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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
百万英镑9 第4b类
序列长度(AA) 分子量(Da)
730 80535
蛋白质名称
基质金属蛋白酶-9
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSPWQPLLA公司 LLAFGCSSAA公司 PYQRQPTFVV公司 FPKDLKTSNL公司 TDTQLAEAYL公司
60 70 80 90 100
YRYGYTRAAQ公司 MMGEKQSLRP公司 ALLMLQKQLS公司 LPQTGELDSQ公司 TLKAIRTPRC公司
110 120 130 140 150
GVPDVGRFQT公司 FKGLKWDHHHN公司 ITYWIQNYSE公司 DLPRDMIDDA公司 FARAFAVWGE公司
160 170 180 190 200
VAPLTFTRVY公司 gpeadviqf公司 GVAEHGDGYP公司 FDGKDGLLAH公司 AFPPGAGVQG公司
210 220 230 240 250
达赫福德 SLGKGVVIPT公司 yygnnsngapc公司 HFPFTFEGRS公司 YSACTTDGRN公司
260 270 280 290 300
DGTPWCSTTA公司 DYDKDGKFGF公司 CPSERLYTEH公司 GNGEGKPCVF公司 PFIFEGRSYS公司
310 320 330 340 350
ACTTKGRSDG公司 YRWCATTANY公司 DQDKLYGFCP公司 TRVDATVVGG公司 NSAGELCVFP公司
360 370 380 390 400
FVFLGKQYSS公司 CTSDGRRDGR公司 LWCATTSNFD公司 TDKKWGFCPD公司 QGYSLFLVAA公司
410 420 430 440 450
HEFGHALGLD公司 HSSVPEALMY公司 PLYSYLEGFP公司 LNKDDIDGIQ公司 YLYGRGSKPD公司
460 470 480 490 500
PRPPATTTE公司 PQPTAPPTMC公司 PTIPPTAYPT公司 VGPTVGPTGA公司 PSPGPTSSPS公司
510 520 530 540 550
PGPTGAPSPG公司 PTAPPTAGS公司 EASTESLSPA公司 DNPCNVDVFD公司 艾伊克加尔
560 570 580 590 600
FFKDGWYWKF公司 LNHRGSPLQG公司 PFLTARTWPA公司 LPATLDSAFE公司 DPQTKRVFF公司
610 620 630 640 650
总质量 KTVLGPRSLD公司 KLGLGPEVTH公司 VSGLLPRRLG公司 KALLFSKGRV公司
660 670 680 690 700
WRFDLKSQKV电源 DPQSVIRVDK公司 EFSGVPWNSH公司 DIFQYQDKAY公司 FCHGKFWR公司V(V)
710 720 730
S公司F类N个E类V(V)N个K虚拟磁盘 HEVNQVDDVG公司 YVTYDLLQCP公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-4047的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
百万英镑9
顺序
VSFQNEVNK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
700
肽末端
708
CPTAC标识
非CPTAC-4047
肽分子质量
1,063.5298
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
紫外线基因组BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

化验参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(2+) 9.1 8.2 7.2 11.6 11.3 11.4 14.7 14 13.5 14 15 15
y2(1+) 19.6 7.5 15.6 21.1 7 17.5 28.8 10.3 23.4 14 15 15
y6(1+) 13.2 11.4 8.3 14.5 10.1 10.7 19.6 15.2 13.5 14 15 15
7岁(1+) 6.4 11.6 8.7 8.9 12 11.1 11 16.7 14.1 14 15 15
8岁(1+) 8.2 9.2 5.2 12.4 12 8.4 14.9 15.1 9.9 14 15 15
总和 3.7 6.8 5.8 7.1 9.4 9.8 8 11.6 11.4 14 15 15


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