显示导航→
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
Hyk、Tie-2和Tie-2
序列长度(AA) 分子量(Da)
1122 125701
蛋白质名称
血管生成素-1受体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MDSLAGLVLC公司 GVSLLYGVV公司 EGAMDLILIN公司 SLPLVSDAET公司 SLTCIASGWH公司
60 70 80 90 100
菲律宾 FEALMNQHQD公司 PLEVTQDVTR公司 EWAKKVVWKR公司 EKASKINGAY公司
110 120 130 140 150
FCEGRVRGQA公司 IRIRTMKMRQ公司 QASFLPATLT公司 MTVDRGDNVN公司 ISFKV类
160 170 180 190 200
EDAVIYKNGS公司 FIHSVPRHEV公司 PDILEVHLPH公司 AQPQDAGVYS公司 应收账Y(Y)G公司G公司N个L(左)F类T型
210 220 230 240 250
S公司A类F类T型R(右)利弗 CEAQKWGPDC公司 SRPCTTCKNN公司 gvcchedtgec公司 ICPPGFMGRT公司
260 270 280 290 300
CEKACEPHTF公司 GRTCKERCSG公司 PEGCKSYVFC公司 LPDPYGCSCA公司 TGWRGLQCNE公司
310 320 330 340 350
ACPSGYYGPD公司 CKLRCHCTNE公司 EICDRFQGCL公司 CSQGWQGLQC公司 EKEGRPRMTP公司
360 370 380 390 400
QIEDLPDHIE公司 VNSGKFNPIC公司 KASGWPLPTS公司 EEMTLVKPDG公司 TVLQPNDFNY公司
410 420 430 440 450
TDRFSVAIFT公司 VNRVLPPDSG公司 VWVCSVNTVA公司 GMVEKPFNIS公司 VKVLPEPLHA公司
460 470 480 490 500
PNVIDTGHNF公司 AIINISSEPY公司 FGDGPIKSKK公司 LFYKPVNQAW公司 基耶夫特尼夫
510 520 530 540 550
TLNYLEPRTD公司 YELCVQLARP公司 GEGGEGHPGP公司 VRRFTTASIG公司 LPPPRGLSLL公司
560 570 580 590 600
PKSQTALNLT公司 WQPIFTNSED公司 EFYVEVERS公司 lqtsdqqni公司 KVPGNLTSVL公司
610 620 630 640 650
LSNLVPREQY(LSNLVP请求) TVRARVNTKA公司 QGEWSEELRA公司 WTLSDILPPQ公司 PENIKISNIT公司
660 670 680 690 700
DSTAMVSWTI公司 VDGYSISSII公司 IRYKVQGKNE公司 DQHIDVKIKN公司 ATVTQYQLKG公司
710 720 730 740 750
LEPETTYHVD公司 IFAENNIGSS公司 NPAFSHELRT公司 LPHSPASADL公司 GGGKMLLIAI公司
760 770 780 790 800
LGSAGMTCIT公司 VLLAFLIMLQ公司 LKRANVQRRM公司 AQAFQNREEP公司 AVQFNSGTLA公司
810 820 830 840 850
LNRKAKNNPD公司 PTIYPVLDWN公司 DIKFQ公司D类V(V)G公司电子 G公司N个F类G公司V(V)L(左)K(K)A类R(右) IKKDGLRMDA公司
860 870 880 890 900
AIKRMKEYAS公司 KDDHRDFAGE公司 列夫克尔赫 PNIINLLGAC公司 埃哈吉莱伊
910 920 930 940 950
EYAPHGNLLD公司 FLRKSRVLET公司 DPAFAIANST公司 ASTLSSQQLL公司 HFAADVARGM公司
960 970 980 990 1000
DYLSQKQFIH公司 RDLAARNILV公司 根伊亚基亚德 FGLSRGQEVY公司 VKKTMGRLPV公司
1010 1020 1030 1040 1050
RWMAIESLNY公司 SVYTTNSDVW公司 SYGVLLWEIV公司 SLGGTPYCGM公司 TCAELYEKLP公司
1060 1070 1080 1090 1100
QGYRLEKPLAN公司 CDDEVYDLMR公司 QCWREKPYER公司 PSFAFILVSL(公共安全问题解决方案) NRMLEERKTY公司
1110 1120 1122
V(V)N个T型T型L(左)Y(Y)电子K(K)F类T型 雅加达赛亚 AA公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3433的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
顺序
YIGGNLFTSAFTR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
193
肽末端
205
CPTAC标识
非CPTAC-3433
肽分子质量
1,445.7303
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
化验类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C末端R的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 12.3 2.3 4.4 41.9 4.7 4.9 43.7 5.2 6.6 15 15 15
y6(1+) 9.3 4.6 2.6 14.8 5.9 3.8 17.5 7.5 4.6 15 15 15
7岁(1+) 5.8 4.2 2.4 10.4 6.5 2.6 11.9 7.7 3.5 15 15 15
8岁(1+) 6.9 4.8 3.2 12.8 6.6 6.1 14.5 8.2 6.9 15 15 15
y11(1+) 5.2 4.3 2.1 16.7 7.2 3.8 17.5 8.4 4.3 15 15 15
总和 3.9 1.3 1.3 14 4.1 2.9 14.5 4.3 3.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2892的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TEK公司
顺序
FQDVIGEGNFGQVLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
826
肽末端
840
CPTAC标识
CPTAC-2892型
肽分子质量
1,649.8413
物种
人类 智者
化验类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

化验参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300毫升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 7.3 7.1 6 6.7 6 6.3 9.9 9.3 8.7 15 15 15
b3(1+) 5.6 5.2 5.5 5.6 4.7 6 7.9 7 8.1 15 15 15
y11(1+) 7.5 8.2 7.3 6.8 7 7 10.1 10.8 10.1 15 15 15
总和 6.2 6.3 5.8 5.6 5.4 6.1 8.4 8.3 8.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2891的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TEK公司
顺序
TYVNTTLYEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1101
肽末端
1110
CPTAC标识
CPTAC-2891型
肽分子质量
1,230.6132
物种
人类 智者
化验类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher,Q-Exactive公司
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 5.6 2.5 4.1 7.2 4.4 9.1 3.9 6 15 15 15
7岁(1+) 7.8 1.9 2.2 9 1.9 2.9 11.9 2.7 3.6 15 15 15
y3(1+) 7.5 2.7 3.8 7.5 2.7 4 10.6 3.8 5.5 15 15 15
总和 6.2 1.9 3.1 7 2.1 3.6 9.4 2.8 4.8 15 15 15


其他资源和评论

评论