显示导航
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
IGF1级 IBP1基因
序列长度(AA) 分子量(Da)
195 21841
蛋白质名称
胰岛素样生长因子I
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MGKISSLPTQ公司 LFKCCFCDFL公司 KVKMHTMSSS公司 HLFYLALCLL公司 TFTSSATAGP公司
60 70 80 90 100
ETLCGAELVD公司 ALQFVCGDR公司G公司 F类Y(Y)F类N个K(K)P(P)T型G公司Y(Y)G公司 S公司S公司S公司R(右)RAPQTG公司 IVDECCFRSC公司
110 120 130 140 150
DLRRLEMYCA公司 PLKPAKSARS公司 VRAQRHTDMP(VRAQRTDMP) KTQKYQPPST公司 NKNTKSQRRK公司
160 170 180 190 195
GWPKTHPGGE公司 QKEGTEASLQ公司 IRGKKKEQRR公司 EIGSRNAECR公司 GKKGK公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3716的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
免疫球蛋白1
顺序
GFYFNKPTGYGSSIR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
70
肽末端
84
CPTAC标识
非CPTAC-3716
肽分子质量
1,692.8260
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(2+) 18.8 9.1 6.8 22.4 11.7 8 29.2 14.8 10.5 15 15 15
y12(2+) 14.8 6.6 6.1 14.9 6.2 5.4 21 9.1 8.1 15 15 15
9岁(1+) 9.5 6.7 5.7 10.8 10.6 6 14.4 12.5 8.3 15 15 15
b2(1+) 9.4 6.6 7.6 19.5 9.2 7.3 21.6 11.3 10.5 15 15 15
y13(3+) 13.8 5 3.4 15 5.4 5.2 20.4 7.4 6.2 15 15 15
总和 5 2.6 3.3 9.2 5.3 3.8 10.5 5.9 5 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-2677的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
IGF1级
顺序
GFYFNKPTGYGSSSR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
70
肽末端
84
CPTAC标识
非CPTAC-2677
肽分子质量
1,666.7740
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 12.6 8.5 11.5 20.4 9 15.8 24 12.4 19.5 15 15 15
y13(3+) 6 7.6 10.9 10.1 11 11.2 11.7 13.4 15.6 15 15 15
y12(2+) 6.9 7.6 11.4 13 10.2 15.5 14.7 12.7 19.2 15 15 15
y13(2+) 6.6 6 10 10.1 6.4 14.5 12.1 8.8 17.6 15 15 15
y11(2+) 8.8 6.7 10.7 14.6 7.2 12.8 17 9.8 16.7 15 15 15
总和 3.8 5.4 9.8 10 7.2 12.3 10.7 9 15.7 15 15 15


其他资源和评论

评论