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生物医学语义学杂志，第6卷

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2015年第6卷

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塞内·卡夫卡斯,Jee-Hyub Kim先生,皮兴军,约翰娜·麦克恩泰尔（Johanna R.McEntyre）:
与欧洲PubMed Central全文生物医学文章相关的补充数据中的数据库引用。 1
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Junguk Hur公司,阿尔祖坎·祖圭尔,左双香,何永群:
用于疫苗相关基因-基因相互作用文献挖掘的交互网络本体的开发和应用。 2
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清子F.Aoki-Kinoshita,阿基拉·R·金珠,森田美树,井石义博,陈一安（音）,Yasumasa Shigemoto公司,藤泽隆本,尤基·阿库恩,加藤武雄,安娜·科库布,森喜朗,中尾三郎,水池川岛,冈本信步,片山俊一,小岛纯一:
2011年BioHackathon生命科学相关数据的实施。三
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左双香,杰正,于林,何永群:
Ontorat：基于本体设计模式自动生成新的本体术语、注释和公理。 4
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埃利尼·米纳,马克·汤普森,拉贾拉姆·卡利亚佩鲁马尔,Jun Zhao（赵军）,埃尔克·范德霍斯特,左天塔图,克里斯蒂娜·M·赫特纳,埃里克·舒尔茨,巴伦德·蒙斯,马可·罗斯:
纳米出版物用于暴露生命科学中的实验数据：亨廷顿病案例研究。 5
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罗伯特·霍恩多夫,迈克尔·格伦伯格,Georgios V.Gkoutos公司,保罗·斯科菲尔德:
基于相似性的模式生物、疾病和药物效应表型搜索。 6
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塞内·卡夫卡斯,皮兴军,尼科斯·马里诺斯,弗朗西斯科·塔洛,安德鲁·莫里森,约翰娜·麦克恩泰尔（Johanna R.McEntyre）:
欧洲PMC中的节级搜索功能。 7
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小福,里萨·特里萨·巴蒂斯塔·纳瓦罗,拉斐尔·拉克,索菲亚·阿纳尼亚杜:
支持使用文本挖掘工作流注释慢性阻塞性肺病（COPD）表型。 8
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克里斯托弗·芬克,英迪卡·卡汉达,阿萨·本·胡尔,卡琳·M·维斯普尔:
使用GOstruct评估各种文本特征用于自动蛋白质功能预测。 9
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詹娜·黑斯廷斯,尼娜·杰利亚兹科娃,加雷思·欧文,乔治亚·齐利基,克里斯蒂安·穆特阿努,克里斯托夫·斯坦贝克,埃贡·L·威利根:
eNanoMapper：利用本体实现纳米材料风险评估的数据集成。 10
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辛西娅·L·史密斯,贾南·T·埃皮格:
扩展哺乳动物表型本体，以支持大规模小鼠敲除筛选产生的高通量小鼠表型数据的自动交换。 11
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帕特里克·兰布里克斯,方伟-克莱纳,兹拉坦·德拉吉西奇:
在轻量级本体中完成is-a结构。 12
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雷纳·温恩伯格（Rainer Winnenburg）,乔纳森·莫滕森,奥利维尔·博登瑞德:
使用描述逻辑评估NDF-RT中药物类别成员关系的一致性。 13
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玛丽·里贾娜·博兰德,尼古拉斯·P·塔托内蒂,乔治·赫里普萨克:
开发和验证一种分类方法，用于从电子健康记录中自动提取严重程度。 14
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克里斯蒂娜·多因·哈里斯,雅顿利夫纳特,圣菲·M·梅斯特（Stéphane M.Meystre）:
半自动化本体管理（SEAM）系统的自动概念和关系提取。 15
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雨果·勒鲁,劳伦·勒福特:
使用CDISC标准和语义统计词汇对纵向临床研究数据进行语义丰富。 16
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艾琳·帕帕西奥多罗,安妮卡·奥利希,达米安·斯梅德利:
通过通路信息将基因表达与表型联系起来。 17
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雷纳·温恩伯格（Rainer Winnenburg）,阿尔弗雷德·索贝洛,奥利维尔·博登瑞德:
在课堂上探索药物不良事件。 18
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李·彼得斯,内森·J·巴尔,奥利维尔·博登瑞德:
评估NDF-RT和DrugBank中的药物相互作用信息。 19
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丽贝卡·阿尔姆,达格马尔·沃尔特马,马库斯·沃尔芬恩,奥拉夫·沃尔肯豪尔,罗恩·汉克尔:
从一组SBML模型中提取基于注释的特征。 20
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都铎·格罗扎,塔妮娅·塔多拉奇,彼得·罗宾逊,安德烈亚斯·赞克:
从多个来源获取领域知识：罕见的骨骼疾病用例。 21
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艾琳娜·佩特洛娃,岳马,乔治·萨萨罗尼斯（George Tsatsaronis）,玛丽亚·基萨,费利克斯·迪斯特尔,弗兰兹·巴德,迈克尔·施罗德:
从文本定义形式化生物医学概念。 22
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穆罕默德·阿米思,杨功,雷切尔·坎宁安,朱莉·布姆,崔涛:
开发VISO：用于患者教育的疫苗信息声明本体。 23
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奈杰尔·科利尔,安妮卡·奥利希,都铎·格罗扎:
表型和疾病的概念选择使用学习排序。 24
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迈克尔·J·凯雷利,马塞洛·菲兹曼,韩章（Han Zhang）,托马斯·里德夫莱斯:
神经损伤语义预测网络，用于识别轻度创伤性脑损伤的生物标记物。 25
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维克托·克里斯滕,迈克尔·哈顿,Anika Groß:
区域进化eXplorer-用于发现本体区域中的进化趋势的工具。 26
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佩吉·塞利尔,蒂埃里·查诺伊斯,马克·普兰特维特,克里斯托夫·里戈蒂,布鲁诺·克雷米尔,奥利维尔·甘迪里隆,基里·克莱马,Jean-Luc芒果:
序列模式挖掘用于从生物医学文本中发现基因交互及其上下文信息。 27
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德克·威森伯恩,迈克尔·施罗德,乔治·萨萨罗尼斯（George Tsatsaronis）:
发现间接联系的生物医学概念之间的关系。 28
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杰兰特鸭,阿列克桑达尔·科瓦切维奇,大卫·罗伯逊,史蒂文斯,戈兰·内纳迪奇:
生物信息学中数据库和软件名称的模糊性和可变性。 29
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铃木朝美,Takako Takai-Igarashi塔卡伊加拉什,中谷俊一,田中浩:
牙周炎本体论的发展。 30
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阿米尔·H·亚洲人,托德·明宁,Prashant Doshi公司,里克·L·塔尔顿:
一个基于本体论的问答框架及其在寄生虫免疫学中的应用。 31
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菲奥娜·坎宁安,巴里·摩尔,妮可·鲁伊斯·舒尔茨,格雷厄姆·里奇,凯伦·艾尔贝克:
改进基因组变体注释的序列本体术语。 32
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张玉吉（Yuji Zhang）,吴普强,伊洛,崔涛:
VAERS中疫苗不良事件关联网络中性别相关网络模式的识别。 33
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Irena Spasic公司,赵波（音译）,克里斯托弗·琼斯,凯特·巴顿:
KneeTex：一个本体论驱动的系统，用于从MRI报告中提取信息。 34
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米哈伊尔·莱文,林赛·G·考威尔:
owlcpp：用于处理OWL本体的C++库。 35
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皮埃尔·伊夫·拉巴图,贝诺特马萨诸塞州,费德里科·尤利安纳,玛丽·克里斯汀·罗塞特,达米安·罗默,让-克洛德·莱昂,奥利维尔·帕洛姆比:
我的Corporis Fabrica胚胎：基于本体论的人类胚胎发育三维时空建模。 36
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于林,左双香,何永群:
基于本体的宿主-布鲁氏菌相互作用的表示和分析。 37
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藤原富美,山本雅素:
Colil：生命科学领域中引用上下文的数据库和搜索服务。 38
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杰西·范·达姆,贾斯珀·科霍斯特,彼得·沙普,维托尔·马丁斯·多斯·桑托斯,玛丽亚·苏亚雷斯-迪兹:
RDF2Graph是一个用于恢复、理解和验证RDF资源本体的工具。 39
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拉里萨·索尔达托娃,奈杰尔·科利尔,安妮卡·奥利希,都铎·格罗扎,卡林·弗斯普尔,菲利普·罗卡·塞拉,米歇尔·杜蒙蒂尔,尼甘·沙阿:
生物个体学和表型专题。 40
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亚历山大·乌西特利,海因里希·赫雷:
OntoStudyEdit：临床和流行病学研究中基于本体的元数据表示和管理的新方法。 41

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