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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
第7层 抄送7
序列长度(AA) 分子量(Da)
446 50276
蛋白质名称
凝血因子VII
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MVPQAHGLL公司 LCFLLQLQGP公司 LGTAVFITQE公司 EAHGVLHRQR公司 兰斯莱尔
60 70 80 90 100
PGSLERECNE公司 EQCSFEEARE公司 IFKSPERTKQ公司 FWIVYSDGDQ公司 CASNPCQNGG公司
110 120 130 140 150
TCQDHLKSYV公司 CFCLLDFEGR(CFCLLD废气再循环) NCEKSKNEQL公司 ICANENGDCD公司 QYCRDHVGTK公司
160 170 180 190 200
RTCSCHEDYT公司 LQPDEVSCKP公司 KVEYPCGRIP公司 VVEKRNSSR公司 QGRIVGGNVC公司
210 220 230 240 250
PKGECPWQAV公司 LKINGLLLCG公司 AVLLDARWIV公司 TAAHCFDNIR公司 YWGNITVVMG公司
260 270 280 290 300
EHDFSEKDGD公司 EQVRRVTQVI公司 MPDKYIRGKI公司 NHDIALLRH公司 RPVTFTDYVV型
310 320 330 340 350
PLCLPEK公司S公司F类S公司 E类N个T型一个R(右)IRFS公司 RVSGWGQLLD公司 RGATALELMS公司 IEVPRLMTQD软件
360 370 380 390 400
克利哈克森 TPKITENMFC公司 AGYMDGTKDA公司 CKGDSGGPHA公司 THYHGTWYLT公司
410 420 430 440 446
GVVSWGEGCA公司 AIGHIGVYTR公司 VSQYIDWLVR公司 HMDSKLQVGV型 油炸锅

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3914的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
第7层
顺序
SFSENTLAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
308
肽末端
316
CPTAC标识
非CPTAC-3914
肽分子质量
1023.4985美元
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流量
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 6.8 5.6 5 7 5.3 8.2 9.8 7.7 9.6 15 15 15
y6(1+) 20 8.9 10.6 17.4 10.3 13.6 26.5 13.6 17.2 15 15 15
y5(1+) 11.7 7.2 8.5 11.5 11.4 9.8 16.4 13.5 13 15 15 15
y4(1+) 35 8.4 9.4 48.6 9.7 14.4 59.9 12.8 17.2 15 15 15
7岁(2+) 23 15.3 9.4 35.1 16.8 14 42 22.7 16.9 15 15 15
总和 8 4.4 3.8 8.9 5.8 8.2 12 7.3 9 15 15 15


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