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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
地上二层 Cf2代码
序列长度(AA) 分子量(Da)
618 70269
蛋白质名称
凝血酶原
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSHVRGLGLP公司 GCLALAALVS公司 LVHSQHVFLA公司 PQQALSLLQR认证 VRANSGFLE公司
60 70 80 90 100
ELRKGNLERE公司 CVEEQCSYEE公司 AFEALESPQD公司 TDVFWAKYTV电视 CDSVRKPRET公司
110 120 130 140 150
FMDCLEGRCA公司 MDLGVNYLGT公司 VNVTHTGIQC公司 QLWRSRYPHK公司 PEINSTTHPG公司
160 170 180 190 200
ADLKENFCRN公司 PDSSTTGPWC公司 YTTDPTVRE公司 ECSVPVCGQE公司 GRTTVVMTPR公司
210 220 230 240 250
SGGSKDNLSP公司 PLGQCLTERG公司 RLYQGNLAVT公司 TLGSPCLPWN公司 SLPAKTLSKY公司
260 270 280 290 300
QDFDPEVKLV型 ENFCRNPDWD公司 EEGAWCYVAG公司 QPGDFEYCNL公司 NYCEEAVGEE公司
310 320 330 340 350
NYDVDESIAG公司 T型T型D类A类E类F类H(H)T型F类 F类N个E类K(K)TFGLGE公司 ADCGLRPLFE公司 KKSLKDTTEK公司
360 370 380 390 400
ELLDSYIDGR公司 伊韦格达埃克 IAPWQVMLFR公司 KSPQELLCGA公司 SLISDRWVLT滑道
410 420 430 440 450
AAHCILYPPW公司 DKNFTENDLL公司 VRIGKHSRTR公司 YERNVEKISM公司 勒基维普里
460 470 480 490 500
NWRENLDRDI公司 ALLKLKKPVP公司 FSDYIHPVCL公司 PDKQTVTSLL公司 RAGYKGRVTG公司
510 520 530 540 550
WGNLRETWTT公司 NINEIQPSVL公司 QVVNLPIVER公司 PVCKASTRIR公司 ITDNMFCAGF公司
560 570 580 590 600
KVNDTKRGDA公司 CEGDSGGPFV公司 MKSPFNNRWY公司 QMGIVSWGEG公司 CDRKGK公司Y(Y)F类Y(Y)
610 618
T型H(H)V(V)F类LKRWI公司 QKVIDQFG公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-5620的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地上二层
顺序
TTDAEFHTFFNEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
312
肽末端
324
CPTAC标识
非CPTAC-5620
肽分子质量
1,585.7049
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆测定法对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b9(2+) 12.6 9.7 17.1 16.5 8.6 23.4 20.8 13 29 15 15 15
b2(1+) 2.8 2.5 3.4 5.1 6.1 4.3 5.8 6.6 5.5 15 15 15
y11(2+) 3.2 2.9 3.4 5.3 8.5 3.9 6.2 9 5.2 15 15 15
y12(2+) 5.8 2.4 2.9 9.9 7.3 4.1 11.5 7.7 5 15 15 15
y6(1+) 6.4 3.8 3.1 8.6 7.4 4.2 10.7 8.3 5.2 15 15 15
总和 2.2 1.5 1.8 4.4 6.5 3.2 4.9 6.7 3.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3432的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地上二层
顺序
YGFYTHVFR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
597
肽末端
605
CPTAC标识
非CPTAC-3432
肽分子质量
1,188.5716
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(2+) 7.5 6.6 8.5 22.3 7.3 10.1 23.5 9.8 13.2 15 14 15
7岁(2+) 4.2 9.5 6.2 14.8 11.8 7.1 15.4 15.1 9.4 15 14 15
y8(2+) 8.7 5.3 5.4 16.2 10.4 6.7 18.4 11.7 8.6 15 14 15
y4(1+) 8.2 7.4 7.5 10.8 10.5 6.9 13.6 12.8 10.2 15 14 15
y5(1+) 4.8 6.3 5.9 9.1 9 6.4 10.3 11 8.7 15 14 15
总和 4.9 4.6 3.5 14.5 8.7 4.4 15.3 9.8 5.6 15 14 15


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