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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
Cfp公司 保时捷中心
序列长度(AA) 分子量(Da)
464 50327
蛋白质名称
Propertin公司
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MPAEMQAPQW公司 LLLLL VILPA公司 TGSDPVLCFT公司 QYEESSGRCK公司 GLLGRDIRVE公司
60 70 80 90 100
DCCLNAAYAF公司 QEHDGGLCQA公司 CRSPQWSAWS公司 LWGPCSVTCS系统 EGSQLRHRRC公司
110 120 130 140 150
VGRGGQCSEN公司 VAPGTLEWQL公司 QACEDQPCCP EMGGWSWGP公司 WGPCSVTCSK公司
160 170 180 190 200
GTQIRQRVCD公司 NPAPKCGGHC公司 PGEAQQSQAC公司 DTQKTCPTHG公司 AWASWGPWSP
210 220 230 240 250
CSGSCLGGAQ公司 EPKETRSRSC公司 SAPAPSHQPP程序 GKPCSGPAYE公司 香港ACSGLPPC
260 270 280 290 300
PVAGGWGPWS公司 PLSPCSVTCG公司 LGQTLEQRTC公司 DHPAPRHGGP公司 FCAGDATRNQ公司
310 320 330 340 350
MCNKAVPCPV公司 NGEWAWKW公司 SDCSRLRMSI公司 NCEGTPGQQS公司 RSRSCGGRKF公司
360 370 380 390 400
NGKPCAGKLQ公司 迪尔希尼恩 CIMKGSWSQW公司 STWSLCTPPC公司 SPNATRVRQR公司
410 420 430 440 450
LCTPLLPKYP公司 PTVSMVEGQG公司 EKNVTFWGTP公司 RPLCEALQGQ公司 K(K)L(左)V(V)V(V)E类E类K(K)RSC公司
460 464
LHVPVCKDPE公司 EKKP公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3605的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
Cfp公司
顺序
LVVEEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
442
肽末端
447
CPTAC标识
非CPTAC-3605
肽分子质量
715.4116
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 11.9 7.4 6.8 13.5 7 8.3 18 10.2 10.7 15 15 15
y3(2+) 135.4 65.9 92.8 141.4 155.8 155 195.8 169.2 180.7 15 15 15
y3(1+) 28.7 12.8 17.2 32.9 18.5 18.6 43.7 22.5 25.3 15 15 15
y4(1+) 7.2 7.4 5.7 6.2 7 6.8 9.5 10.2 8.9 15 15 15
y5(1+) 14.8 6.2 5.6 19.3 11.8 4.5 24.3 13.3 7.2 15 15 15
总和 5.8 4.6 4.5 6.9 5 5.6 9 6.8 7.2 15 15 15


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