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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
法赫 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
419 46176
蛋白质名称
烟芳基乙酸乙酯
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSFIPVAEDS公司 DFPIQNLPYG公司 VFSTQSNPKP公司 RIGVAIGDQI公司 LDLSVIKHLF公司
60 70 80 90 100
TGPALSKHQH公司 VFDETTLNNF公司 MGLGQAAWKE公司 ARASLQNLLS公司 ASQARLRDDK公司
110 120 130 140 150
ELRQRAFTSQ公司 ASATMHLPAT公司 IGDYTDFYSS公司 RQHATNVGIM公司 FRGKENALLP公司
160 170 180 190 200
NWLHLPVGYH公司 希腊A类S公司S公司V(V)V(V)S公司G公司 T型P(P)R(右)RPMGQM公司 RPDNSKPPVY公司 GACRLLDMEL公司
210 220 230 240 250
EMAFFVGPGN公司 R(右)F类G公司E类P(P)P(P)S公司K(K) AHEHIFGMVL公司 MNDWSARDIQ公司 QWEYVPLGPF公司
260 270 280 290 300
LGKSFGTTIS公司 PWVVPMDALM公司 PFVVPNPKQD项目 PKPLPYLCHS公司 QPYTFDINLS公司
310 320 330 340 350
VSLKGEGMSQ公司 AATICRSNFK公司 HMYWTMLQQL公司 THHSVNGCNL公司 RPGDLLASGT公司
360 370 380 390 400
ISGSDPESFG公司 SMLELSWKGT公司 KAIDVEQGQT公司 RTFLLDGDEV公司 IITGHCQGDG公司
410 419
YRVGFGQCAG公司 KVLPALSPA公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3803的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
法赫
顺序
ASSIVVSGTPIR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
163
肽末端
174
CPTAC标识
非CPTAC-3803
肽分子质量
1,185.6717
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 16.3 8.3 6.9 16.9 8.6 9 23.5 12 11.3 15 15 15
7岁(1+) 12.2 8 6.5 12.3 8.2 12.3 17.3 11.5 13.9 15 15 15
y6(1+) 12.9 7.1 8.9 19.2 7.6 10.2 23.1 10.4 13.5 15 15 15
y5(1+) 15.4 5.5 8.2 14.6 9.4 10 21.2 10.9 12.9 15 15 15
b5(1+) 18.4 10.3 8 21.5 10.6 11.7 28.3 14.8 14.2 15 15 15
总和 7.6 5.3 3.2 7.3 6.8 6.3 10.5 8.6 7.1 15 15 15


其他资源和评论


非CPTAC-3643的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
法赫
顺序
FGEPIPISK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
212
肽末端
220
CPTAC标识
非CPTAC-3643
肽分子质量
986.5437
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 12 14.3 11.9 18 20 23.1 21.6 24.6 26 15 15 15
y6(1+) 8.9 6 8.6 17.2 9.8 9.2 19.4 11.5 12.6 15 15 15
b3(1+) 18.6 18.2 20.9 20.1 22 28.3 27.4 28.6 35.2 15 15 15
b2(1+) 10.5 19 21 12.2 12.7 21.7 16.1 22.9 30.2 15 15 15
y2(1+) 15.8 9.9 13.2 23.2 21.5 14.7 28.1 23.7 19.8 15 15 15
总和 10.4 5.3 8.3 14.4 10.7 9 17.8 11.9 12.2 15 15 15


其他资源和评论