2019年第24届PSB:美国夏威夷州夏威夷大岛
俄罗斯·B·奥尔特曼 , A.基思·邓克 , 劳伦斯·亨特 , 玛丽琳·里奇 , 泰瑞·E·克莱恩 :
2019年生物计算:太平洋研讨会论文集,美国夏威夷夏威夷大岛,2019年1月3日至7日。 2019
生物医学数据中的模式识别: 让大数据发挥作用的挑战
Shefali Setia Verma公司 , 阿努拉格·维玛 , Dokyoon Kim公司 , 克里斯蒂安·达拉布斯 :
课程介绍。 1-7 布雷特·博利尤·琼斯 , 艾萨克·科哈内 , 安德鲁·L·梁 :
学习医学概念的上下文层次结构和彭加莱嵌入以阐明表型。 8-17 黛西·伊丁 , 克洛伊·辛普森 , 斯蒂芬·普福尔 , 戴夫·凯尔 , 肯尼思·荣格 , 尼甘·沙阿 :
利用电子健康记录数据进行多任务学习的有效性。 18-29 芮端 , 玛丽·里贾娜·博兰德 , 杰森·H·摩尔 , 陈勇(音) :
ODAL:一种一次性分布式算法,用于对来自多个临床站点的电子健康记录数据进行逻辑回归。 30-41 麦克斯·高登 , 克兰诺斯·威廉姆斯 :
使用卷积自动编码器和随机森林分类器检测PVC。 42-53 王浩涵 , 吴正林 , 埃里克·P·星 :
去除深度神经网络中与混淆因素相关的权重提高了医疗保健应用的预测精度。 54-65 姜月旭 , 王多林 , 董旭 :
DeepDom:使用堆叠双向从序列单独预测蛋白质结构域边界。 66-75 郑刘 , 姚瑶 , 齐伟 , 本杰明·威德 , 斯蒂芬·A·拉姆齐 :
Res2s2aM:基于深度残差网络的模型,用于识别trait-associated区域中的功能性非编码SNP。 76-87 何贝 , Byunghan Lee先生 , 孙永权(Sunyoung Kwon) , Sungroh Yoon公司 :
使用深度递归神经网络进行DNA隐写分析。 88-99 阿琼·玛格(Arjun Magge) , 戴维·魏森巴赫 , 阿贝德·萨克 , 马修·斯科奇 , 格雷西拉·冈萨雷斯-赫南德斯 :
生物医学文献中地理位置提取的双向递归神经网络模型。 100-111 王浩涵 , 刘翔(音) , 陶一峰 , 叶文婷 , 乔金 , 威廉·科恩 , 埃里克·P·星 :
基于深度强化学习的类人自动挖掘和构建可靠的遗传关联数据库。 112-123 拉希卡·拉莫拉 , 山塔努耆那教 , Predrag Radivojac公司 :
在正标记学习中评估分类准确性:特征描述和纠正策略。 124-135 基利·格雷姆 , 维伦娜·弗里德尔 , 凯瑟琳·胡拉汉 , 约书亚·M·斯图亚特 :
血小板:癌症药物敏感性预测的多视角学习预测框架。 136-147 瑞秋·M·派克 , 拉斐尔基因 , 亚历山大·哈拉里 , 乔治·库科斯 , 大卫·格菲勒 , 汉娜·卡特 :
计算KIR拷贝数发现揭示了抑制性受体负荷和存活之间的相互作用。 148-159 布莱克·派曼 , 阿里雷扎·塞奇奇 , Shekoofeh阿齐兹 , 凯瑟琳·泰瑞什金 , 尼尔·伦威克 , 帕文·穆萨维 :
使用Context-Aware Deep Cancer分类器探索癌症的microRNA调控。 160-171 李凯文(Kevin Li) , 陈瑞秋(Rachel Chen) , 威廉·林赛 , 亚伦·A·贝斯特 , 马修·德容 , 克里斯托弗·亨利 , 内森·L·廷特 :
实施和评估用于从TnSq数据中识别基因功能的高斯混合框架。 172-183 桑卡拉·阿南德 , 劳丽娜斯·卡莱申斯卡斯 , 克雷格·斯梅尔 , 谷川洋介 :
SNPs2ChIP:ChIP-seq的潜在因子,用于推断非编码SNP的功能。 184-195 Tsui先生 , 米歇尔·道 , 迪伦·斯科拉 , 汉娜·卡特 :
从序列读取档案中运行的250000人测序中提取等位基因读取计数。 196-207 阿鲁尼玛·斯利瓦斯塔瓦 , 拉瓦利·阿杜斯米利 , 亨特·博伊斯 , 丹尼尔·加里霍 , 瓦伦·拉特纳卡 , 拉吉夫·马亚尼 , 余冠威 , 拉胡·马奇拉朱 , 尤兰达·吉尔 , 帕拉格·马利克 :
基准测试挑战的语义工作流:增强可比性、可重用性和再现性。 208-219
精准医学: 通过对个人数据的高分辨率分析改善健康状况
史蒂文·布伦纳 , 玛莎·布利克 , 达纳·C·克劳福德 , 吉尔·P·梅西洛夫 , 亚历山大·摩根 , Predrag Radivojac公司 :
课程介绍。 220-223 佩顿·格林赛德 , 贾斯汀·佐克 , 马克·萨利特 , 马德琳·L·库勒 , 瑞安·波普林 , 马克·德普里斯托 :
CrowdVariant:一种对拷贝数变体进行分类的众包方法。 224-235 Wontack汉 , 叶玉珍 :
使用微生物组数据预测宿主表型的与人类健康和疾病相关的微生物标记基因库。 236-247 知岳汤姆·胡 , 叶玉婷 , 帕特里克·A·纽伯里 , 黄海燕 , 陈斌(Bin Chen) :
AICM:纠正大型药物基因组学数据集之间不一致的真正框架。 248-259 玛雅瓦尔马 , 凯利·玛丽·帕斯科夫 , Jae-Yoon Jung先生 , Brianna Sierra克里斯曼 , 内特·泰勒·斯托克汉姆 , 彼得·伊吉坎·华盛顿 , 丹尼斯·保罗·沃尔 :
外组机器学习方法识别与自闭症谱系障碍相关的非编码DNA中的单核苷酸变异。 260-271 张新元 , Yogasudha Veturi瑜伽 , Shefali Setia Verma公司 , 威廉伯恩 , 阿努拉格·维玛 , 阿纳斯塔西亚·卢卡斯 , 斯科特·赫布林 , 约书亚·C·丹尼 , 伊恩·斯坦纳韦 , 盖尔·贾维克 , 大卫·R·克罗斯林 , 埃里克·拉森 , 劳拉·拉斯穆森-托维克 , 莎拉·彭德格拉斯 , 乔丹·W·斯莫勒 , 哈科·哈科纳森 , 帕特里克·斯莱曼 , 翁春华 , 大卫·法塞尔 , 魏启伟 , 伊夫蒂哈尔·库洛 , 丹尼尔·J·沙伊德 , 温迪·钟(Wendy K.Chung) , 玛丽琳·里奇 :
利用eMERGE网络中43870名个体的单变量、双变量和多变量方法检测心血管和神经疾病的潜在多效性。 272-283 德里克·雷曼 , 灵岛沙 , 欧文·何(Irvin Ho) , 蒂莫西·谭 , 刘丹妮丝 , 阿利·汗 :
融合RNA表达和视觉特征用于免疫浸润预测。 284-295 李炳兰 , Yogasudha Veturi瑜伽 , 布拉德福由纪子 , Shefali S.Verma公司 , 阿努拉格·维玛 , 阿纳斯塔西亚·卢卡斯 , 大卫·W·哈斯 , 玛丽琳·D·里奇 :
组织背景对预测转录组全关联研究中基因优先顺序的影响。 296-307 弗朗西丝卡·维塔利 , 乔安娜·贝格霍特 , Jung-wei Fan公司 , 李建荣 , 李启科 , 李海泉 , 伊夫·卢西尔 :
通过基于收敛eQTL的分子和靶向独立疾病相关多态性的途径精确地重新调整药物用途。 308-319 李方成 , 尼兰贾尼·普拉萨德 , 芭芭拉·E·恩格尔哈特 :
重症监护病房患者实验室测试的最佳政策。 320-331
单细胞分析,未来是什么?
拉娜·X·加米尔 , 郭成元 , 荣凡 , Gene W.Yeo先生 , 约翰·奎肯布什 :
课程介绍。 332-337 杨晨 , 张玉平 , 郑庆欧阳 :
LISA:精确重建大量单细胞RNA-seq数据的细胞轨迹和伪时间。 338-349 王同心 , 特拉维斯·S·约翰逊 , 张杰(音译) , 黄坤(Kun Huang) :
高维单细胞RNA序列数据可视化和分析的拓扑方法。 350-361 胡奇文 , 凯西·S·格林 :
参数调整是单细胞RNA转录组学中通过深度变分自编码降低维数的关键部分。 362-373 麦克斯韦P.金 , 亚历山大·勒奈尔 , 欧内斯特·弗伦克尔 :
用于基因集投影的浅备用连接自动编码器。 374-385
当生物学变得个性化时: 生物大数据中隐私和道德的潜在挑战
Gamze Gürsoy游戏 , 阿里夫·奥兹贡·哈曼奇 , 海旭汤 , 埃尔曼·艾迪 , 史蒂文·布伦纳 :
课程介绍。 386-390 安吉拉·加斯达斯卡 , 德里克的朋友 , 陈瑞秋(Rachel Chen) , 杰森·韦斯特拉 , 马修·扎维斯托夫斯基 , 威廉·林赛 , 内森·L·廷特 :
利用汇总统计数据推断大型生物库中的复杂表型。 391-402 肖恩·西蒙斯 , 邦妮·伯杰 , 塞克·萨赫纳尔普 :
利用概率建模保护基因组数据隐私。 403-414 基普·W·约翰逊 , 杰西卡·德·弗雷塔斯 , 本杰明·格利克斯伯格 , 杰森·博贝 , 乔尔·达德利 :
使用实验室测试指令评估患者重新识别,并通过潜在空间变量进行缓解。 415-426 梅根·多尔 , 希拉·格雷森 , 莎拉·摩尔 , 克里斯汀·苏弗 , 约翰·威尔班克斯 , 珍妮弗·瓦格纳 :
为我们所有人研究项目实施普遍知情同意程序。 427-438
研讨会
马丁·塞内维拉滕(Martin G.Seneviratne) , 迈克尔·G·卡恩 , 蒂娜·埃尔南德斯·布沙德 :
合并异构临床数据以实现知识发现。 439-443 乔安妮·贝尔格特 , 伊夫·卢西尔 , 弗朗西丝卡·维塔利 , 玛莎·布利克 , 玛丽塞尔·甘恩 , 杰森·H·摩尔 :
解读基因:高通量解读非编码DNA。 444-448 格雷西拉·冈萨雷斯 , 卢志勇 , 罗伯特·利曼 , 戴维·魏森巴赫 , 玛丽·里贾娜·博兰德 , 陈勇(音) , 荆城渡 , 朱利安·弗拉克 , 凯西·S·格林 , 约翰·霍姆斯 , 阿迪蒂亚·卡西亚普 , 里克·林尼曼·尼尔森 , 郑庆欧阳 , 塞巴斯蒂安·沙夫 , 杰林·塔罗尼 , 崔涛 , 张玉平 , 刘洪芳 :
精确医学的文本挖掘和机器学习。 449-454 伊夫·卢西尔 , 阿图·J·巴特 , 李海泉 , 陈荣(音) , 杰森·H·摩尔 :
人口健康的翻译信息学:生物分子和临床数据集的结合程度。 455
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