从QC到基因预测和系统发育学
BUSCO v5.7.0是当前的稳定版本! 吉特拉布 ,一个公寓套餐 和Docker容器 也可以使用。
基于对近通用单拷贝同源基因的基因含量的进化预期,BUSCO度量是对N50等技术度量的补充。
BUSCO被选为SIB 2021年的显著成果 !
描述了BUSCO v4和v5中引入的新功能以及新的BUSCO数据集(*_odb10)的最新BUSCO论文在这里 。如果您使用过这些版本或数据集,正确的引用将是: MosèManni、Matthew R Berkeley、Mathieu Seppey、Felipe A Simão、Evgeny M Zdobnov、,BUSCO更新:新的、简化的工作流,以及更广泛和更深入的系统发育覆盖率,用于真核、原核生物和病毒基因组的评分. 分子生物学与进化,第38卷,第10期,2021年10月,第4647–4654页
以下协议涵盖了各种BUSCO运行模式和工作流、BUSCO设置、解释结果的指南以及其他分析,例如,用于构建系统发育树和使用BUSCO结果可视化同系物: Manni,M.、Berkeley,M.R.、Seppey,M.和Zdobnov,E.M.(2021年)。BUSCO:评估基因组数据质量及其他。 当前协议,1,e323。doi:10.1002/cpz1.323
BUSCO软件是根据MIT许可证授权的。
BUSCO数据集根据知识共享署名-非衍生产品4.0国际许可证获得许可。要查看此许可证的副本,请访问http://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/或致函创意共享,邮政信箱1866,Mountain View,CA 94042,USA。
在出版物或产品中使用这些数据集进行分析时,必须包括相应论文的引用:https://doi.org/10.1093/molbev/msab199网址 .
完整的安装说明见用户指南和协议 .
BUSCO提供了conda包和Docker映像。这两个版本都可以开箱即用。或者,也可以手动安装BUSCO。
BUSCO软件直接下载必要的数据集,无论这些数据集是由用户指定的还是由BUSCO自动选择的。
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早期版本:第4版 ,第3版 ,第2版 ,第1版
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