大卫·T·琼斯
人员信息
附属: 英国伦敦大学学院
优化列表
2020年–今天
2024 [i5] 丹妮拉·维佩特 , 雷内·尤坦斯基(Rene L.Utianski) , 约瑟夫·杜菲 , 约翰·斯特里克 , 利兰·巴纳德 , 大卫·T·琼斯 , 雨果·博塔 :
探索转移学习用于病理性语音特征预测:层选择的影响。 CoRR公司 abs/2402.01796 ( 2024 ) 2023 【c9】 哈根·索尔陶 , 伊扎克·沙夫兰 , 亚历克斯·奥滕维斯 , 约瑟夫·杜菲 , 雷内·尤坦斯基(Rene L.Utianski) , 利兰·巴纳德 , 约翰·斯特里克 , 丹妮拉·维佩特 , 大卫·T·琼斯 , 雨果·博塔 :
利用通用语音模型的基于感知的序列分类器检测语音异常。 ASRU公司 2023 : 1-7 【c8】 丹妮拉·维佩特 , 雷内·尤坦斯基(Rene L.Utianski) , 约瑟夫·杜菲 , 约翰·斯特里克 , 利兰·巴纳德 , 基思·A·约瑟夫 , 詹妮弗·惠特威尔 , 大卫·T·琼斯 , 雨果·博塔 :
并非所有错误的产生都是平等的:评估模型和演讲者因素对临床人群ASR结果的影响。 ASRU公司 2023 : 1-6 [i4] 利兰·巴纳德 , 法瓦·阿里 , 雨果·博塔 , 大卫·T·琼斯 :
SparCA:用于特征提取和降维的稀疏压缩聚集。 CoRR公司 abs/2302.10776 ( 2023 ) [i3] 哈根·索尔陶 , 伊扎克·沙夫兰 , 亚历克斯·奥滕维斯 , 约瑟夫·杜菲 , 雷内·尤坦斯基(Rene L.Utianski) , 利兰·巴纳德 , 约翰·斯特里克 , 丹妮拉·维佩特 , 大卫·T·琼斯 , 雨果·博塔 :
利用通用语音模型的基于感知的序列分类器检测语音异常。 CoRR公司 abs/2310.13010 ( 2023 ) 2022 [公元53年] Krishnakant V.Saboo公司 , 常虎 , 约戈塞桑·瓦拉塔拉贾赫 , 斯科特·普日贝尔斯基 , 罗伯特·里德 , 克里斯托弗·施瓦兹 , 乔纳森·格拉夫·拉德福德 , 大卫·S·诺普曼 , 玛丽·M·马丘达 , 米歇尔·米尔克 , 罗纳德·彼得森 , 保罗·M·阿诺德 , 格雷戈里·沃雷尔 , 大卫·T·琼斯 , 小克利福德·R·杰克。 , 拉维山卡·K·伊耶 , Prashanthi Vemuri公司 :
深度学习确定了预测认知并解释认知老化异质性的大脑结构。 神经影像 251 : 119020 ( 2022 ) [i2] 丹妮拉·维佩特 , 布拉德利·A·马林 , 约瑟夫·杜菲 , 雷内·尤坦斯基(Rene L.Utianski) , 约翰·斯特里克 , 大卫·T·琼斯 , 雨果·博塔 :
共享临床语音记录的重新识别风险。 CoRR公司 abs/2210.09975 ( 2022 ) 2021 [j52] 刘易斯·莫法特 , 大卫·T·琼斯 :
使用深度半监督学习框架提高单序列预测方法的准确性。 生物信息。 37 ( 21 ) : 3744-3751 ( 2021 ) [公元51年] 彼得里斯·考格斯威尔 , 希瑟·J·怀斯特 , 马修·L·森杰姆 , 杰弗里·甘特 , 斯蒂芬·维甘德 , 克里斯托弗·施瓦兹 , 阿文·阿拉尼 , 特里·塞尔诺 , 瓦尔·J·洛 , 大卫·S·诺普曼 , 雨果·博塔 , 乔纳森·格拉夫·拉德福德 , 大卫·T·琼斯 , 凯加尔·坎塔奇 , Prashanthi Vemuri公司 , 布拉德利·F·波伊夫 , 米歇尔·米尔克 , 罗纳德·彼得森 , 小克利福德·R·杰克。 :
定量敏感性绘图与阿尔茨海默病临床和影像学标记物的相关性。 神经影像 224 : 117433 ( 2021 ) [约50] 彼得里斯·考格斯威尔 , 斯蒂芬·维甘德 , 希瑟·J·怀斯特 , 杰弗里·冈特 , 乔纳森·格拉夫·拉德福德 , 大卫·T·琼斯 , 克里斯托弗·施瓦兹 , 马修·森杰姆 , 大卫·S·诺普曼 , 罗纳德·彼得森 , 小克利福德·R·杰克。 :
脑脊液动力学作为认知进展的预测因素。 神经影像 232 : 117899 ( 2021 ) [公元49年] 特里·塞尔诺 , 大卫·S·诺普曼 , 瓦尔·J·洛 , 雨果·博塔 , 乔纳森·格拉夫·拉德福德 , 大卫·T·琼斯 , 普拉尚蒂·维穆里 , 米歇尔·米尔克 , 克里斯托弗·施瓦兹 , 马修·森杰姆 , 杰弗里·甘特 , 罗纳德·彼得森 , 小克利福德·R·杰克。 :
老年人群中β淀粉样蛋白和tau之间的关系:一个加速失效时间模型。 神经影像 242 : 118440 ( 2021 ) 【c7】 内拉杰·瓦赫 , Jionghao Wei公司 , 萨默斯·拉瓦尔 , 布伦特·M·贝里 , 利兰·巴纳德 , 本杰明·布林克曼 , 格雷戈里·沃雷尔 , 大卫·T·琼斯 , 约戈塞桑·瓦拉塔拉贾赫 :
脑电数据的区域引导自我监督提高了下游分类性能和泛化性。 ML4H@中性点 2021 : 130-142 【c6】 Krishnakant V.Saboo公司 , 阿尼鲁德·乔达里 , 曹玉瑞 , 格雷戈里·沃雷尔 , 大卫·T·琼斯 , 拉维山卡·K·伊耶 :
基于强化学习的阿尔茨海默病疾病进展模型。 NeurIPS公司 2021 : 20903-20915 [i1] Krishnakant V.Saboo公司 , 阿尼鲁德·乔达里 , 曹玉瑞 , 格雷戈里·沃雷尔 , 大卫·T·琼斯 , 拉维尚卡·K·伊耶 :
基于强化学习的阿尔茨海默病疾病进展模型。 CoRR公司 abs/2106.16187 ( 2021 ) 2020 [j48] 伊恩·西利托 , 安东尼娜·安德列娃 , 汤姆·L·布伦德尔 , 丹尼尔·W·A·布坎 , 罗伯特·D·芬恩 , 朱利安·高夫 , 大卫·T·琼斯 , 劳伦斯·凯利 , Typhaine Paysan-Lafosse公司 , 苏达特·林 , 阿列克谢·穆尔津 , 阿伦·普拉萨德·潘杜拉根 , 古斯塔沃·A·萨拉查 , 马钦·斯科瓦克(Marcin J.Skwark) , 迈克尔·斯特恩伯格 , 萨米尔·维兰卡 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Genome3D:集成协作数据管道以扩展共识蛋白质结构注释的深度和广度。 核酸研究。 48 ( 发布数据库 ) : D314-D319号 ( 2020 ) [公元47年] 岑湾 , 大卫·T·琼斯 :
通过创建具有生成性对抗网络的合成特征样本,改进了蛋白质功能预测。 自然马赫数。 智力。 2 ( 9 ) : 540-550 ( 2020 ) [公元46年] 高级安德鲁·W , 理查德·埃文斯 , 空军参谋长约翰·江珀 , 詹姆斯·柯克帕特里克 , 劳伦特·西弗雷 , 提姆·格林 , 秦崇礼 , 奥古斯汀·泽德克 , 亚历山大·W·R·纳尔逊 , 亚历克斯·布里奇兰 , 雨果·佩内顿斯 , 斯蒂格·彼得森 , 凯伦·西蒙扬 , 克洛桑 , 普什密特·科利 , 大卫·T·琼斯 , 大卫·西尔弗 , 科雷·卡武科格鲁 , 哈萨比斯 :
利用深度学习潜力改进蛋白质结构预测。 国家。 577 ( 7792 ) : 706-710 ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [j45] 丹尼尔·W·A·巴坎 , 大卫·T·琼斯 :
PSIPRED蛋白质分析工作台:20年过去了。 核酸研究。 47 ( Web服务器-发布 ) : W402-W407型 ( 2019 ) 2018 [公元44年] 大卫·T·琼斯 , 肖恩·坎达蒂尔 :
使用完全卷积神经网络和最小序列特征进行蛋白质接触预测的高精度。 生物信息。 34 ( 19 ) : 3308-3315 ( 2018 ) 2017 [公元43年] 丹尼尔·W·A·巴坎 , 大卫·T·琼斯 :
特征线程:通过有效的接触图线程识别类似的蛋白质折叠。 生物信息。 33 ( 17 ) : 2684-2690 ( 2017 ) [公元42年] 岑湾 , 乔纳森·李斯 , 费德里科·米内基 , 克里斯汀·奥伦戈 , 大卫·T·琼斯 :
时间转录表达谱分析揭示了黑腹果蝇蛋白质功能和发育阶段之间的联系。 PLoS计算机。 生物。 13 ( 10 ) ( 2017 ) 2015 [公元41年] 大卫·T·琼斯 , 多梅尼科·科泽托 :
DISOPRED3:带注释蛋白结合活性的精确无序区域预测。 生物信息。 31 ( 6 ) : 857-863 ( 2015 ) [j40] 大卫·T·琼斯 , 塔尼亚·辛格 , 托马斯·科西奥莱克 , 斯图亚特·特奇纳 :
MetaPSICOV:结合协同进化方法准确预测蛋白质接触和长程氢键。 生物信息。 31 ( 7 ) : 999-1006 ( 2015 ) [公元39年] 托尼·E·刘易斯 , 伊恩·西利托 , 安东尼娜·安德列娃 , 汤姆·L·布伦德尔 , 丹尼尔·W·A·巴坎 , 赛勒斯·乔西亚 , 多梅尼科·科泽托 , 何塞·M·达纳 , Ioannis Filippis公司 , 朱利安·高夫 , 大卫·T·琼斯 , 劳伦斯·凯利 , 杰拉德·J·克莱维特 , 费德里科·米内基 , 杰娜·米斯特里 , 阿列克谢·穆尔津 , 伯纳多·奥乔亚·蒙塔诺 , 马特·欧茨 , 马可·蓬塔 , 欧文·J·L·拉克汉姆 , 乔纳森·斯塔哈克 , 迈克尔·斯特恩伯格 , 萨米尔·维兰卡 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Genome3D:利用结构帮助用户理解他们的序列。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 382-386 ( 2015 ) [公元38年] 塞尔盖·巴霍莫夫 , 大卫·T·琼斯 , 大卫·S·克诺普曼 :
与计算机化语义索引相关的语言网络。 神经影像 104 : 125-137 ( 2015 ) 2014 [公元37年] 斯图亚特·特奇纳 , 托马斯·科西奥莱克 , 大卫·T·琼斯 :
将共同进化衍生接触应用于蛋白质结构预测的机会和局限性。 生物算法医学系统。 10 ( 4 ) : 243-254 ( 2014 ) 2013 [公元36年] 蒂莫西·纽金特 , 大卫·T·琼斯 :
利用基于知识的统计潜力对膜蛋白进行定向和精细化。 BMC生物信息。 14 : 276 ( 2013 ) [j35] 多梅尼科·科泽托 , 丹尼尔·W·A·巴坎 , 凯文·布赖森 , 大卫·T·琼斯 :
通过大规模集成进化分析和多数据源进行蛋白质功能预测。 BMC生物信息。 14 ( S-3系列 ) : S1(第一阶段) ( 2013 ) [公元34年] 托尼·E·刘易斯 , 伊恩·西利托 , 安东尼娜·安德列娃 , 汤姆·L·布伦德尔 , 丹尼尔·W·A·巴坎 , 赛勒斯·乔西亚 , 艾莉森·L·卡夫 , 何塞·M·达纳 , Ioannis Filippis公司 , 朱利安·高夫 , 莎拉·亨特 , 大卫·T·琼斯 , 劳伦斯·凯利 , 杰拉德·J·克莱维特 , 费德里科·米内基 , 亚历克斯·L·米切尔 , 阿列克谢·穆尔津 , 伯纳多·奥乔亚·蒙塔诺 , 欧文·J·L·拉克汉姆 , 詹姆斯·史密斯 , 迈克尔·斯特恩伯格 , 萨米尔·维兰卡 , 科林·叶芝 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Genome3D:一个英国合作项目,基于SCOP和CATH域用预测的3D结构注释基因组序列。 核酸研究。 41 ( 发布数据库 ) : 499-507 ( 2013 ) [公元33年] 丹尼尔·W·A·布坎 , 费德里科·米内基 , 蒂姆·C·O·纽金特 , 凯文·布赖森 , 大卫·T·琼斯 :
PSIPRED蛋白质分析工作台的可扩展web服务。 核酸研究。 41 ( Web服务器-发布 ) : 349-357 ( 2013 ) 2012 [公元32年] 大卫·T·琼斯 , 丹尼尔·W·A·布坎 , 多梅尼科·科泽托 , 马西米利亚诺·蓬蒂尔 :
PSICOV:在大型多序列比对中使用稀疏逆协方差估计进行精确的结构接触预测。 生物信息。 28 ( 2 ) : 184-190 ( 2012 ) [公元31年] 蒂莫西·纽金特 , 大卫·T·琼斯 :
检测跨膜蛋白序列中的孔衬里区域。 BMC生物信息。 13 : 169 ( 2012 ) 2011 【j30】 蒂莫西·纽金特 , 肖恩·沃德 , 大卫·T·琼斯 :
MEMPACKα螺旋跨膜蛋白结构预测服务器。 生物信息。 27 ( 10 ) : 1438-1439 ( 2011 ) [公元29年] 艾莉森·L·卡夫 , 伊恩·西利托 , 托尼·E·刘易斯 , 安德鲁·克莱格 , 罗伯特·伦茨(Robert Rentzsch) , 尼古拉斯·弗纳姆 , 玛丽亚路易莎·佩莱格里尼·卡拉斯 , 大卫·T·琼斯 , 珍妮特·桑顿 , 克里斯汀·奥伦戈 :
扩大CATH:增加蛋白质结构领域的覆盖范围,并将结构与功能联系起来。 核酸研究。 39 ( 发布数据库 ) : 420-426 ( 2011 ) 2010 [公元28年] 丹尼尔·W·A·巴坎 , S.M.病房 , 安娜·洛布利 , 蒂莫西·纽金特 , 凯文·布赖森 , 大卫·T·琼斯 :
伦敦大学学院的蛋白质注释和建模服务器。 核酸研究。 38 ( Web服务器发布 ) : 563-568 ( 2010 ) [公元27年] 蒂莫西·纽金特 , 大卫·T·琼斯 :
利用剩余接触和力定向算法预测跨膜螺旋布局。 PLoS计算机。 生物。 6 ( 三 ) ( 2010 ) 【p1】 梅丽莎·彭托尼 , 乔纳森·沃德 , 大卫·T·琼斯 :
预测和分析蛋白质天然紊乱的计算资源。 蛋白质组生物信息学 2010 : 369-393
2000 – 2009
2009 [公元26年] 安娜·洛布利 , 迈克尔·萨多夫斯基 , 大卫·T·琼斯 :
pGenTHREADER和pDomTHREADER:改进蛋白质折叠识别和超家族识别的新方法。 生物信息。 25 ( 14 ) : 1761-1767 ( 2009 ) [公元25年] 安东尼斯·库苏奈迪斯 , 奥利弗·雷德弗恩 , 大卫·T·琼斯 :
使用文本挖掘改进蛋白质结构数据库中的分类。 BMC生物信息。 10 ( 2009 ) [公元24年] 斯特凡诺·利塞 , 塞德里克·阿昌博 , 马西米利亚诺·蓬蒂尔 , 大卫·T·琼斯 :
结合机器学习和基于能量的方法预测蛋白质界面上的热点残留。 BMC生物信息。 10 : 365 ( 2009 ) [公元23年] 蒂莫西·纽金特 , 大卫·T·琼斯 :
基于支持向量机的跨膜蛋白拓扑预测。 BMC生物信息。 10 ( 2009 ) 2008 [公元22年] 青威潭 , 大卫·T·琼斯 :
将神经网络和进化信息用于蛋白质三级结构预测的诱饵识别。 BMC生物信息。 9 ( 2008 ) [公元21年] 安娜·洛布利 , 蒂莫西·纽金特 , 克里斯汀·奥伦戈 , 大卫·T·琼斯 :
FFPred:脊椎动物蛋白质组基于特征的集成功能预测服务器。 核酸研究。 36 ( Web服务器发布 ) : 297-302 ( 2008 ) [j20] 詹妮弗·西彭 , 哈立德·贝哈杰姆 , 朱利安·塞利 , 苏珊娜·梅布瑞(Suzanne M.Embury) , 诺曼·W·巴顿 , 卡罗尔·高布尔 , 斯蒂芬·奥利弗 , 史蒂文斯 , 卢卡斯·桑博利斯 , 奈杰尔·马丁 , 亚历山大·波洛瓦西利斯 , 菲利普·琼斯 , 理查德·科特 , 亨宁·赫姆贾科布 , 梅丽莎·彭托尼 , 大卫·T·琼斯 , 克里斯汀·奥伦戈 , 西蒙·哈伯德 :
ISPIDER Central:蛋白质组学的集成数据库web服务器。 核酸研究。 36 ( Web服务器发布 ) : 485-490 ( 2008 ) 2007 [公元19年] 大卫·T·琼斯 :
利用进化信息提高跨膜蛋白拓扑预测的准确性。 生物信息。 23 ( 5 ) : 538-544 ( 2007 ) [公元18年] 安娜·洛布利 , 马克·B·斯温德尔 , 克里斯汀·奥伦戈 , 大卫·T·琼斯 :
利用蛋白质的固有紊乱模式推断功能。 PLoS计算机。 生物。 三 ( 8 ) ( 2007 ) 2006 [公元17年] 利亚姆·J·麦古芬 , 理查德·史密斯 , 凯文·布赖森 , 瑟伦·阿克塞尔·瑟伦森 , 大卫·T·琼斯 :
整个人类蛋白质组的高通量基于profile的折叠识别。 BMC生物信息。 7 : 288 ( 2006 ) [公元16年] 斯特凡诺·利塞 , 艾丽斯·沃克·泰勒 , 大卫·T·琼斯 :
对接接触空间中的蛋白质结构域。 BMC生物信息。 7 : 310 ( 2006 ) 【c5】 斯特凡诺·里斯 , 大卫·T·琼斯 :
受邀演讲:使用联系图表示对接蛋白质结构域。 德国生物信息学会议 2006 : 74 【c4】 蒂莫西·M·D·埃贝尔 , 伯纳德·巴克斯顿 , 大卫·T·琼斯 :
春季景观 :使用spring嵌入和“信息景观”可视化微阵列和上下文生物信息数据。 ISMB(生物信息学补充) 2006 : 99-107 2005 [公元15年] 克里斯·史蒂文·佩蒂特 , 利亚姆·J·麦古芬 , 大卫·T·琼斯 :
使用3D模型质量评估改进基于序列的褶皱识别。 生物信息。 21 ( 17 ) : 3509-3515 ( 2005 ) [公元14年] 凯文·布赖森 , 利亚姆·J·麦古芬 , 罗素·L·马斯登 , 乔纳森·沃德 , 贾斯普雷特·辛格·索迪 , 大卫·T·琼斯 :
伦敦大学学院的蛋白质结构预测服务器。 核酸研究。 33 ( Web服务器发布 ) : 36-38 ( 2005 ) 2004 [j13] 利亚姆·J·麦古芬 , Stefano A.街 , 瑟伦·阿克塞尔·瑟伦森 , 大卫·T·琼斯 :
基因组线程数据库。 生物信息。 20 ( 1 ) : 131-132 ( 2004 ) [公元12年] 乔纳森·沃德 , 利亚姆·J·麦古芬 , 凯文·布赖森 , 伯纳德·巴克斯顿 , 大卫·T·琼斯 :
用于预测蛋白质紊乱的DISOPRED服务器。 生物信息。 20 ( 13 ) : 2138-2139 ( 2004 ) [公元11年] 大卫·P·A·科尼 , 伯纳德·巴克斯顿 , 威廉·兰登 , 大卫·T·琼斯 :
BioRAT:从全长论文中提取生物信息。 生物信息。 20 ( 17 ) : 3206-3213 ( 2004 ) [j10] 利亚姆·J·麦古芬 , Stefano A.街 , 凯文·布赖森 , 瑟伦·阿克塞尔·瑟伦森 , 大卫·T·琼斯 :
基因组线程数据库:关键生物体基因组结构注释的综合资源。 核酸研究。 32 ( 发布数据库 ) : 196-199 ( 2004 ) 【c3】 乔纳森·沃德 , 贾斯普雷特·辛格·索迪 , 伯纳德·巴克斯顿 , 大卫·T·琼斯 :
使用基于内核的机器学习算法从序列数据中预测基因本体注释。 CSB公司 2004 : 529-530 【c2】 贾斯普雷特·辛格·索迪 , 利亚姆·J·麦古芬 , 凯文·布赖森 , 乔纳森·沃德 , 洛伦斯·沃尼什 , 大卫·T·琼斯 :
低分辨率蛋白质结构中功能位点区域的自动预测。 CSB公司 2004 : 702-703 2003 [公元9年] 利亚姆·J·麦古芬 , 大卫·T·琼斯 :
基因组折叠识别GenTHREADER方法的改进。 生物信息。 19 ( 7 ) : 874-881 ( 2003 ) [j8] 乔纳森·沃德 , 利亚姆·麦古芬 , 伯纳德·巴克斯顿 , 大卫·T·琼斯 :
基于支持向量机的二级结构预测。 生物信息。 19 ( 13 ) : 1650-1655 ( 2003 ) 2001 [j7] 凯文·布赖森 , 迈克尔·勒克 , 迈克·乔伊 , 大卫·T·琼斯 :
生物信息学数据管理的代理交互。 申请。 Artif公司。 智力。 15 ( 10 ) : 917-947 ( 2001 ) [j6] 大卫·T·琼斯 :
基因组学中的蛋白质结构预测。 生物信息简报。 2 ( 2 ) : 111-125 ( 2001 ) [j5] 利亚姆·J·麦古芬 , 凯文·布赖森 , 大卫·T·琼斯 :
蛋白质折叠识别的基线是什么? 生物信息。 17 ( 1 ) : 63-72 ( 2001 ) 2000 【j4】 利亚姆·麦古芬 , 凯文·布赖森 , 大卫·T·琼斯 :
PSIPRED蛋白质结构预测服务器。 生物信息。 16 ( 4 ) : 404-405 ( 2000 ) 【c1】 凯文·布赖森 , 迈克尔·勒克 , 迈克·乔伊 , 大卫·T·琼斯 :
将Agent应用于GeneWeaver的生物信息学。 中央情报局 2000 : 60-71
1990 – 1999
1998 [j3] 彼得罗·利奥 , N.高盛 , 杰弗里·索恩 , 大卫·T·琼斯 :
PASSML:结合进化推理和蛋白质二级结构预测。 生物信息。 14 ( 8 ) : 726-733 ( 1998 ) 1993 [注2] 大卫·T·琼斯 , 珍妮特·桑顿 :
蛋白质折叠识别。 J.计算。 辅助分子设计。 7 ( 4 ) : 439-456 ( 1993 ) 1992 [j1] 大卫·T·琼斯 , 威廉·泰勒 , 珍妮特·桑顿 :
从蛋白质序列快速生成突变数据矩阵。 计算。 申请。 Biosci公司。 8 ( 三 ) : 275-282 ( 1992 )