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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
火花塞 打开
序列长度(AA) 分子量(Da)
303 34632
蛋白质名称
火花塞
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MRAWIFFLLC公司 拉格拉阿帕克 QEALPDETEV公司 VEETVAEVTE公司 VSVGANPVQV公司
60 70 80 90 100
EVGEFDDGAE公司 ETEEEVVAEN公司 PCQNHHCKHG公司 KVCELDENNT公司 PMCVCQDPTS公司
110 120 130 140 150
CPAPIGEFEK公司 VCSNDNKTFD公司 sschfatkc公司 TLEGTKKGHK公司 LHLDYIGPCK公司
160 170 180 190 200
YIPPCLDSEL公司 TEFPLRMRDW公司 LKNVLVTLYE公司 RDEDNNLLTE公司 KQKLRVKKIH公司
210 220 230 240 250
ENEK公司L(左)E类A类G公司D类 H(H)P(P)V(V)E类L(左)L(左)A类RDF公司 EKNYNMYIFP公司 VHWQFGQLDQ公司 HPIDGYLSHT公司
260 270 280 290 300
埃拉普拉普利 PMEHCTTRFF公司 ETCDLDNDKY公司 IALDEWAGCF公司 GIKQKDIDKD公司
303
LVI公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-2699的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
火花塞
顺序
领风帆
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
205
肽末端
217
CPTAC标识
非CPTAC-2699
肽分子质量
1,418.7518
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流量
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y12(2+) 9.5 8.4 11.1 13.1 11.4 11.8 16.2 14.2 16.2 15 15 15
7岁(1+) 8.3 12.6 9.6 11.8 12 14 14.4 17.4 17 15 15 15
8岁(2+) 20.6 8.9 14.4 19 7.6 13.9 28 11.7 20 15 15 15
y10(2+) 21.6 11.5 9.5 28.7 19.4 16.5 35.9 22.6 19 15 15 15
y11(2+) 7.1 5.3 9.6 12.4 8.5 10 14.3 10 13.9 15 15 15
总和 5.1 3.6 7.1 10.7 8.3 9.7 11.9 9 12 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3394的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
斯巴达克
顺序
领风帆
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
205
肽末端
217
CPTAC标识
非CPTAC-3394
肽分子质量
1,418.7518
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆测定法对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流量
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(2+) 9.4 14.9 10.8 108.4 31.9 15.8 108.8 35.2 19.1 15 15 15
y10(2+) 12.9 3.5 9.1 13.2 7.8 9.6 18.5 8.5 13.2 15 15 15
y11(2+) 9.2 7.2 5.4 20.6 10.4 7 22.6 12.6 8.8 15 15 15
y12(2+) 9.6 5.6 6.5 23.2 10.9 9.6 25.1 12.3 11.6 15 15 15
7岁(1+) 13.2 7 8.7 18 9.5 13.6 22.3 11.8 16.1 15 15 15
总和 4.3 4.1 3.9 30.5 8 6.7 30.8 9 7.8 15 15 15


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