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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
Eif4b型 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
611 68840
蛋白质名称
真核翻译起始因子4B
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MAASAKKNK公司 KGKTISLTDF公司 LAEDGGTGG公司 STYVPKPVSW系列 ADETDDLEGD公司
60 70 80 90 100
VSTTWHSNDD公司 DVYRAPPIDR(数字视频处理器) S公司L(左)P(P)T型P(P)R(右)AA公司 REPNIDRSRL公司 PKSPPYTAFL公司
110 120 130 140 150
GNLPYDVTED公司 SIKDFFRGLN公司 ISAVRLPREP公司 SNPDRLKGFG公司 雅费得SL
160 170 180 190 200
LSALSLNEES公司 LGNRRIRVDV病毒 ADQAQDKDRD公司 DRSFGRDRNR公司 DSDKTDTDWR公司
210 220 230 240 250
ARPTTDSFDD机场 YPPRRGDDSF公司 GDKYRDRYDS公司 干石膏 YRDGPRRDMD年
260 270 280 290 300
瑞格瑞德 RGSRDYDRGY公司 DSRIGSGRRA公司 FGSGYRRDDD公司 YRGGGDRYED公司
310 320 330 340 350
RYDRRDDRSW公司 SSRDDYSRDD公司 YRRDDRGPPQ公司 RPRLNLKPRS系统 APKEDDASAS公司
360 370 380 390 400
TSQSSRAASI公司 FGGAKPVDTA公司 阿雷雷维尔 QKEQEKLQRQ公司 LDEPKLDRRP公司
410 420 430 440 450
RERHPSWRSE公司 ETQERSRT公司 GSESSQTGAS公司 ATSGRNTRRR公司 ESEKSLENET公司
460 470 480 490 500
LNKEEDCHSP公司 TSKPPKPDQP公司 LKVMPAPPK公司 ENAWVKRSSN公司 PPARSQSSDT公司
510 520 530 540 550
EQPSPTSGG公司 KVAAVQPPEE公司 GPSRKDGNKV公司 DVVGATQGQA公司 GSCSRGPGDG公司
560 570 580 590 600
GSRDHWKDLD公司 RKDGKKDQDS公司 RSAPEPKKPE公司 ENPASKFSSA公司 SKYAALSVDG公司
610 611
EDEDEGDDCT公司 E类

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3827的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
Eif4b型
顺序
SILPTAPR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
71
肽末端
78
CPTAC标识
非CPTAC-3827
肽分子质量
853.5022
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 15 4.4 3.1 17 8 3.4 22.7 9.1 4.6 15 15 15
b2(1+) 8.2 4.6 5.2 14.2 10 6.1 16.4 11 8 15 15 15
y5(2+) 10.3 7.7 2.2 12.7 10.8 4.8 16.4 13.3 5.3 15 15 15
y6(2+) 18.9 5 4.2 14 9.1 4.5 23.5 10.4 6.2 15 15 15
y5(1+) 9.8 3.4 2.4 12 9.8 6.3 15.5 10.4 6.7 15 15 15
总和 4.3 2.3 1.8 9 8.4 4.4 10 8.7 4.8 15 15 15


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