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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
P糖蛋白 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
321 34541
蛋白质名称
甘油-3-磷酸磷酸酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
迈阿盖德 ARCVRLSAER公司 阿克莱夫特 LLFDCDGVLW公司 R(右)E类T型A类V(V)P(P)A类P(P)
60 70 80 90 100
E类T型L(左)R(右)ALRARG公司 KRLGFITNNS公司 SKTRTAYAEK公司 LRRLGFGGPV公司 GPEAGLEVFG公司
110 120 130 140 150
TAYCSALYLR公司 QRLAGVPDPK 阿伊夫哥巴拉 AELEAVGVTS公司 VGVGPDVLHG公司
160 170 180 190 200
DGPSDWLAVP公司 LEPDVRAVVV公司 GFDPHFSYMK公司 LTKAVRYLQQ公司 PDCLLVGTNM公司
210 220 230 240 250
DNRLPLENGR公司 FIAGTGCLVR公司 AVEMAAQRQA公司 DIIGKPSRFI公司 FDCVSQEYGI公司
260 270 280 290 300
NPERTVMVGD公司 RLDTDILLGS公司 TCSLKTILTL公司 TGVSSLEDVK公司 SNQESDCMFK公司
310 320 321
KKMVPDFYVD公司 赛德尔帕尔克

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3609的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
Pgp公司
顺序
获取avpgapetlr
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
42
肽末端
54
CPTAC标识
非CPTAC-3609
肽分子质量
1,296.6674
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b5(1+) 6.9 4 2.1 9.5 6.7 4.6 11.7 7.8 5.1 15 15 15
b4(1+) 17.2 3.1 4.6 36.9 8.4 6 40.7 9 7.6 15 15 15
b3(1+) 20.8 6.4 4.5 56.5 9.8 5.4 60.2 11.7 7 15 15 15
y8(2+) 13.3 6.3 5.3 68.8 11.8 9.3 70.1 13.4 10.7 15 15 15
8岁(1+) 7.2 2.3 3.1 13.6 8.4 4.4 15.4 8.7 5.4 15 15 15
总和 4.7 1.4 1 24.5 7.1 3.9 24.9 7.2 4 15 15 15


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