量时，对多因素降维模型的P值进行全局测试。三
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姜贵,托尔·托斯特森,马克·E·博苏克:
基因组研究的加权多重测试程序。 4
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莎拉·彭德格拉斯,斯科特·杜德克,达纳·C·克劳福德,玛丽琳·里奇:
使用PheWAS-View可视化集成和探索高通量的Phenome-Wide关联研究（PheWAS）结果。 5
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余小青,基肖尔·古达,约瑟夫·威利斯,玛蒂娜·维格尔,王正和,桑福德-马科维茨,马克·D·亚当斯,孙淑英:
校准程序如何对不同质量和来自重复区域的测序数据执行？ 6
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洛伦斯·布洛,朱利奥·博利瓦尔,乔纳斯·鲁赫,尤里·布里尔,莱因哈德·赫尔:
“MicroRNA靶标”是一种新的AthaMap网络工具，用于全基因组鉴定拟南芥中的miRNA靶标。 7
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李丽,杨果（Yang Guo）,吴文武,友谊石,建诚（Jian Cheng）,石恒涛:
通过量化基因表达数据的双聚类优度，对五种双聚类算法进行比较和评估。 8
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诺拉·金,彼得·安德鲁斯,Folkert W.Asselbergs公司,H.罗伯特·弗罗斯特,斯科特·威廉姆斯,布伦特·哈里斯,辛西娅·里德,凯萨琳·D·阿斯克兰,杰森·H·摩尔:
两项散发性ALS全基因组研究中成对遗传关联的基因本体分析。 9
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劳尔·克鲁斯·卡诺,李美玲,梁明英:
用于识别分子序列中功能位点的逻辑最小化和规则提取。 10
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萨米赫·马格德尔丁,Yutaka Yoshida公司,李惠平,吉隆美田,横山文辅,夏玛·埃纳尼,张颖（音）,徐波,藤中英彦,Eishin Yaoita公司,Sei Sasaki先生,山本忠志:
小鼠结肠蛋白质组和蛋白质通路的特征。 11
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尼古拉·图伦,叶夫根尼·S·提斯,弗拉基米尔·伊万尼森科,尼古拉·尤丁,埃琳娜·伊格纳蒂耶娃,达米安·瓦卢尔,雪佛兰A.Degrelle,伊莎贝尔·休:
在非模式物种中寻找生物标记物：牛胚胎发育相关转录因子的文献挖掘。 12
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维达·阿贝迪,拉明·赞德,穆罕默德酵母素,费兹尔·费萨尔:
使用文献生成假设的自动框架。 13
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米格尔·安德拉德·纳瓦罗,加雷思·帕利德沃,Carolina Perez Iratxeta公司:
Peer2ref：一个使用作者消歧的同行评审查找网络工具。 14
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Ryan J.Urbanowicz,杰夫·基里利斯,乔纳森·费希尔,杰森·H·摩尔:
预测纯、严格、上位模型的难度：模拟模型选择的度量。 15
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Ryan J.Urbanowicz,杰夫·基里利斯,尼古拉斯·A·辛诺特·阿姆斯特朗,塔姆拉·希伯林,乔纳森·费希尔,杰森·H·摩尔:
GAMETES：一种快速、直接的算法，用于生成具有随机结构的纯、严格、上位模型。 16
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佐藤俊一:
人类microRNA靶组的分子网络分析：从癌症到阿尔茨海默病。 17
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亨利·沃思,马丁·冯·伯根,汉斯·宾德尔:
挖掘SOM表达肖像：特征选择和集成分子功能的概念。 18
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伊格纳西奥·冈萨雷斯,金安·莱曹,梅丽莎·戴维斯,塞巴斯蒂安·德让:
可视化配对“组学”数据集之间的关联。 19
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马修·斯托克斯,希亚姆·维斯瓦兰:
应用空间加权Relief算法对疾病的遗传预测因子进行排序。 20
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乍得·C·布朗,塔米·哈夫纳,玛丽莎·王·麦地那,罗纳德·克劳斯,霍华德·麦克劳德,艾莉森·莫辛格·雷夫（Alison A.Motsinger-Reif）:
剂量-反应全基因组关联研究中关联映射的多变量方法和软件。 21

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