20.PSB 2015：美国夏威夷科哈拉海岸
俄罗斯·B·奥尔特曼 ， A.基思·邓克 ， 劳伦斯·亨特 ， 泰瑞·E·克莱恩 ， 玛丽琳·里奇 :
2015年生物计算：太平洋研讨会论文集，美国夏威夷科哈拉海岸，2015年1月4日至8日。 2015 达拉·休伊特 ， 米歇尔·惠尔·卡里略 ， 劳伦斯·亨特 ， 俄罗斯·B·奥尔特曼 ， 泰瑞·E·克莱恩 :
向PSB致敬二十周年。 1-7
癌症全景： 癌症高通量“OMICS”数据综合分析的计算方法和基础设施
瑟伦·布鲁纳克 ， 弗朗西斯科·德拉维加 ， 亚当·马戈林 ， 本杰明·拉斐尔 ， Gunnar Rätsch公司 ， 约书亚·M·斯图亚特 :
课程介绍。 8-9 基思·A·钦 ， 王凯（Kai Wang） ， 菅正炎 ， 胡利奥·费尔南德斯 ， 钟文彦（Wenyan Zhong） ， 贾雷克·科斯特罗维奇 ， 陶雪 ， 周朱 ， Jean-François Martin女士 ， 玛丽亚·科勒 ， 金·阿恩特 ， 保罗·雷杰托 :
细胞索引数据库（CELLX）：癌症精确医学的网络工具。 10-19 阿米特·德什瓦尔 ， Shankar Vembu公司 ， 奎德·莫里斯 :
比较肿瘤克隆重建的非参数贝叶斯树先验。 20-31 In Sock Jang公司 ， 罗德里戈·丁斯曼 ， 亚当·马戈林 ， 贾斯汀·吉尼 :
逐步群稀疏回归（SGSR）：基于基因集的药物基因组预测模型，具有功能优先顺序的逐步选择。 32-43 Kjong-Van Lehmann公司 ， 安德烈·卡莱斯 ， 西里亚克·坎多斯 ， 威廉·李 ， 尼古拉斯·舒尔茨 ， 奥利弗·斯特格尔 ， Gunnar Rätsch公司 :
肾透明细胞癌RNA剪接决定因素的全基因组综合分析。 44-55 萨拉·纳赛尔 ， 艾哈迈特·库多尔古 ， 泰勒·伊扎特 ， 杰西卡·奥尔德里奇 ， 梅根·L·拉塞尔 ， 亚历克西斯·克里斯托福里季斯 ， Waibhav Tembe公司 ， 杰弗里·基弗 ， 杰森·科尔内沃 ， 萨拉·A·拜伦 ， 凯伦·福曼 ， 克拉丽斯·祖卡罗 ， 乔纳森·济慈 ， 帕特里夏·M·洛拉索 ， 约翰·D·卡彭 ， 杰弗里·特伦特 ， 大卫·W·克雷格 :
报告来自配对肿瘤/正常基因组和转录组测序数据的临床相关生物标记物的综合框架，以支持个性化医学的临床试验。 56至67 吴梦华 ， 玛丽娜·西罗塔 ， 阿图·J·巴特 ， 陈斌（Bin Chen） :
通过临床试验数据分析肿瘤药物联合治疗的特点。 州长。 68-79
癌症途径： “大数据”时代的自动提取、表示和推理
格雷西拉·冈萨雷斯 ， 奇塔·巴拉尔 ， 杰夫·基弗 ， Suengchan Kim先生 ， 叶洁平 :
课程介绍。 80-83 Billur发动机 ， 马坦·霍弗里 ， 汉娜·卡特 :
使用结构解析蛋白质相互作用网络识别突变特异性癌症途径。 84-95 Dokyoon Kim公司 ， 李若旺 ， 斯科特·杜德克 ， 约翰·华莱士 ， 玛丽琳·里奇 :
基于生物学知识的体细胞突变用于预测生存率：在肾细胞癌中的应用。 96-107 斯维特拉娜·洛克伍德 ， 巴拉·克里希纳莫西 :
癌症基因表达数据中的拓扑特征>。 108-119 海丰潭 ， 克里斯蒂娜·图塔诺娃 ， 克里斯·奎克 :
远程监控从文本中提取癌症路径。 120-131 谭杰 ， 马修·昂 ， 赵成 ， 凯西·S·格林 :
利用去噪自编码子进行乳腺癌全基因组检测的无监督特征构建和知识提取。 132-143 陶阳 ， 赵新林 ， 林斌（Binbin Lin） ， 陶曾 ， 水王记 ， 叶洁平 :
小鼠大脑中的自动基因表达模式注释。 144-155
描述环境暴露的重要性、环境与遗传建筑之间的相互作用以及遗传相互作用： 理解复杂性状和疾病病因的新方法
莫莉·A·霍尔 ， Shefali S.Verma公司 ， 丹尼斯·P·沃尔 ， 杰森·H·摩尔 ， 布伦丹·基廷 ， 丹尼尔·坎贝尔 ， 格里高利·吉布森 ， Folkert W.Asselbergs公司 ， 莎拉·彭德格拉斯 :
课程介绍。 156-160 达纳·C·克劳福德 ， 克里斯汀·布朗-入门 ， 马克·里德 :
接触影响的测量遗传关联研究：维生素K水平和VKORC1的例子。 161-170 克里斯蒂安·达拉博斯 ， 艾米丽·D·格鲁辛 ， 玛丽亚·E·克里科 ， 肯齐·A·克拉克 ， 杰森·H·摩尔 :
推断环境暴露与人类疾病之间相互作用的二元网络方法。 171-182 艾米丽·罗斯·霍尔辛格 ， Silke Szymczak公司 ， 阿比吉特·达斯古普塔 ， 詹姆斯·D·马利 ， 李青（音） ， 琼·贝利·威尔森 :
识别表皮模型的变量选择方法。 195-206年 Ting Hu（丁虎） ， 克里斯蒂安·达拉布斯 ， 玛丽亚·E·克里科 ， 艾米丽·孔 ， 杰森·H·摩尔 :
利用来自人类表型网络的专家知识对青光眼的全基因组遗传交互作用进行分析。 207-218 珍妮娜·M·杰夫 ， 克里斯汀·布朗-入门 ， Dana C.克劳福德 :
三个不同种族人群纤维蛋白原水平的纤维蛋白原基因簇内基因-基因和基因-环境相互作用的鉴定。 219-230 奇拉格·J·帕特尔 ， Arjun K.Manrai先生 :
开发Exposome Correlations Globe，以规划环境范围的协会。 231-242 尼科尔·雷斯特雷波 ， 萨布丽娜·米切尔 ， 罗伯特·J·古德洛 ， 黛博拉·默多克 ， 乔纳森·海恩斯 ， Dana C.克劳福德 :
不同人群的线粒体变异和年龄相关性黄斑变性风险。 243-254 王丽丽（Lili Wang） ， 帕文·穆萨维 ， 塞尔吉奥·巴兰齐尼 :
iPINBPA：用于全基因组关联研究的基于网络的集成功能模块发现工具。 255-266
众包和挖掘众包数据
罗伯特·利曼 ， 本杰明·M·好 ， 安德鲁·苏 ， 卢志勇 :
课程介绍。 267-269 吉恩·宾德 ， 圣埃芬妮·布埃 ， 安塞尔莫·迪法比奥 ， 布雷特油田 ， 威廉·海斯 ， 朱莉娅·霍恩 ， 詹妮弗·帕克 ， 曼努埃尔·C·佩奇 :
基于声誉的协作网络生物学。 270-281 本杰明·M·好 ， 马克斯·纳尼斯 ， 吴春雷 ， 安德鲁·苏 :
PubMed摘要中疾病提及注释的微任务众包。 282-293 大卫·J·奥杰斯 ， Rave Harpaz公司 ， 艾莉森·卡拉汉 ， 格雷戈·斯蒂利克 ， 尼甘·沙阿 :
药物安全监测中医务人员搜索行为分析。 306-317 厄兹努尔·塔桑 ， 齐彦军（Yanjun Qi） ， 詹姆·卡博内尔（Jaime G.Carbonell） ， 朱迪思·克莱恩·西塔拉曼 :
使用专家意见精炼文献中治愈的蛋白质相互作用。 318-329 杰罗姆·沃尔迪斯普 ， 阿瑟·金 ， 保罗·加德纳 :
网络计算机游戏的众包RNA结构比对。 330-341
个性化医疗： 从基因型、分子表型、表型和量化自我走向改进医学
乔尔·达德利 ， 詹妮弗·利斯特加滕 ， 奥利弗·斯特格尔 ， 史蒂文·布伦纳 ， 利奥波德零件 :
课程介绍。 342-346 伊南·比罗尔 ， 安东尼·雷蒙德 ， 邱瑞德曼（Readman Chiu） ， 卡明尼普 ， 肖恩·杰克曼 ， 马亚恩·克里兹曼 ， T.Roderick码头 ， 凯瑟琳·埃尼斯 ， A.戈登·罗伯逊 ， 阿利·卡桑 :
KLEAT：转录组的裂解位点分析。 347-358 瑞昌（Rui Chang） ， 乔纳森·R·卡尔 ， 埃里克·沙特 :
生物网络中的因果推理与综合信念传播。 359-370 詹姆斯·迪根斯 ， 苏延金（Su Yeon Kim） ， 胡占志 ， 丹尼尔·潘克拉兹 ， 梅·G·王 ， 杰西卡·雷诺兹 ， Ed Y.汤姆 ， 莫拉伊马·帕甘 ， 罗伯特·J·门罗 ， 胡安·罗赛 ， 弗吉尼亚·A·利沃西 ， 理查德·兰曼 ， 理查德·克鲁斯 ， P.肖恩·沃尔什 ， 朱莉亚·肯尼迪 :
从概念到临床的机器学习：使用高维RNA表达数据可靠检测甲状腺结节中BRAF V600E DNA突变。 371-382 华凡-米诺 ， 陈斌（Bin Chen） ， Weronika Sikora-Wohlfeld公司 ， 玛丽娜·西罗塔 ， 阿图·J·巴特 :
将基因表达与遗传变异联系起来以确定候选目标的系统评估。 383-394 天香高 ， 彼得·布罗丁 ， 马克·戴维斯 ， 弗拉基米尔·乔伊奇 :
少数高度遗传基因的药物诱导mRNA信号丰富。 395-406 本杰明·格利克斯伯格 ， 李丽 ， 魏毅成 ， 卡德·沙米尔 ， 约尔格·哈肯伯格 ， 拉斐尔·卡斯特拉诺斯 ， 孟马 ， 李宗石 ， 哈迪克·沙阿 ， 乔尔·达德利 ， 陈荣（音） :
疾病关系多模式发现的集成管道。 407-418 迈克尔·辛特伯格（Michael A.Hinterberg） ， 大卫·P·高 ， 迈克尔·布里斯托 ， 劳伦斯·亨特 ， J.大卫·波特 ， 卡斯滕·哥尔格 :
PEAX：复杂临床表型和基因表达关联的交互式视觉分析和探索。 419-430 格雷斯·T·黄 ， Ioannis Tsamardinos公司 ， Vineet K.Raghu公司 ， 纳夫塔利·卡明斯基 ， Panayiotis V.Benos公司 :
T-ReCS：动态形成特征组的稳定选择及其在临床结果预测中的应用。 431-442 Sumit B.Makashir公司 ， Leah C.Kottyan女士 ， 马修·威拉赫（Matthew T.Weirauch） :
差异基因共表达的Meta-分析：在狼疮中的应用。 443-454 直聂 ， 陶阳 ， 刘雅树 ， 林斌 ， 李庆阳 ， 瓦比哈夫·纳拉扬 ， 盖尔·维滕贝格（Gayle M.Wittenberg） ， 叶洁平 :
通过识别缺失值的代谢和微阵列特征预测抑郁症。 455-466 苏巴吉特·森古普塔 ， 王静（音译） ， Juhee Lee公司 ， 彼得·米勒 ， 卡马拉卡·古鲁科塔 ， 阿鲁纳瓦·巴纳吉 ， 袁基 :
BayClone：使用NGS数据对肿瘤亚群进行贝叶斯非参数推断。 467-478
研讨会
詹姆斯·西克拉（James M.Sikela） :
人类进化基因组学和寻找使我们成为人类的基因。 479-481 瓦桑特·霍纳瓦尔 :
生物和生物医学科学中的发现信息学：研究挑战和机遇。 482 理查德盖尔 ， 马克·E·米尼 ， 埃里克·J·尼尔森 :
邀请公众：新兴全球卫生研究范式对信息学的影响。 483-487 克里斯汀·帕丁 ， 安娜·C·格林 ， 俄罗斯·B·奥尔特曼 ， 凯文·布雷东纳尔·科恩 ， 伊丽莎白·威辛顿 ， 卡斯滕·哥尔格 ， 劳伦斯·亨特 ， 斯宾塞·V·缪斯 ， Predrag Radivojac公司 ， 杰森·H·摩尔 :
在大数据时代培养下一代定量生物学家。 488-492年
