XSEDE 2016:美国佛罗里达州迈阿密
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2016年7月17日至21日,美国迈阿密,XSEDE16多样性、大数据和大规模科学会议记录。 ACM公司 2016 ,国际标准图书编号 978-1-4503-4755-6
加速学术研究中的发现
马库斯·斯拉文纳斯 , 保罗·罗德里格斯 , 艾伦·B·克雷格 , 伊丽莎白·沃尔费尔 , 杰弗里·威尔 以下为:
农场安全管理局的图像分析和数据挖掘基础设施支持:战争信息摄影收集办公室。 1:1-1:6 Kiumars Soltani公司 , 艾曼·索利曼 , 阿南德·帕德马纳班 , 王绍文 以下为:
城市流:整合社交媒体和权威土地利用图的大尺度框架。 2:1-2:8 艾哈迈特·阿尔图·伊尔迪林 , 大卫·塔博顿 , 刘燕(Yan Liu) , 纳兹穆斯·沙姆斯·萨齐卜 , 王绍文 以下为:
加速TauDEM从国家级高分辨率地形数据集中提取水文信息:扩展摘要。 3:1-3:2 巴里·I·施耐德 , 克劳斯·巴塞特 , 关晓旭 以下为:
使用短迭代Lanczos方法和有限元离散变量表示的偏微分方程的时间传播:使用Intel Phi协处理器的实验:扩展摘要。 4:1-4:4 罗伯特·辛科维茨 , 迈克尔·杜达 以下为:
MPAS大气天气和气候代码的优化和并行负载平衡。 5:1-5:6 尹俊奇 , 托马斯·安东尼 , 乔恩·马斯特兰德 , 刘玉良 , 查德·伯迪肖 , 米切尔·霍顿 , 朗尼·D·克罗斯比 , R.格伦·布鲁克 , 弗兰克·斯基德摩尔 以下为:
AFNI中非线性图像配准的优化。 6:1-6:6 温迪·谭秋(Wendy K.Tam Cho) , Yan Y.Liu(刘燕) 以下为:
因果推理模型中子集选择的并行进化算法。 7:1-7:8 唐·刘(Don Liu) , 郑永来 , 雅登·摩尔 以下为:
用谱元法对流体流动和传热进行三维模拟。 8:1-8:9 刘慧(音) , 张鹏(音译) , 王坤(Kun Wang) , 柏杨 , 陈章欣 以下为:
三种超级计算机体系结构上并行油藏模拟的性能和可扩展性分析。 9:1-9:8 埃里克·库尔特 , 杰里米·费舍尔 , 芭芭拉·哈洛克 , 理查德·克内珀 , 克雷格·A·斯图尔特 以下为:
简单XSEDE-Like集群的实现:科学支持和经验教训。 10:1-10:8 Kornelijus Survila公司 , 艾哈迈特·阿尔图·伊尔迪林 , Ting Li(李婷) , Yan Y.Liu(刘燕) , 大卫·G·塔博顿 , 王绍文 以下为:
一种用于水文信息分析的可扩展高性能地形流向算法。 11:1-11:7 杰勒德·凡卢 , Chung Ng公司 , 基森·奥斯本 , 桂王 , 本·拉姆西 , 叫王大力 , 《致荣宝》 以下为:
使用高性能计算模拟细胞胚胎发生。 12:1-12:4 泰勒·麦克丹尼尔 , 爱德华多·达泽维多 , 李英伟 , 保罗·R·C·肯特 , 王明(Ming Wong) , 桂王 以下为:
GPU上量子蒙特卡罗模拟的延迟更新算法:扩展抽象。 13:1-13:4 大卫·M·罗杰斯 以下为:
标准张量线性代数的有效基元。 14:1-14:7 丹尼尔·雅各布·特沃德 , 安东尼·科拉斯尼 , 切尔西S.Sicat , 蒂莫西·布朗 , 迈克尔·米勒 以下为:
通过计算解剖网关中的GPU加速,可以使用工具研究神经解剖学的种群和时间序列。 15:1-15:7 罗伯特·卡马乔·巴兰科 , 帕特里夏·J·泰勒 , 迈克尔·格恩特 以下为:
最大限度地减少Xeon Phi内核的使用,对执行时间的影响可以忽略。 16:1-16:8 Noushin Ghaffari公司 , 乔迪·阿班特 , 拉明德·辛格 , 菲利普·D·血液 , 查尔斯·约翰逊 以下为:
转录组组装及其评估中的计算注意事项,使用高质量人类RNA-Seq数据。 17:1至17:4 大卫·L·哈特 , 梅丽莎·里舍尔 , 道格·尼奇卡 以下为:
评估HPC系统影响的用户调查准确性。 18:1-18:7 埃斯特拉·加拉多 , 帕特里夏·J·泰勒 , 阿图罗·阿尔盖塔 , 詹姆·杰洛马 以下为:
交叉加速器性能分析。 19:1-19:8 斯科特·麦克拉里 , 罗伯特·亨舍尔 , 阿比纳夫·托塔 , 霍尔格·布伦斯特 , 本杰明·德雷珀 以下为:
改进电荷检测质谱工作流程的可扩展性。 20:1-20:8 泰森·李·斯威特南 , J.D.制粒机 , 克雷格·拉斯穆森 , N.R.卡拉汉 , Nirav C.商户 , 埃里克莱昂斯 , Mats Rynge公司 , 刘燕(Yan Liu) , 维斯瓦纳特·南迪加姆 , 克里斯托弗·克罗斯比 以下为:
利用当代分布式计算和数据管理方法将GIS分析任务从桌面扩展到云:基于项目的学习和网络基础设施概念的案例研究。 21:1-21:6
技术
克雷格·A·斯图尔特 , 大卫·Y·汉考克 , 马修·沃恩 , 杰里米·费舍尔 , 考克里尔 , 李黎明 , Nirav C.商户 , 特蕾丝·米勒 , 约翰·迈克尔·洛 , 丹尼尔·斯坦齐奥内(Daniel C.Stanzione Jr.)。 , 詹姆斯·泰勒 , 埃德温·斯基德莫尔 以下为:
Jetstream:性能、早期经验和早期结果。 22:1-22:8 马希达尔·塔蒂尼尼 , 小一路 , 董菊彩 , 阿米塔瓦·马朱姆达尔 , Dhabaleswar K.熊猫 以下为:
在SDSC Comet上运行RDMA Hadoop和Spark的经验和好处。 23:1-23:5 里克瓦格纳 , 菲利普·帕帕佐普洛斯 , 德米特里·米申 , 特雷弗·库珀 , 马希达尔·塔蒂尼尼 , 格雷戈·冯·拉舍夫斯基 , 王福刚 , 杰弗里·福克斯 以下为:
Comet中的用户管理虚拟群集。 24:1-24:8 斯宾塞·朱利安 , 迈克尔·舒伊 , 塞斯库克 以下为:
研究中的容器:轻量级基础设施的初步经验。 25:1-25:6 塔比莎·K·塞缪尔 , 约翰·朗 , 加里·罗杰斯 以下为:
NICS中CILogon的实施概述。 26分26秒5 凯尔·查德 , 史蒂文·图尔克 , 伊恩·福斯特 以下为:
Globus:最近的增强功能和未来计划。 27:1-27:8 崔慧秋 , 内森·刘易斯 , 迪帕克·库马尔·辛格 , Arghya Kusum Das公司 , 穆罕默德·贾拉扎伊 , 理查德·普拉塔尼亚 , 萨扬·戈斯瓦米 , 李基松(Kisung Lee) , Seung-Jong公园 以下为:
BIC-LSU:大数据研究与LSU网络基础设施的集成。 28:1-28:8 维克托·哈兹伍德 , 凯西·本宁格 , 格雷戈里·彼得森 , 杰森·查卡拉 , 本尼·斯帕克斯 , 杰西·汉利 , 安德鲁·亚当斯 , 布莱恩学习 , 罗伯特·巴登 , 德里克·西梅尔 , 约瑟夫·拉帕 , 贾里德·亚诺维奇 以下为:
通过端到端SDN(DANCES)开发具有网络功能的应用程序。 29:1-29:7 鲁本·D·布迪亚贾 , 卡皮尔·阿格拉瓦尔 , 马克·R·法伊 , 罗伯特·麦克雷 , 道格詹姆斯 以下为:
使用XALT进行库函数跟踪。 30:1-30:7 黄瑞珠 , 徐伟佳 , 罗伯特·麦克雷 以下为:
XALT日志数据分析的web界面。 31:1-31:8 尼古拉·西蒙科夫 , 罗伯特·德利昂 , 约瑟夫·怀特 , 托马斯·富兰尼 , 马丁斯·因纳斯 , 史蒂文·M·加洛 , 马修·D·琼斯 , 阿巴尼·K·帕特拉 , 本杰明·普莱辛格 , 珍妮特·斯佩尔哈克 , 托马斯·耶尔克 , 瑞恩·拉瑟姆 , 杰弗里·帕尔默 以下为:
使用XDMoD应用程序内核定量分析HPC集群上的节点共享。 32:1-32:8
软件和软件环境
斯姆鲁蒂·帕迪 , 杰伊·阿拉梅达 , 罗布·科珀 , 刘瑞(Rui Liu) , Sandeep Puthanveetil Satheesan公司 , 伊娜·扎尔尼茨基 , 格雷戈里·詹森 , 迈克尔·迪特兹 , 库马尔 , 李钟燮 , 理查德·马西亚诺 , 路易吉·马里尼 , 芭芭拉·明斯克 , 克里斯·纳瓦罗 , 马库斯·斯拉维纳斯 , 威廉·C·沙利文 , 肯顿·麦克亨利 以下为:
将Brown Dog服务大规模自动部署到各种计算基础设施中的体系结构。 33:1-33:8 卡梅隆·W·史密斯 , 布莱恩·格兰佐 , 丹·伊巴内兹 , 翁卡·萨尼 , 肯尼思·詹森 , 马克·谢泼德 以下为:
并行自适应非结构化网格工作流现有软件组件的内存集成。 34:1-34:6 阿瑟·韦策尔 , 詹妮弗·巴卡尔 , 马库斯·迪特里奇 以下为:
用于多维数据集按需处理的虚拟文件系统。 35:1-35:5 弗朗西斯科·卡斯特洪 , 安东尼奥·戈梅斯·伊格莱西亚斯 , 安东尼奥·洛佩斯·弗拉瓜斯 以下为:
3D融合设备的优化。 36:1-36:7 努万·古纳塞卡拉 , 安德鲁·罗尼 , 詹姆斯·泰勒 , 埃尼斯·阿夫根 以下为:
CloudBridge:一个简单的跨云Python库。 37:1-37:8 德鲁·施密特 , 陈伟晨 , 乔治·奥斯特鲁乔夫 以下为:
使用R语言引入新的大数据分析客户端/服务器框架。 38:1-38:9 郝虎 , 星辰红 , 杰夫·特斯特里普 , Yan Y.Liu(刘燕) , 迈克尔·芬恩 , 乔纳森·拉什 , 杰弗里·温德尔 , 王绍文 以下为:
TopoLens:建立CyberGIS社区数据服务,以提高高分辨率国家地形数据集的可用性。 39:1-39:8 苏普恩·纳坎达拉 , 苏哈卡尔·帕米迪甘塔姆 , 沙梅拉·尤达吉 , 尼普恩·多西 , 埃罗马·阿贝辛格 , Chathuri Peli Kankanamalage公司 , 苏雷什·马鲁 , 马龙·E·皮尔斯 以下为:
SEAGrid科学门户的剖析。 40:1-40:8 克里斯托弗·汤普森 , 史蒂文·克拉克 , 卡罗尔·X·宋 以下为:
XSEDE BLAST网关:为XSEDE社区利用校园开发。 41:1-41:8 罗汉·加格 , 曹家军 , 卡皮尔·阿里亚 , 吉恩·库珀曼 , 杰罗姆·维纳 以下为:
扩展批处理会话和三阶段调试:使用DMTCP增强批处理环境。 42:1-42:8 大卫·E·哈达克 , 道格拉斯·约翰逊 , 杰里米·尼克拉斯 , 埃里克·弗兰兹 , 布莱恩·麦克迈克尔 , 巴兹尔·戈哈尔 以下为:
开放式随需应变:通过全学科软件网络基础设施转变计算科学。 43:1-43:7 纳文·苏尔塔纳 , 亚历山大·卡尔弗特 , 杰弗里·奥弗贝 , 盖伦·韦斯利·阿诺德 以下为:
从OpenACC到OpenMP 4:走向自动翻译。 44:1-44:8 阿米塔瓦·马朱姆达尔 , 苏巴希尼·西瓦格纳姆 , Kenneth Yoshimoto先生 , 特德·卡内维尔 以下为:
了解神经科学社区不断发展的网络基础设施需求。 45:1-45:7 马克·A·米勒 , 特丽·施瓦茨 , 韦恩·菲佛 以下为:
高度访问科学网关的用户行为和使用模式。 46:1-46:8 沃尔特·斯卡伯勒 , 卡莉·阿诺德 , 梅塔尔·达汉 以下为:
案例研究:XSEDE用户门户API的微服务演化和软件生命周期。 47:1-47:5 Amit Chourasia公司 , 蒙娜·旺·巴努姆 , 德米特里·米申 , 大卫·R·纳多 , 迈克尔·L·诺曼 以下为:
SeedMe:一个科学数据共享和协作平台。 48:1-48:6 安东尼奥·戈梅斯·伊格莱西亚斯 , 卡洛斯·罗萨莱斯 , 塔德·伊万斯 以下为:
HPC应用程序资源利用率的实际监测。 49:1-49:8 科克·F·基 , 莫娜·斯莱曼 , 米歇尔·威廉姆斯 , 多米尼克·斯图尔特 以下为:
推动电子科学中计算工具采用和传播的10个属性。 50:1-50:8
劳动力发展和多元化
里图·阿罗拉 , 苏克里特·桑迪 以下为:
让学生参与研发的敏捷方法。 51:1-51:4 里卡多·冈萨雷斯-门德斯 , 吉米·托雷斯 , 帕拉维·伊斯瓦德 , 小休·B·尼古拉斯。 , 亚历山大·罗普列夫斯基 以下为:
在少数民族院校协助生物信息学项目:需求评估和经验教训——看实习项目。 52:1-52:8 桂王 , 格雷戈里·彼得森 以下为:
计算科学本科生研究体验计划的挑战和成就。 53:1-53:5 塞米尔·萨拉利奇 , 内兰詹·埃迪里辛格(Neranjan Edirisinghe) , 尤里·卢基诺夫 , 迈克尔·沃尔特斯 , 布罗克·戴维斯 , 格雷戈里·法鲁 以下为:
猎户座:HPC研究的发现环境和连接XSEDE资源。 54:1-54:5 琳达·阿克利 , 杰伊·阿拉梅达 , 史蒂文·戈登 , 马塞拉·马德里 , 洛娜·里维拉 以下为:
XSEDE培训:实现访问和包容。 55:1-55:6 鲁比·门登霍尔 , 妮可·布朗 , 迈克尔·布莱克 , 马克·范·莫尔 , Ismini Lourentzou公司 , 凯伦·弗林 , 马拉卡·麦基 , 阿萨塔·泽莱 以下为:
拯救失落的历史:利用大数据恢复黑人女性的生活经历。 56:1-56:6 亨利·内曼 , 亚伦·伯格斯特罗姆 , 达娜·布伦森 , 卡莉·加诺特 , 赞恩·格雷 , 布莱恩·吉尔福斯 , 罗伯特·卡莱斯基 , 埃文·莱姆利 , 布莱恩·穆尔 , 赛库马尔·拉马杜古 , 阿拉娜·罗曼内拉 , 乔纳森·拉什 , 安德鲁·谢尔曼 , 布莱恩·斯坦格尔 , 丹·沃斯 以下为:
高级网络基础设施研究和教育促进者虚拟驻留:迈向国家网络基础设施劳动力。 57:1-57:8
可视化展示
Amit Chourasia公司 , 麦琪·艾弗里 , 阿什利·威利斯 , 萨姆·格林伍德 , 克里斯托弗·戴维斯 , 凯瑟琳·康斯特布尔 , 大卫·古宾斯 以下为:
地球发电机仿真可视化。 58:1-58:3 安妮·M·布朗 , 尼古拉斯·F·波利斯 , 大卫·R·贝文 , 阿亚特·穆罕默德 以下为:
阿尔茨海默病透视:肽-膜相互作用的分子动力学(MD)模拟。 59:1-59:3