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引用CPTAC分析门户时，请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）检测门户网站（assays.cance.gov）用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

Vcam1型

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
Vcam1型 Vcam-1型
序列长度（AA） 分子量（Da）
739 81317
蛋白质名称
血管细胞粘附蛋白1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MPVKMVAVLG公司 ASTVLWILFA公司 VSQAFKIEIS公司 PEYKTIAQIG公司 DSMALTCSTT公司
60 70 80 90 100
GCESPLFSWR公司 TQIDSPLNAK公司 VRTEGSKSVL公司 TMEPVSFENE公司 HSYLCTATCG公司
110 120 130 140 150
SGKLERSIHV公司 DIYSFPKDPE公司 IQFSGPLEVG公司 KPVTVKCLAP公司 迪YPVYRLEI
160 170 180 190 200
DLFKGDQLMN公司 RQEFSSEEMT公司 KSLETKSLEV公司 TFTPVIEDIG公司 KALVCRAK公司L（左）H（H）
210 220 230 240 250
我D类问我D类S公司T型L（左）K（K）E类 RETVKELQVY公司 ISPRNTTISV HPSTRLQEGG公司 AVTMTCSSEG
260 270 280 290 300
LPAPEIFWGR公司 KLDNEVLQLL公司 SGNATLLIA公司 MRMEDSGVYV公司 CEGVNLIGRD公司
310 320 330 340 350
KAEVELVQE公司 KPFIVDISPG公司 SQVAAQVGDS公司 VVLTCAAIGC公司 DSPSFSWR公司T型问
360 370 380 390 400
T型D类S公司P（P）L（左）N个G公司V（V）虚拟现实 NEGAKSTLVL公司 SSVGFEDEHS公司 YLCAVTCLQR公司 TLEKRTQVEV公司
410 420 430 440 450
YSFPEDPVIK公司 MSGPLVHGRP公司 VTVNCTVPNV YPFDHLEIEL公司 LKGETTLMKK公司
460 470 480 490 500
YFLEEMGIKS公司 莱基莱特夫 IPTIEDTGKS公司 LVCLARLHSG公司 EMESEPKQRQ公司
510 520 530 540 550
SVQPLYVNVA公司 PKETTIWVSP公司 SPILEEGSPV公司 NLTCSSDGIP公司 APKILWSRQL公司
560 570 580 590 600
NNGELQPLSE公司 NTTLTFMSTK公司 RDDSGIYVCE公司 GINEAGISRK公司 SVELIIQVSP公司
610 620 630 640 650
KDIQLTVFPS公司 KSVKEGDTVI公司 ISCTCGNVPE公司 TWILLKKAK公司 TGDMVLKSVD公司
660 670 680 690 700
GSYTIRQAQL公司 QDAGIYECES公司 KTEVGSQLRS公司 LTLDVKGKEH公司 NKDYFSPELL公司
710 720 730 739
ALYCASSLVI公司 PAIGMIVYFA公司 RKANMKGSYS公司 LVEAQKSKV电压

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司


磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-5950的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
VCAM1公司
肽顺序
TQIDSPLSGK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
349
肽末端
358
CPTAC标识
CPTAC-5950型
肽分子质量
1044.5451
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
FFPE肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

靶向质谱能够对临床生物样品中的免疫调节蛋白进行多重定量。Whiteaker JR、Lundeen RA、Zhao L、Schoenherr RM、Burian A、Huang D、Voytovich U、Wang T、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Thiagarajan M、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Kaczmarczyk JA、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Murray KE、Do N、Brophy M、Wilz SW、Yu H、Ajjarapu S、Boja E、，Hiltke T、Rodriguez H、Paulovich AG.Front Immunol公司。2021年11月11日；12:765898. doi:10.3389/fimmu.2021.765898。电子收款2021.PMID:34858420

分析参数 塌陷分析参数

数据来源：全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C和15N K
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP，120º
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流量
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
8岁（1+） 8.1 4.2 2.5 11.2 12.5 13.8 13.8 13.2 14 13 25 14
7岁（1+） 10 4.3 2.9 11.8 12.9 14.1 15.5 13.6 14.4 13 25 14
y6（1+） 10.9 5.9 6.4 13.9 11.3 14.3 17.7 12.7 15.7 13 25 14
b3（1+） 8.4 7.6 4.1 7.5 9.8 11.9 11.3 12.4 12.6 13 25 14
y3（1+） 10.8 9.4 8 16.3 15 19.3 19.6 17.7 20.9 13 25 14
y5（1+） 16.2 8.8 9.2 18.7 16.3 14 24.7 18.5 16.8 13 25 14
总和 7.3 3.8 2.4 10.1 12 13.6 12.5 12.6 13.8 13 25 14

其他资源和评论

资源
下载SOP
在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
在CPTC抗体门户网站中查看
评论

非CPTAC-3397的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
Vcam1型
肽顺序
LHIDQIDSTLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
199
肽末端
209
CPTAC标识
非CPTAC-3397
肽分子质量
1,281.6929
物种
穆斯 肌肉 （鼠标）
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日；1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。

分析参数 塌陷分析参数

数据来源：全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC（安捷伦）
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18，1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流量
400微升/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
b5（1+） 7.5 5.8 6 15.4 6.1 7.9 17.1 8.4 9.9 15 15 15
b2（1+） 6.9 6 7.4 12.6 3.6 5.7 14.4 7 9.3 15 15 15
y2（1+） 12.6 6.3 6.7 16.5 9 8.1 20.8 11 10.5 15 15 15
y4（1+） 7.9 7.6 6.2 17 10.4 10.4 18.7 12.9 12.1 15 15 15
y5（1+） 6.2 6.3 9.1 14.2 8.1 8.9 15.5 10.3 12.7 15 15 15
总和 3.1 4.6 3.8 13.3 5.3 4.5 13.7 7 5.9 15 15 15

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