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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
谷氨酸1 胶水
序列长度(AA) 分子量(Da)
558 61337
蛋白质名称
谷氨酸脱氢酶1,线粒体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MYRRLGEALL公司 LSRAGPAALG公司 SAAADSAALL公司 GWARGQPSAA公司 PQPGLTPVAR公司
60 70 80 90 100
RHYSEAAADR公司 EDDPNFFKMV公司 EGFFDRGASI公司 VEDKLVEDLK公司 TRESEEQKRN公司
110 120 130 140 150
RVRGILRIIK公司 PCNHVLSLSF公司 皮尔德格斯韦 VIEGYRAQHS公司 QHRTPCKGGI公司
160 170 180 190 200
RYSTDVSVDE公司 VKALASLMTY公司 KCAVVDVPFG公司 GAKAGVKINP公司 KNYTDNELEK公司
210 220 230 240 250
ITRRFTMELA公司 KKGFIGPGID公司 VPAPDMSTGE公司 补救措施 阿斯蒂格海丁
260 270 280 290 300
AHACVTGKPI公司 平方英寸 ATGRGVFHGI公司 神经衰弱 SILGMTPGFG公司
310 320 330 340 350
DKTFVVQGFG公司 NVGLHSMRYL公司 HRFGAKCVGV公司 GESDGSIWNP公司 DGI键
360 370 380 390 400
FKLQHGSILG公司 FPKAKVYEGS公司 ILEADCDILI公司 PAASEKQLTK公司 SNAPRVKAKI公司
410 420 430 440 450
IAEGANGPTT公司 PEADKIFLER公司 NIMVIPDLYL公司 NAGGVTVSYF公司 EWLKNLNHVS公司
460 470 480 490 500
YGRLTFKYER公司 DSNYHLLMSV公司 QESLERKFGK公司 H(H)G公司G公司T型P(P)V(V)V(V)P(P)T型 A类E类F类D类R(右)ISGA公司
510 520 530 540 550
SEKDIVHSGL公司 AYTMERSARQ公司 IMRTAMK公司Y(Y)N个L(左) G公司L(左)D类L(左)R(右)T型A类A类Y(Y)V(V) N个A类E类K(K)VFKVY(变频调速)
558
NEAGVTFT公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷酸化SitePlus®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3785的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
粘合1
顺序
YNLGLDLR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
528
肽末端
535
CPTAC标识
非CPTAC-3785
肽分子质量
962.5185
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y2(1+) 7.5 4.4 9.3 8 8.5 11.9 8.5 9.6 15 15 15
y4(1+) 13.9 6.2 8.4 15.3 12.2 11.6 20.7 13.7 14.3 15 15 15
y5(1+) 6.4 7.7 6.3 9.4 10 7.1 11.4 12.6 9.5 15 15 15
y6(1+) 8.3 6.3 8.1 12.5 8.8 9.5 15 10.8 12.5 15 15 15
b2(1+) 7.3 4.4 6.7 11.5 7.3 7.5 13.6 8.5 10.1 15 15 15
总和 3.9 2.9 2.8 8.4 7.1 5.5 9.3 7.7 6.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2725的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
总账1
顺序
HGGTIPIVPTAEFQDR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
481
肽末端
496
CPTAC标识
CPTAC-2725型
肽分子质量
1,736.8846
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher Q-Exactive公司
内部标准
柱上13 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C和15N R
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b5(1+) 8.1 5.4 6.9 8.1 6.5 7.1 11.5 8.5 9.9 15 15 15
y10(1+) 151.5 22.4 10.2 194.9 21.9 14.5 246.9 31.3 17.7 15 15 15
y11(1+) 4.7 5.1 6.7 6.4 6.6 6.7 7.9 8.3 9.5 15 15 15
总和 4.8 4.9 6.6 5.9 6 6.7 7.6 7.7 9.4 15 15 15


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CPTAC-2726的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
总账1
顺序
TAAYVNAIEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
536
肽末端
545
CPTAC标识
CPTAC-2726型
肽分子质量
1,078.5659
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher Q检验
内部标准
柱上13 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 7 5.7 6.9 6.8 5.5 7 9.8 7.9 9.8 15 15 15
y3(1+) 13.4 7.1 7.5 11.8 8.6 7.8 17.9 11.2 10.8 15 15 15
y4(1+) 13.7 8.4 8.2 12.8 9.1 10 18.7 12.4 12.9 15 15 15
总和 7 4.2 5.3 6.6 4.1 5.6 9.6 5.9 7.7 15 15 15


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