4.PSB 1999：美国夏威夷大岛
俄罗斯·B·奥尔特曼 , A.基思·邓克 , 劳伦斯·亨特 , 泰瑞·E·克莱因 :
第四届太平洋生物计算研讨会论文集，PSB 1999，美国夏威夷大岛莫纳拉尼的兰花，1999年1月4日至9日。 1999 前言。
基因表达与遗传网络
罗兰·索莫吉 , 北野博树 :
基因表达和遗传网络——课程简介。 3-4 佐尔坦·萨拉西 :
基于大规模并行生物数据采集的遗传网络分析。 5-16 阿克苏Tatsuya Akutsu , 宫野佐治 , 佐托鲁·库哈拉 :
在布尔网络模型下从少量基因表达模式中识别遗传网络。 17-28 陈婷（Ting Chen） , 洪宇L.He , 乔治·M·丘奇 :
用微分方程建模基因表达。 29-40 帕特里克·德哈塞勒 , X.温 , 斯蒂芬妮·福尔曼 , 罗兰·索莫吉 :
中枢神经系统发育和损伤期间mRNA表达水平的线性模型。 41-52 罗伯特·S·埃尔布 , 乔治·S·迈克尔 :
生物模型对参数估计误差的敏感性。 53-64 P.J.E.戈斯 , 让·佩库德 :
ROM对控制ColE1质粒复制的遗传网络的稳定作用分析。 65-76 Koji Kyoda公司 , 北野博树 :
果蝇腿形成的遗传相互作用模拟。 77-89 西尔维亚·纳格尔 , 詹姆斯·弗里曼 , 坦普尔·F·史密斯 :
配体结合域中的进化约束网络：一种信息论方法。 90-101 玛丽亚·萨姆索诺娃 , 瓦西里·塞洛夫 :
网络：遗传网络结构和动力学分析工具的交互界面。 102-111 D.C.编织器 , 克里斯托弗·T·沃克曼 , 加里·斯托莫 :
用权重矩阵建模监管网络。 112-123
分子数据库中的数据挖掘与知识发现
贾妮斯·格拉斯哥 , 雷蒙德·T.Ng :
分子数据库中的数据挖掘和知识发现——课程简介。 124-125 罗伯特·吉格里奇 , 德克·哈斯 , 马克·雷姆斯迈耶 :
RNA结构开关的预测和可视化。 126-137 J.哈达克 , M.A.McClure先生 :
计算动机检测方法的比较分析。 138-149 贝蒂·拉扎雷瓦·乌利茨基 , 大卫·豪斯勒 :
共识多重校准的概率方法。 150-161 M.A.McClure先生 , J.科瓦斯基 :
有序序列运动锚定和子类建模对生成代表高度发散蛋白质序列的HMM的影响。 162-170 村上克彦 , Toshihisa Takagi先生 :
mRNA 5’剪接位点的聚类和k加权矩阵检测。 171-181 克里斯托弗·萨沃伊 , 神川信弘 , 佐佐木武彦 , 久原聪 :
使用盆景决策树识别潜在MHC I类肽表位基序。 182-189 苏少兵 , 戴安·库克 , 劳伦斯·霍尔德 :
知识发现在分子生物学中的应用：识别蛋白质的结构规律。 190-201 津田达彦 , 福川Masao Fukagawa , Toshihisa Takagi先生 :
提取核酸序列中回文和重复子序列的时间和内存高效算法。 202-213 休·E·威廉姆斯 :
快速同源搜索的有效查询过滤。 214-225
生理学中的计算机建模： 从细胞到组织
安德烈·布格林 , 乔尔·凯泽 , 利昂·格拉斯 , 亚瑟·温弗里 :
生理学中的计算机建模：从细胞到组织-课程简介。 226-227 詹姆斯·沙夫 , 莱斯利·勒夫 :
虚拟单元。 228-239 娜塔莉亚·特拉扬诺娃 , 菲利佩·阿盖尔 , 基里尔·斯库伊宾 :
心脏除颤模型中不应期的延长。 240-251
生物学的信息论方法
大卫·L·杜 , 克劳斯·普兰克 :
生物信息论方法-课程简介。 太平洋生物计算研讨会 1999 : 252-253 奥利维尔·德尔格兰奇 , 马克斯·多切特 , 埃里克·利弗斯（Eric Rivals） :
通过优化压缩方法定位序列中的重复区域。 254-265 T.格雷戈里·杜威 :
MDL和蛋白质电位的统计力学。 266-277 杰奎琳·费特罗 , 乔治·伯格 :
使用信息理论发现侧链旋转器类别：局部主干结构的影响分析。 278-289 埃里克·莱莫恩 , 大卫·默瑟伦 , 让·萨兰廷 , 恩格尔伯特·梅普·恩吉福 :
使用可重构硬件提高用户驱动学习系统的效率。 DNA拼接应用。 290-301 奥尔森 , 特伦斯·华 , 迈克尔·拉西格 :
优化史密斯-沃特曼路线。 302-313 郭其谦 :
稳健线性回归模型选择的最小描述长度计算。 314-325 田中浩 , 冯荣任 , 冈山敏树 , 塔卡希·戈霍博里 :
基于最小模型的复杂性方法在无根分子系统发育树中的拓扑选择。 326-337
分子到地图： 可视化和交互工具
托马斯·费林 , 艾琳·T·克莱默 :
分子到地图：可视化和交互工具-课程简介。 338-340 S.梅亚潘 , R.Raghavan先生 , R.维斯瓦纳坦 , Y.余 , W.劳顿 :
蛋白质形态：蛋白质构象变化的力学模型。 341-353 多安娜·梅兹 , 马克·汉森 , 亚历克斯·庞 :
ProtAlign：一种三维蛋白质比对评估工具。 354-367 马克·汉森 , 埃里克·夏普 , 苏雷什·洛达 , 多安娜·米兹 , 亚历克斯·庞 :
PROMUSE：蛋白质结构比对的多媒体数据表示系统。 368-379 格雷格·奎因 , H.-P.王 , 大卫·马丁内斯 , 菲利普·伯恩 :
为分子生物学制作蛋白质纪录片和其他多媒体演示。 380-391 韦恩·萨拉蒙森 , Kevin Yee Chuen Mok先生 , Prasanna R.Kolatkar公司 , 南苏比亚 :
BioJAKE：创造、可视化和操纵代谢途径的工具。 392-400 米歇尔·桑纳 , 布鲁斯·邓肯 , C.J.卡里略 , 亚瑟·J·奥尔森 :
生物分子分析的集成计算和可视化：使用Python和AVS的示例。 401-412
计算机辅助药物设计
尤尔根·巴约拉斯 , 泰瑞·E·克莱恩 , 特里·利布兰德 , 吉里·诺沃特尼 :
计算机辅助药物设计-课程简介。 413-414 詹姆斯·布林恩 , 道格拉斯·罗勒 , 杰拉尔德·马吉奥拉 :
能量最小化和分子匹配中基于场的相似性强制。 415-425 贾马尔·布齐达 , 桑德拉·阿瑟斯 , 安东尼·B·科尔森 , 斯蒂芬·弗里尔 , 丹尼尔·盖尔哈尔（Daniel K.Gehlhaar） , 维达·拉尔森 , 布洛克·A·卢蒂 , 保罗·雷杰托 , 彼得·W·罗斯 , Gennady Verkhivker公司 :
用加权直方图分析法和模拟退火研究配体-蛋白质结合的热力学和动力学。 426-437 彼得·冈德 :
发现新药的经验方法与“理性”方法。 438-443 保罗·拉布特 :
二元QSAR：一种测定定量结构-活性关系的新方法。 444-455 乔纳森·梅森 , 丹尼尔·切尼 :
使用多个4点药效团进行配体受体三维相似性研究。 456-467 I.A.Shkel先生 , S.Kim（S.金） :
用加权森布朗尼动力学研究生物分子的二维反应。 468-479
蛋白质结构预测
杰弗里·斯科尔尼克 , 理查德·拉思罗普 :
蛋白质结构预测-课程简介。 480-481 基督教莱曼 , 亚历山大·齐恩 , 拉尔夫·齐默 , 托马斯·伦高 :
参数优化在分子比较问题中的应用。 482-493 O.B.Ptitsyn先生 :
蛋白质进化和蛋白质折叠：非功能保守残基及其可能的作用。 494-504 拉姆·萨穆德拉 , 于霞 , M.莱维特 , 伊诺克·S·黄 :
一种基于序列的低分辨率蛋白质三级结构从头构建的组合方法。 505-516
蛋白质结构和功能紊乱
C.基辛格 , A.基思·邓克 , 尤金·沙克诺维奇 :
蛋白质结构和功能紊乱-课程介绍。 517-519 S.J.兰德里 , N.K.Steede公司 , A.M.加劳迪 , K.马斯科斯 , P.V.维塔宁 :
辅酶酪蛋白活动环中的结构和无序决定了其功能。 520-531 黛安·罗迪 , 李·马考斯基 :
紫杉醇选择肽序列与抗凋亡蛋白BCL-2紊乱环的相似性。 532-541 斯图亚特·马西森 , 克里斯托弗·彭科特 , 洛娜·J·史密斯 :
生物活性但未折叠蛋白质中侧链构象偏好的特征。 542-553 B.S.尼斯拉尼克 , E.C.饮食 , W·M·阿特金斯 , 一、乐荣 , E.阿德曼 :
谷胱甘肽S-转移酶A1-1的局部变性状态：C-末端螺旋的配体依赖性形成的过渡状态分析。 太平洋生物计算研讨会 1999 : 554-565 Richard B.会话 , M.V.海耶斯 , A.J.穆雷 , A.R.克拉克 , R.利奥·布莱迪 :
一个序列，四个折叠：CD2 N末端结构域亚稳定折叠群之间的转换。 太平洋生物计算研讨会 1999 : 566-577 W.-L.沙乌 , T·胡 , T.-S.谢长廷 :
真核生物DNA拓扑异构酶的亲水性、蛋白酶敏感性末端结构域具有重要的细胞内功能。 太平洋生物计算研讨会 1999 : 578-589 X.-M.杨 , R.E.乔治斯库 , J.-H.李 , W.-F.余 , 海尔汗 , M.L.塔萨科 :
从a/B结构域裂解中识别无序多肽链：自我与非自我关联。 590-600
