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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

基质金属蛋白酶2

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
基质金属蛋白酶2 CLG4A系列
序列长度(AA) 分子量(Da)
660 73882
蛋白质名称
72kDa IV型胶原酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MEALMARGAL餐厅 TGPLRALCLL公司 GCLLSHAAAA公司 PSPIIKFPGD公司 瓦普克德凯拉
60 70 80 90 100
VQYLNTFYGC公司 PKESCNLFVL公司 KDTLKKMQKF公司 FGLPQTGDLD公司 QNTIETMRKP公司
110 120 130 140 150
RCGNPDVANY公司 NFFPRKPKWD公司 KNQITYRIIG公司 YTPDLDPETV公司 迪拜国际机场A类F类V(V)
160 170 180 190 200
W公司S公司D类V(V)T型P(P)L(左)R(右)可行性研究 里赫杰阿迪姆 INFGRWEHGD公司 GYPFDGKDGL公司 LAHAFAPGTG公司
210 220 230 240 250
VGGDSHFDDD公司 ELWTLGEGQV型 VRVKYGNADG公司 眼睛FPFLFN GKEYNSCTDT公司
260 270 280 290 300
GRSDGFLWCS公司 TTYNFEKDGK公司 YGFCPHEALF公司 TMGGNAEGQP公司 CKFPFRFQGT公司
310 320 330 340 350
SYDSCTTEGR公司 TDGYRWCGTT公司 EDYDRDKKYG公司 FCPETAMSTV电视 GGNSEGAPCV公司
360 370 380 390 400
FPFTFLGNKY公司 ESCTSAGRSD公司 GKMWCATTAN公司 YDDDRKWGFC公司 PDQGYSLFLV公司
410 420 430 440 450
AAHEFGHAMG公司 列赫平方加仑 MAPIYTYTKN公司 FRLSQDDIKG公司 IQELYGASPD公司
460 470 480 490 500
IDLGTGPTPT公司 LGPVTPEICK公司 QDIVFDGIAQ公司 IRGEIFFFKD公司 RFIWRTVTPR公司
510 520 530 540 550
DKPMGPLLVA公司 TFWPELPEKI公司 D类A类V(V)Y(Y)E类A类P(P)E类E类 K(K)A类V(V)法格尼 威萨斯特
560 570 580 590 600
GYPKPLTSLG公司 LPPDVQRVDA公司 AFNWSKKT公司 YIFAGDKFWR公司 YNEVKKKMDP公司
610 620 630 640 650
GFPKLIADAW公司 NAIPDNLDAV公司 VDLQGGGHSY公司 FFKGAYYLKL公司 ENQSLKSVKF公司
660
GSIKSDWLGC公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-2615的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
基质金属蛋白酶2
顺序
AFQVWSDVTPLR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
147
肽末端
158
CPTAC标识
非CPTAC-2615
肽分子质量
1,417.7354
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 7.2 7.1 10.9 13.7 8 14.2 15.5 10.7 17.9 15 15 15
7岁(1+) 7 7.1 10.7 11.2 9 12.1 13.2 11.5 16.2 15 15 15
b3(1+) 8.2 6.5 9.5 15.8 8.9 11 17.8 11 14.5 15 15 15
y5(1+) 12.9 8.4 14.5 14.3 9.7 16.7 19.3 12.8 22.1 15 15 15
y4(1+) 9.5 4.9 8.4 14.5 6.7 14.8 17.3 8.3 17 15 15 15
总和 3.5 5.5 8.5 11.2 7.5 12 11.7 9.3 14.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3729的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
百万分之二
顺序
IDAVYEAPQEEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
522
肽末端
533
CPTAC标识
非CPTAC-3729
肽分子质量
1,390.6616
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆测定法对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b4(1+) 11.1 6.9 5.7 14.2 8.7 8.4 18 11.1 10.2 15 15 15
b3(1+) 11 5 5.4 7.8 5.4 7.6 13.5 7.4 9.3 15 15 15
b2(1+) 10.2 6.4 5.6 9.4 7.6 7.1 13.9 9.9 9 15 15 15
y5(1+) 10.9 6.2 6 10.8 7.6 7.6 15.3 9.8 9.7 15 15 15
8岁(1+) 6.4 3.5 4.7 6 7.7 7.3 8.8 8.5 8.7 15 15 15
总和 4.1 2.1 2.4 3.9 4.7 5.7 5.7 5.1 6.2 15 15 15


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