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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
精氨酸1 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
323 34808
蛋白质名称
精氨酸酶-1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSSKPKSLEI公司 IGAPFSKGQP公司 RGGVEKGPAA公司 LRKAGLLEKL公司 凯蒂·德沃德
60 70 80 90 100
GDLAFVDVPN DSSFQIVKNP公司 RSVGK公司N个E类E类L(左) G公司V(V)V(V)E类V(V)K(K)N个 GRVSVVLGGD型
110 120 130 140 150
HSLAVGSISG公司 收割机 IWWDAHTDIN公司 TPLTTSSGNL公司 HGQPVSFLL公司
160 170 180 190 200
ELKGKFPDVP公司 GFSWVTPCIS公司 AKDIVYIGLR公司 D类V(V)D类P(P)G公司E类H(H)Y(Y) K(K)TLGIKYFSM公司
210 220 230 240 250
TEVDKLGIGK公司 VMEETFSYLL公司 GRKKRPIHLS公司 FDVDGLDPAF公司 TPATGTPVLG公司
260 270 280 290 300
GLSYREGLYI公司 TEEIYKTGLL针织衫 SGLDIMEVNP公司 TLGKTAEEVK公司 STVNTAVALT公司
310 320 323
LACFGTQREG公司 NHKPGTDYLK公司 PPK公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-6041的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ARG1公司
顺序
DVDPGEHYILK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
181
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-6041型
肽分子质量
1,284.6350
物种
人类
分析类型
富集MRM
富集方法
IMAC公司
矩阵
FFPE肺肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Whiteaker JR、Zhao L、Schoenherr RM、Huang D、Lundeen RA、Voytovich U、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Perry CD、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Chowdhury S、Vandermeer J、Smith SD、Gopal AK、Ramchurren N、Fling SP、Wang P、Paulovich AG。用于量化免疫调节蛋白的多重分析支持免疫治疗临床试验的相关研究。前Oncol。2023年5月2日;13:1168710. doi:10.3389/fonc.2023.1168710。PMID:37205196;预防性维修识别码:PMC10185886。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C末端K处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
0.3µL/min

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 32.7 22.3 18 40.3 27.6 26.2 51.9 35.5 31.8 15 15 15
y5(1+) 50.3 36.6 28 54.7 42.4 27.7 74.3 56 39.4 15 15 15
7岁(1+) 33 18.3 17.4 44.3 33.8 26.8 55.2 38.4 32 15 15 15
y8(2+) 25.5 12.8 11 28.7 22.8 15.7 38.4 26.1 19.2 15 15 15
9岁(2+) 17.5 17.1 15.4 25.1 24.9 18.4 30.6 30.2 24 15 15 15
总和 20.5 12.8 11.7 25.2 22.3 16.1 32.5 25.7 19.9 15 15 15


其他资源和评论


非CPTAC-3893的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
精氨酸1
顺序
阿内拉格瓦耶夫克
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
76
肽末端
89
CPTAC标识
非CPTAC-3893
肽分子质量
1,455.7569
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 8.5 4.2 5.7 15.2 9.5 6.3 17.4 10.4 8.5 15 15 15
y8(1+) 11.4 5.4 4.6 19.7 8.4 6.8 22.8 10 8.2 15 15 15
y6(1+) 14.2 9.8 6.1 17.4 11.4 7.1 22.5 15 9.4 15 15 15
b4(1+) 24.8 8.7 11.3 25.4 12.5 11.6 35.5 15.2 16.2 15 15 15
b5(1+) 11.9 12.4 4.5 22 12.8 7.7 25 17.8 8.9 15 15 15
总和 8.9 3.5 3.3 16.3 7.6 4.4 18.6 8.4 5.5 15 15 15


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