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问别人

2.BIRD 2008：奥地利维也纳

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穆拉德·埃卢米,约瑟夫·库恩,米查尔·利尼尔,罗伯特·墨菲,克里斯坦·施耐德,克里斯蒂安·托马:
生物信息学研究与开发，第二届国际会议，BIRD 2008，维也纳，奥地利，2008年7月7-9日，会议记录。计算机与信息科学中的通信13,施普林格 2008，国际标准图书编号978-3-540-70598-7

基因表达/调控和微阵列

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克里斯蒂安·马丁,蒂姆·W·纳特科姆:
支持基于聚类的探索性数据分析的树索引。 1-15
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本·达尔齐尔,惠阳,拉赫尔·辛哈,马修·戈姆利,苏珊·费希尔:
XMAS：时间序列微阵列数据可视化、分析和探索的经验方法。 16-31
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阮富勇（Nguyen Phuong）,黄团:
在固定流形中聚类以检测具有相似表达模式的基因组。 32-42

序列分析与比对I

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费霞,勇斗,徐嘉庆:
具有多种子检测和并行扩展的BLAST算法的基于FPGA的加速器系列。 43-57
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米哈伊尔·哈拉切夫,线虫Shiri:
DNA序列中的快速结构主题搜索。 58-73
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刘斌（Bin Liu）,雷琳,王晓龙,齐文东,王宣:
基于N元谱的蛋白质远程同源性检测的判别方法。 74-86

序列分析与比对II

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陈娜莲,米哈伊尔·哈拉切夫,线虫Shiri:
在大DNA序列中寻找超最大重复。 87-101
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穆罕默德·阿尔·沙拉法,雷达·阿哈吉:
通过分治预测主题位置。 102-113

蛋白质和RNA结构与功能I

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乌尔里克·穆克斯坦,哈基姆·塔夫,斯蒂芬·伯恩哈特,玛丽贝尔·埃尔南德斯-罗尔斯,约格·沃格尔,彼得·F·斯塔德勒,伊沃·L·霍夫克:
RNA-RNA相互作用的翻译控制：RNA-RNA-结合热力学的改进计算。 114-127
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甘香超,列奥尼达斯,安德烈亚斯·亚历山大·阿尔布雷希特,凯瑟琳·施泰因霍费尔:
从头算蛋白质折叠模拟的无对称子空间。 128-139

蛋白质和RNA结构与功能II

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蒂莫西·李,拉赫尔·辛哈:
使用计算预测方法和基于质谱的算法方法确定二硫键的对比分析。 140-153
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纳塔利娅·库巴托娃,尤里斯·维克斯纳:
蛋白质结构之间进化关系的探索。 154-166
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列奥尼达斯,甘香超,安德烈亚斯·亚历山大·阿尔布雷希特,凯瑟琳·施泰因霍费尔:
HP和MJ格点模型中蛋白质折叠模拟的两种局部搜索方法。 167-179
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阿里雷扎·哈吉·科达巴赫什,詹·曼努奇,阿拉什·拉菲伊,阿文德·古普塔:
2D HPC模型中一类稳健的稳定蛋白质。 180-192

机器学习和数据分析

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Veselka Boeva公司,埃琳娜·齐波科娃:
一种新的自适应多重插补算法。 193-206
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彼得罗·利奥,马泰奥·布里利,雷纳托·法尼:
爆炸数据挖掘中的拓扑度量：质粒和固氮蛋白质案例研究。 207-220
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Ramkishore Bhattacharyya公司,巴拉拉姆·巴塔查里亚:
用于内聚模式发现的基因表达挖掘。 221-234

数据库和数据集成I

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路易斯·佩德罗·科埃略,罗伯特·墨菲:
从未知分辨率的图像中识别亚细胞位置。 235-242
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Ingo H.C.Wassenk公司,汉·劳沃达,保罗·范德维特,蒂莫·布雷特,安东·尼霍尔特:
E-BioFlow：关于科学工作流的不同观点。 243-257
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多米尼克·美因茨,英戈·保尔森,英德拉美因茨,凯特琳·韦勒,约钦·科尔,阿恩特·冯·海斯勒:
以知识获取为中心的生物ontologies合作开发——以BIO2Me为例。 258-272

路径、网络、系统生物学I

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凯文·孔托斯,吉安卢卡·邦坦比:
从“小n，大p”微阵列数据推断遗传网络的嵌套q部分图。 273-287
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Esa Pitkänen公司,阿里·兰塔南,Juho Rousu公司,埃斯科·乌科宁:
一种重建无间隙代谢网络的计算方法。 288-302
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汉斯·赞特马,斯特凡·瓦格曼斯,德拉甘·博斯纳基:
通过最大项目集发现生物网络中的频繁子图。 303-317
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克拉拉·皮祖蒂,西蒙娜·伦博:
PPI网络中的多功能蛋白质聚类。 318-330

路径、网络、系统生物学II

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瓦莱丽亚·菲昂达,路易吉·帕洛波利,西蒙娜·潘尼,西蒙娜·伦博:
用“聚焦和缩放”方法查询蛋白质相互作用网络。 331-346
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雅诺·I·范·海默特,理查德·巴尔多克:
将空间区域与相互作用的基因表达模式的组合相匹配。 347-361
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伊曼纽尔·施瓦兹,F.马库斯·刘易克,萨宾·巴恩,彼得罗·利奥:
结合复杂疾病的分子和生理数据。 362-376
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理查德·多布森,帕特里夏·B·门罗,查尔斯·A·梅恩,马克·考菲尔德,曼苏尔·A·S·萨奇:
结合蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和序列属性预测高血压相关蛋白。 377-391

数据库和数据集成II

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罗齐亚·坎波,M.Faris Abtholuddin先生:
斑马鱼基因组项目数据库中内源性逆转录病毒的基因组结构和特征。 392-403
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理查德·卡尔·范德华,伊丽莎白·范德华,安东尼奥·卡拉佩利,弗朗西斯科·纳尔迪,弗朗西斯科·弗拉蒂,卢西亚诺·米拉内西,彼得罗·利奥:
网格上的贝叶斯系统发育。 404-416

ALBIO研讨会

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佩特里·卡尔西,汉努·佩尔托拉,乔玛·塔尔希奥:
生物序列精确字符串匹配算法的比较。 417-426
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哈泰姆·塔赫里,穆拉德·埃卢米:
最小碎片去除问题的一种新的近似算法。 427-435
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托马斯·弗洛里,科斯塔斯·伊利奥普洛斯,穆罕默德·索赫尔·拉赫曼,拉迪斯拉夫·瓦格纳,米查尔·沃拉切克:
DNA/RNA序列中的索引因子。 436-445
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  - conf/bird/AntoniouIJR08
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帕夫洛斯·安东尼奥,科斯塔斯·伊利奥普洛斯,Inuka Jayasekera公司,M.Sohel Rahman先生:
使用图论模型实现交换匹配算法。 446-455
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玛丽亚·费德里科,纳迪娅·皮桑蒂:
生物序列中最大基序的后缀树特征。 456-465
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米哈伊尔·罗伊特伯格,安娜·甘宾,劳伦特·诺埃,斯拉沃米尔·拉索塔,尤金妮娅·弗莱托娃,Ewa Szczurek公司,格雷戈里·库切洛夫:
蛋白质相似性搜索的高效种子技术。 466-478
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穆拉德·埃卢米,艾哈迈德·莫卡迪姆:
多重和全局对齐的算法。 479-488
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恩斯特·奥尔特豪斯,Stefan Canzar公司:
LASA：多序列非神经对齐工具。 489-498
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何塞·克里斯宾·埃尔南德斯·埃尔南德兹,Béatrice杜瓦尔,金考浩:
基于SVM的基因选择和微阵列数据分类的局部搜索。 499-508
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李焦安藤（Ligo Anto）硕士,G.戈帕库马尔,Achuthsankar S.Nair公司,英迪拉·戈什:
GENFOCS-一种具有敏感性和特异性的基因发现比较工具。 509-516
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罗杰·马歇尔:
Gene Machine©-用于分析基因组数据的硬件/软件平台。 517-527

PETRIN车间

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卡洛·卡塔尼:
DNA序列的复杂表示。 528-537
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卡洛·卡塔尼,马西莫·斯卡利亚:
轴突生理学中脉冲的小波分析。 538-545
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埃琳娜·莫卡努,保罗·斯特里安:
荧光应用的采集和算法。 546-555
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保罗·斯特里安,屋大维·马林,尼努列斯库缬草:
生物光子学应用中通过泵浦调制控制激光动力学。 556-562
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尼努列斯库缬草,弗拉杜阿·博格丹·尼古拉,安德烈亚·斯特里安:
医用量子阱激光器。 563-570
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斯特凡·普斯卡,西奥多拉·托马:
钛种植体表面分形参数特征研究的计算模型。 571-580
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Trandafir Moisa公司,克里斯蒂安·莫拉雷斯库:
VEMS-TM——管理基础设施。 581-586
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伊琳娜·科迪塔,斯特凡·普斯卡:
人类社区VAC与耐药性关系的PTF评估模型。 587-593

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