XSEDE 2014：美国佐治亚州亚特兰大
斯科特·拉思罗普 , 杰伊·阿拉梅达 :
极端科学与工程发现环境年会，XSEDE’14，美国佐治亚州亚特兰大，2014年7月13日至18日。 ACM公司 2014 ，国际标准图书编号 978-1-4503-2893-7
加速学术研究中的发现
阿比拉什·查巴拉拉 , 克拉拉·诺沃亚 , 阿潘·卡西姆 :
具有GPU加速的二次指派问题的SIMD解。 1:1-1:8 约瑟夫·保罗·科恩 
, 亨利·Z·罗 :
学术激流：社区维护的分布式存储库。 2:1-2:2 林美凤 , 青木靖国 , 托马斯·布鲁姆 , 伊祖布吉Taku Izubuchi , Chulwoo Jung公司 , Shigemi Ohta公司 , Eigo Shintani公司 , 山崎武史 , 佐佐木昭一 :
利用Gordon上的All-Mode-Averaging加速从头算核子结构计算。 3:1-3:2 严敬文 , 张慧（音） , 雷杜 , 埃里克·沃纳特 , 安德鲁·赛金 , 李深 :
加速大型脑成像遗传学数据的稀疏典型相关分析。 4:1-4:7 叶凡 , 刘燕（Yan Liu） , 王绍文 , 大卫·塔博顿 , 艾哈迈特·阿尔图·伊尔迪林 , 南希·威尔金森-迪尔 :
将TauDEM加速为XSEDE上的可扩展水文地形分析服务。 5分5秒2秒 杰弗里·S·杨 , M.格雷厄姆·洛佩兹 , 米切尔·霍顿 , 理查德·格拉斯布鲁克 , 杰弗里·维特 :
高级应用程序支持，可提高Keeneland上的GPU利用率。 6点1-6分 郑寅 , 李福海 , 斯蒂芬·T·C·王 :
基于高含量双RNAi筛选的扰动数据识别和预测遗传交互作用的集成分析管道。 7:1-7:2 苏克里特·桑迪 , 丽图·阿罗拉 :
将电子发现的经验教训应用于使用HPC处理大数据。 8:1-8:2 M.格雷厄姆·洛佩兹 , 米切尔·霍顿 , 周爱德蒙德（Edmond Chow） :
多核和GPU体系结构上的大尺度流体动力学布朗模拟。 9:1-9:2 斯科特·布恩 , 萨拉瓦南·阿鲁纳查拉姆 :
使用CMAQ-DDM/PM计算美国大陆个别机场排放的敏感系数。 10:1-10:8 达瓦尔·布亚里 , 杨振康（P.K.Yeung） :
大规模湍流中粒子跟踪的挑战。 11:1-11:2 阿德希拉吉·达斯古普塔 , 萨默什·罗伊 , 丹尼尔·哈沃斯 :
层流和湍流烟灰火焰的详细计算模型。 12:1-12:7 卡洛斯·罗萨莱斯 , 罗伯特·麦克雷 :
ECSS经验：粒子追踪改造。 13:1-13:2 杰夫·A·特蕾西 , 詹姆斯·谢泼德 , 格伦·洛克伍德 , 阿米特·乔拉西亚 , 马希达尔·塔蒂内尼 , 罗伯特·费希尔 , 罗伯特·辛科维茨 :
基于三维运动的高效核密度估计器及其在野生动物生态学中的应用。 14:1-14:8 荣荣 , 姜浩 , 廖子韶 :
XSEDE大规模并行系统上极简仿真器的性能研究。 15:1-15:8 罗伯特·辛科维茨 , 陶峰 , 毛烨 :
用于构建金融市场纳秒级快照的快速、低内存算法。 16:1-16:5 蔡朵拉 , 贝蒂娜·卡桑德拉·里德尔 , 拉宾德拉·罗比·拉坦 , 沈翠华 , 阿诺德·匹克特 :
FeatureSelector：一个支持XSEDE的工具，用于大规模游戏日志分析。 17:1-17:7 杜尔玛·努加韦拉 , 史蒂文·斯图亚特 , 雅克·雅科夫斯基 :
Xe与富勒烯团簇的高能碰撞。 18:1-18:8 尹俊奇 , 巴努·雷克帕利 , Pragneshkumar B.Patel公司 , 钱达·德伦南 , 安妮特·萨默斯·恩格尔 :
共享存储器结构上的基因组序列分析流水线的工具化研究。 19:1-19:4 菲利普·D·血液 , 肖沙娜·马库斯 , 迈克尔·C·沙茨 :
利用黑光灯对谷物基因组进行大规模测序和组装。 20:1-20:6 弗吉尼亚·库恩 , 迈克尔·西蒙尼 , 路易吉·马里尼 , 戴夫·博克 , 艾伦·B·克雷格 , 莉安娜·迪森德鲁克 , Sandeep Puthanveetil Satheesan公司 :
电影：动态图像的大规模自动分析。 21:1-21:3 尼古拉·波戈列洛夫 , 谢尔盖·博罗维科夫 , 雅各布·赫里克胡森 , 泰金（Tae Kim） , 伊戈尔·克柳科夫 , 加里·赞克 :
MS-FLUKSS及其在日光层部分电离等离子体流动建模中的应用。 22:1-22:8 M.S.Pindzola先生 , Sh.A.Abdel-Naby先生 , 康纳·巴兰斯 :
Ne8+的光电离。 23:1-23:2 王磊（Lei Wang） , 詹姆斯·马祖卡 , 索菲亚·加拉舒克 , 雅切克·雅科夫斯基 :
基于混合量子轨道/电子结构DFTB的分子动力学方法。 24分24秒8秒 王福刚 , 格雷戈·冯·拉舍夫斯基 , 杰弗里·查尔斯·福克斯 , 托马斯·富兰尼 , 罗伯特·德利昂 , 史蒂文·加洛 :
面向大型计算设施的科学影响测量框架——XSEDE案例研究。 25:1-25:8 于庄 , 米歇尔·塞奥托 , 威廉·哈斯 :
复杂分子系统的高效直接半经典分子动力学。 26:1 Kevin R.Shieh先生 , 皮利布·布罗因 , 大卫·李 , 马修·利维 , 亚伦·戈尔登 :
使用SAGA和开放科学网格搜索Aptamers。 27:1-27:4 盖伦·韦斯利·阿诺德 , 马尼沙·加伊贝 , 赛义德·科里奇 , 约翰·厄本 :
XSEDE OpenACC研讨会使Blue Waters研究人员能够加速关键算法。 28:1-28:6 巴努·雷克帕利 , 尤里·彼得森 :
XSEDE支持：革新下一代治疗药物的发现。 29:1
技术（硬件和系统软件）
马克·R·法伊 :
UTK的Cray XC30实现了飞跃。 30:1-30:8分 约瑟夫·怀特 , 罗伯特·德利昂 , 托马斯·富兰尼 , 史蒂文·加洛 , 马修·D·琼斯 , 阿明·加德索希 , 辛西娅·科尼利厄斯 , 阿巴尼·K·帕特拉 , 詹姆斯·布朗 , 威廉·巴思 , 约翰·哈蒙德 :
使用XDMoD/TACC_Stats分析HPC集群上的节点共享。 31:1-31:8 里克·莫尔 , 小保罗·佩尔茨。 :
基准测试基于SSD的Lustre文件系统配置。 32:1-32:2 杰罗姆·维纳 :
HPC群集上MPI库的跨内存连接的优点。 33:1-33:6 小保罗·佩尔茨。 , 特洛伊·贝尔 :
使用Intel®Xeon Phi™协处理器管理中型群集的最佳实践。 34:1-34:8 华伦史密斯 , 沙瓦·斯莫伦 :
为分布式测试平台构建信息系统。 35:1-35:8 小加里·罗杰斯。 , 杰西·汉利 , 里克·莫尔 :
大型Lustre Scratch文件系统上的数据管理实践。 第36:1-36:6页 苏达珊·斯里尼瓦桑 , 维克托·哈兹伍德 , 格雷戈里·彼得森 :
文件传输数据的描述性数据分析。 37:1-37:8 娜塔莎·巴夫洛维基 , 凯文·贝琪 , 赛拉姆·贝赫拉 , 马拉奇·坎贝尔 , 哈卡马尔·瓦利亚 , Jitender S.Deogun公司 :
评估蛋白质引导科学工作流的分布式平台。 38:1-38:8 理查德·李·摩尔 , 柴坦巴鲁 , 黛安·巴克斯特 , 杰弗里·查尔斯·福克斯 , 阿米塔瓦·马朱姆达尔 , 菲利普·帕帕佐普洛斯 , 韦恩·菲佛 , 罗伯特·辛科维茨 , 肖恩·斯特兰德 , 马希达尔·塔蒂内尼 , 理查德·瓦格纳 , 南希·威尔金森-迪尔 , 迈克尔·诺曼 :
探索之门：科学长尾的网络基础设施。 39:1-39:8 卢卡斯·威尔逊 , 约翰·M·方纳 :
Launcher：基于壳的并行参数化研究快速开发框架。 40:1-40:8 Gwang Son公司 , 维克托·哈兹伍德 , 格雷戈里·彼得森 :
关于自动化XSEDE用户票证分类。 41:1-41:7 特洛伊·贝尔 , 道格·约翰逊 :
pbsacct：基于PBS的HPC系统的工作负载分析系统。 42:1-42:6 董菊彩 , 格伦·洛克伍德 , 罗伯特·辛科维茨 , 马希达尔·塔蒂内尼 :
Gordon超级计算机上使用双轨InfiniBand 3D Torus网络的应用程序的性能。 43:1-43:6 尼科利·德莱登 :
PGDB：MPI应用程序的调试器。 44:1-44:7 胡里奥·奥拉亚 , 罗德里戈·A·罗梅罗 :
异构体系结构的运行时管道调度系统。 45:1-45:7 亚历山大·梅里特 , 奈拉·法鲁基 , 马格达莱娜·斯拉维涅斯卡 , 阿达·加夫里洛夫斯卡 , 卡斯滕·施万 , 维沙卡·古普塔 :
切片：提供异构HPC系统。 46:1-46:8 格伦·洛克伍德 , 马希达尔·塔蒂内尼 , 里克瓦格纳 :
SR-IOV：虚拟化互连的性能优势。 47:1-47:7 S.帕特里克·卡尔霍恩 , 戴维·阿金 , 约书亚·亚历山大 , 布雷特·齐默尔曼 , 弗雷德·凯勒 , 布兰登·乔治 , 亨利·内曼 :
俄克拉荷马州PetaStore:小预算大数据的商业模式。 48:1-48:8 亨利·内曼 , 戴维·阿金 , 约书亚·亚历山大 , 达娜·布伦森 , S.帕特里克·卡尔霍恩 , 詹姆斯·迪顿 , 富兰克林·丰卓·福图 , 布兰登·乔治 , Debi Gentis公司 , 赞恩·格雷 , 埃迪·胡布施 , 乔治·路丹 , 马特·卢宁 , 乔尔·斯诺 , 布雷特·齐默尔曼 :
OneOklahoma无摩擦网络：在EPSCoR州建立多机构科学DMZ。 49:1-49:8 飞星 , 海航游 :
Petaflop超级计算机的工作量感知利用优化：使用统计方法的基于证据的评估。 50:1-50:8
软件和软件环境（网关、桥接和应用程序）
丽图·阿罗拉 , 胡里奥·奥拉亚 , 马达夫·古普塔 :
交互式并行化工具。 51:1-51:8 汤姆·布拉特维奇 , 丹尼尔·安德森 :
开放建模界面的可访问并行化。 52:1-52:8 埃姆雷·H·布鲁克斯 :
用于简单快速部署多尺度科学代码的开放可扩展多目标应用程序生成工具。 53:1-53:6 索拉巴·贾因 , 丹尼尔·雅各布·特沃德 , 大卫·S·李 , 安东尼·科拉斯尼 , 蒂莫西·布朗 , J.Tilak Ratnather , 迈克尔·米勒 , 劳伦特·尤恩斯 :
计算解剖网关：利用XSEDE计算资源进行形状分析。 54:1-54:6 里昂·杜利 , 乔·斯塔布斯 :
使用Docker和Agave动态提供便携式网关基础设施。 55:1-55:2 马克·谢泼德 , 卡梅隆·W·史密斯 :
工程创新的HPC模拟工作流。 56:1-56:2 叶凡 , 苏哈卡尔·帕米迪甘塔姆 , 华伦史密斯 :
将工作预测纳入SEAGrid科学网关。 57:1-57:3 吉姆·巴斯尼 , 杰夫·盖诺 , 苏雷什·马鲁 , 马龙·E·皮尔斯 , 蒂亚卡·阿米拉·卡内瓦拉 , 里昂·杜利 , 乔·斯塔布斯 :
将科学网关与XSEDE安全集成：凭证管理方法综述。 58:1-58:2 Choonhan Youn公司 , 维斯瓦纳特·南迪加姆 , 明芬 , 大卫·塔博顿 , 南希·威尔金森-迪尔 , 柴坦巴鲁 , 克里斯托弗·克罗斯比 , 阿南德·帕德马纳班 , 王绍文 :
利用XSEDE HPC资源解决高分辨率地形数据的计算难题。 59:1-59:2 Yannick Hold Geoffroy公司 , 奥利维尔·加格农 , 马克·帕里佐 :
一旦你掏空，就不用掏叉子了。 60:1-60:8 肖恩·科尔曼 , 苏哈卡尔·帕米迪甘塔姆 , 马克·范·莫尔 , 杨旺（Yang Wang） , 拉尔斯·科斯特克 , 道格拉斯·E·斯佩罗 :
虚拟衍射计算的性能改进和工作流程开发。 61:1-61:7 飞星 , 海航游 , 昌大路 :
科学应用的统计性能分析。 62:1-62:8 阮光辰 , 张慧（音） , 埃里克·沃纳特 , 贝斯·普拉尔 :
TextRWeb：在Web上使用R的大型文本分析。 63:1-63:8 塔比莎·K·塞缪尔 , M.Shahbaz Memon先生 , 伯恩德·舒勒 , 沙瓦·斯莫伦 :
XSEDE中的UNICORE：通过开发、集成、部署和其他方式。 64:1-64:8 大卫·L·哈特 , 艾米·舒勒 , 埃斯特·索里亚诺 , 梅塔尔·达汉 , 马修·汉隆 :
XRAS：XSEDE中的分配软件作为服务。 65:1-65:8
教育、外联和培训
麦克·莫里斯 , 卡尔·弗林克尔 :
文科大学环境下并行编程的三步跨学科方法。 66:1-66:7 大卫·图斯 , 杰弗里·索尔卡 :
建模与仿真入门课程。 67:1 拉兹万·卡布内斯库 , 阿迪蒂亚·德瓦拉孔达 , 詹姆斯·德梅尔 , 史蒂文·戈登 , 杰伊·阿拉梅达 , 苏珊·梅林格 :
为并行代码构建签名器。 68:1-68:8 黛安·A·巴克斯特 , 贝斯·西蒙 :
时间线的冲突：从CS教育前线吸取的教训。 69:1-69:5 乌韦·希尔格特 , 谢尔登·麦凯 , 穆罕默德·哈尔凡 , 贾森·威廉姆斯 , 康奈尔·吉班 , 大卫·米克洛斯 :
DNA Subway：进行基因组分析。 70:1-70:3 德克·科尔布里 :
iCER实习生：让本科生参与高性能计算。 71:1-71:5 洛娜·里维拉 , 莉莎娜·德斯蒂法诺 :
整合绩效衡量和项目评估以促进理解。 72:1-72:2 伊万·巴比奇 , 亚伦·威登 , 莫比·卢丁 , 斯凯拉·汤普森 , 查尔斯·佩克 , 克里斯汀·穆特斯帕 , 安德鲁·菲茨·吉本 , 詹妮弗·霍金斯 , 汤姆·墨菲 :
LittleFe和BCCD成功进入HPC。 73:1-73:7 杰里米·费舍尔 , 理查德·克内珀 , 马修·斯坦迪什 , 克雷格·A·斯图尔特 , 雷萨·阿尔沃德 , 大卫·利夫卡 , 芭芭拉·哈洛克 , 维克托·哈兹伍德 :
创建XSEDE兼容集群的方法。 74:1-74:5 罗素·费尔德豪森 , R.斯科特·贝尔 , 丹尼尔·安德森 :
最短时间，最大效果：使用Scratch在CS0和STEM外联活动中引入并行计算。 75:1-75:7 戈瑟姆S。 :
计算科学和工程课程中的修订控制系统（RCS）。 76:1-76:3 芭芭拉·哈洛克 , 理查德·克内珀 , 詹姆斯·弗格森 , 克雷格·A·斯图尔特 :
XSEDE校园桥接试点案例研究。 77:1-77:5
