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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
第1a2列 第2列
序列长度(AA) 分子量(Da)
1372 129557
蛋白质名称
胶原蛋白α-2(I)链
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MLSFVDTRTL公司 LLLAVTSCLA公司 TCQYLQSGSV公司 RKGPTGDRGP公司 RGQRGPAGPR公司
60 70 80 90 100
GRDGVDGPMG公司 PPGPPGSPGP公司 PGSPAPPGLT公司 GNFAAQYSDK公司 GVSSGPMG集团
110 120 130 140 150
LMGPRGPPGA公司 VGAPGPQGFQ公司 GPAGEPGEPG公司 QTGPAGPRGP公司 AGSPGKAGED公司
160 170 180 190 200
GHPGKPGRPG公司 E类R(右)G公司V(V)V(V)G公司P(P)G公司A类 R(右)GFPGTPGLP公司 每公斤体重 MDGLKGQPGA公司
210 220 230 240 250
QGVKGEPGAP公司 GENGTPGQAG公司 ARGLPGERGR公司 VGAPGPAGAR公司 GSDGSVGPVG公司
260 270 280 290 300
PAGPIGSAGP公司 PGFPGAPGPK公司 GELGPVGNPG公司 页码 VGLPGLSGPV公司
310 320 330 340 350
GPPGNPGTNG公司 LTGAKGATGL公司 前列腺素 GPRGIPGPAG公司 AAGATGARGL公司
360 370 380 390 400
VGEPGPAGSK公司 GESGNKGEPG公司 SVGAQGPPGP公司 SGEEGKRGSP公司 GEAGSAGPAG公司
410 420 430 440 450
PPGLRGSPGS公司 RGLPGADGRA公司 GVMGPPGNRG公司 STGPAGIRGP公司 NGDAGRPGEP公司
460 470 480 490 500
GLMGPRGLPG公司 SPGNVGPSGK公司 EGPVGLPGID公司 GRPGPIGPAG公司 PRGEAGNIGF公司
510 520 530 540 550
PGPKGPSGDP公司 GKPGERGHPG公司 LAGARGAPGP公司 DGNNGAQGPP公司 GPQGVQGGKG公司
560 570 580 590 600
当量PAGPPGF QGLPGPSGTT公司 GEVGKPGERG公司 LPGEFGLPGP公司 AGPRGERGTP公司
610 620 630 640 650
GESGAAGPSG公司 猪RGPSGA PGPDGNKGEA公司 GAVGAPGSAG公司 ASGPGGLPGE公司
660 670 680 690 700
有机玻璃 格格尔格 DTGNTGRDGA公司 RGIPGAVGAP公司 GPAGASGDRG公司
710 720 730 740 750
EAGAAGPSGP公司 AGPRGSPGER公司 GEVGPAGPNG公司 FAGPAGAAGQ公司 PGAKGEKGTK公司
760 770 780 790 800
GPKGENGIVG公司 PTGSVGAAGP公司 SGPNGPPGPV公司 GSRGDGGPG公司 MTGFPGAAGR公司
810 820 830 840 850
TGPPGPSGIA公司 GPPGPPGAAG公司 KEGIRGPRGD公司 QGPVGRTGET公司 GASGPPGFVG公司
860 870 880 890 900
EKGPSGEPGT公司 AGAPGTAGPQ公司 GLLGAPGILG公司 LPGSRGEL公司 PGIAGALGEP公司
910 920 930 940 950
GPLGISGPPG公司 ARGPPGAVGS公司 PGVNGAPGEA公司 GRDGNPGSDG公司 PPGRDGQPGH公司
960 970 980 990 1000
克格尔吉普格西 GPTGAAGAPG公司 PHGSVGPAGK公司 HGNRGEPGPA公司 GSVGPVGAVG公司
1010 1020 1030 1040 1050
PRGPSGPQGI公司 RGDKGEPGDK公司 GHRGLPGLKG公司 YSGLQGLPGL公司 AGLHGDQGAP公司
1060 1070 1080 1090 1100
GPVGPAGPRG公司 页码 DGRSGQPGPV公司 GPAGVRGSQG公司 SQGPAGPPGP公司
1110 1120 1130 1140 1150
PGPPGPVPVS(PGPPGPVS) GGGYDFGFEG公司 DFYRADQPRS公司 QPSLRPKDYE公司 VDATLKSLNN公司
1160 1170 1180 1190 1200
QIETLTPEG公司 SRKNPARTCR公司 DLRLSHPEWN公司 SDYYWIDPNQ公司 GCTMDAIKVY公司
1210 1220 1230 1240 1250
CDFSTGETCI公司 QAQPVNTPAK公司 NSYSRAQANK公司 HVWLGETING(暖通空调) GSQFEYNVEG公司
1260 1270 1280 1290 1300
VSSKEMATQL公司 AFMRLLANRA公司 SQNITYHCKN公司 锡酰脱氧 SLNKAVLLQG公司
1310 1320 1330 1340 1350
SNDVELVAEG公司 NSRFTYSVLV公司 DGCSKKTNEW公司 GKTILEYKTN公司 KPSRLPFLDI公司
1360 1370 1372
APLDIGGADQ公司 EFRVEVGPVC公司 FK公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3310的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
第1a2列
序列
GVVGPQGAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
162
肽末端
171
CPTAC标识
非CPTAC-3310
肽分子质量
839.4614
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


化验参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400µL/min

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y7(2+) 6.7 3.5 2.8 17.5 10.8 5 18.7 11.4 5.7 15 15 15
y5(1+) 6.9 4.6 3.4 17.7 9.3 5.7 19 10.4 6.6 15 15 15
y5(2+) 9.7 4.2 3.9 13.2 10.6 5.5 16.4 11.4 6.7 15 15 15
y6(1+) 4.4 5.5 3.1 16.1 10 5.1 16.7 11.4 6 15 15 15
7岁(1+) 7 5 5.4 19.2 9.6 6.4 20.4 10.8 8.4 15 15 15
总和 3.2 1.6 1.1 16 9.7 4.4 16.3 9.8 4.5 15 15 15


其他资源和意见