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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
平均值 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
168 17900
蛋白质名称
血管加压素-神经生长素2-哥本哈根
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MLARMLNTTL公司 SACFLSLLAF公司 SSACYFQNCP公司 RGGKRAISDM公司 ELRQCLPCGP公司
60 70 80 90 100
GGKGRCFGPS ICCADELGCF公司 VGTAEALRCQ公司 EENYLPSPCQ公司 SGQKPCGSGG公司
110 120 130 140 150
RCAAVGICCS公司 DESCVAEPEC公司 HDGFFRLTRA公司 REPSNATQLD公司 GPARALLLR公司L(左)
160 168
V(V)L(左)A类G公司T型ESV公司 DSAKPRVY公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3931的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
平均值
顺序
LVQLAGTR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
150
肽末端
157
CPTAC标识
非CPTAC-3931
肽分子质量
856.5131
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 9.4 2.7 5.1 9.1 4 7.3 13.1 4.8 8.9 15 15 15
y6(2+) 19.4 8.7 3.6 21.2 9.6 7 28.7 13 7.9 15 15 15
y4(1+) 17.8 10.6 4.9 20.9 12.1 8.5 27.5 16.1 9.8 15 15 15
y5(1+) 19.8 5.9 4.9 18.9 10.3 8 27.4 11.9 9.4 15 15 15
y6(1+) 11 4.8 5.4 7.9 7 6.9 13.5 8.5 8.8 15 15 15
总和 7 2.8 1.9 7.9 5.8 5.8 10.6 6.4 6.1 15 15 15


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