浏览基因之间的调控联系

监管概述使您能够浏览以下监管网络:枯草杆菌并覆盖基因表达值等实验数据。

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浏览新陈代谢网络枯草杆菌

Cellular Overview(细胞概览)可让您浏览枯草杆菌搜索你最喜欢的酶或代谢物,找出它在全局中的位置。

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浏览枯草芽孢杆菌基因组

在基因组浏览器中搜索您最喜欢的基因,并了解其在基因组中的邻居。

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使用SmartTables创建和管理物品列表

SmartTables允许您生成、分析和转换对象列表(基因、酶、路径等)。

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SmartTable示例

BsubCyc概述

BsubCyc是细菌的模型生物数据库枯草芽孢杆菌并基于更新的枯草杆菌168基因组序列及注释Barbe等人。2009年。当有新的文献可用时,基因功能注释正在更新。

BsubCyc也是更大的BioCyc集合的一部分,该集合包含数千个用于测序基因组的路径/基因组数据库,包括60多个枯草芽孢杆菌菌株。单击上面的“更改当前数据库”按钮以浏览可用的数据库。

用户指南

人们在说什么

“BsubCyc是一种极具价值的工具。”

宾夕法尼亚州立大学

保罗·巴比茨克
生物化学教授
&分子生物学

“我的实验室每天都会使用这些资源。”

威斯康星大学

Patricia Kiley,
教授兼主席,
生物分子化学系

“我们几乎每天都依赖BioCyc的基因页面和概览图。”

明尼苏达大学

阿尔卡迪·霍杜斯基
生物化学助理教授

“我们广泛使用BioCyc和MetaCyc来研究我们研究的生物体的代谢和调节过程。”

太平洋西北国家实验室

William Cannon,团队负责人
计算生物学

“BioCyc是银杏科学家的知识和工具的go-to资源。”

银杏生物工厂

“BioCyc是代谢组学中通路分析的巨大资源。”

佐治亚大学

遗传系艺术爱迪生

“我们广泛使用BioCyc全代谢网络图进行组学数据分析。”

五大湖生物能源

Timothy J.Donohue,董事

“我还没有找到另一个比BioCyc界面更好的数据库。”

密歇根大学

Gary B.Huffnagle教授
微生物学和免疫学

学习型图书馆

教程系列

教程#1:BioCyc简介
这六个顺序片段,为您提供BioCyc系列的简明导游咬。要下载或查看,只需单击其中一个链接在每个片段的名称后面。
教程#2:SmartTables简介
以下教程将指导您完成SmartTables,它使您能够创建、上传、共享和分析一组基因、代谢物、通路和序列位点。本教程分为几个部分,从基本操作到更高级的使用,例如作为基因表达分析和代谢组学。要下载或查看,请单击以下链接之一。
教程#3:动物代谢图、比较工具、监管网络
本教程向用户介绍BioCyc.org网站上提供的许多高级工具,用于导航细胞网络、分析大规模数据集和比较生物体。
教程#4:Omics数据分析
本教程将向您展示如何使用BioCyc的工具进行组学数据分析,包括细胞组学查看器、组学仪表板和其他工具。
教程#5:Pathway拼贴
Pathway拼贴是可以自定义的多路径图例如,通过叠加经济数据,改变相对路径的位置,以及修改路径之间的连接。了解如何生成、自定义和导出显示用户指定路径集合的高质量路径拼贴图。
教程#6:创建路径/基因组数据库
教程#7:使用结构化高级查询页面
结构化高级查询页面简介,它允许中一个或多个数据库的复杂查询和查询BioCyc收集。您将了解:设置高级查询的基本步骤;四个日益复杂的查询示例,包括如何跨多个数据库进行查询;哪里可以了解更多有关BioCyc数据库结构的信息。