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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
AMBP公司 HCP、ITIL
序列长度(AA) 分子量(Da)
352 38999
蛋白质名称
AMBP蛋白
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
SLGALLL先生 LSACLAVSAG公司 PVPTPPDNIQ公司 VQENFNISRI病毒 YGKWYNLAIG公司
60 70 80 90 100
STCPWLKKIM公司 DRMTVSTLVL公司 盖盖太斯 最小值 CEETSGAYEK公司
110 120 130 140 150
TDTDGKFLYH公司 KSKWNITMES公司 YVVHTNYDEY公司 AIFLTKFSR公司 H(H)H(H)G公司P(P)T型T型A类K(K)L(左)
160 170 180 190 200
YGRAPQL公司R(右)E类T型 L(左)L(左)D类F类R(右)VVAQ公司 GVGIPEDSIF公司 tmadrgecv公司 通用电气公司E类P(P)E类P(P)L(左)
210 220 230 240 250
P(P)RVRRAVLPQ公司 EEEGSGGGQL公司 VTEVTKKEDS公司 CQLGYSAGPC公司 MGMTSRYFYN公司
260 270 280 290 300
GTSMACETFQ公司 YGGCMGNN公司 FVTEKECLQT公司 CRTVAACNLP公司 IVRGPCRAFI公司
310 320 330 340 350
QLWAFDAVKG公司 KCVLFPYGGC公司 QGNGNKFYSE公司 KECREYCGVP公司 GDGDEELLRF公司
352
序号

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-5576的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
琥珀色
顺序
DSLLQEFK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
158
肽末端
165
CPTAC标识
非CPTAC-5576
肽分子质量
978.5022
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 5.3 5.4 6.6 8.9 9.5 6.5 10.4 10.9 9.3 15 15 15
y6(2+) 6.8 8.4 4.1 14.2 9.9 6.6 15.7 13 7.8 15 15 15
y4(1+) 7.8 5.3 3.4 11.3 6.5 4.7 13.7 8.4 5.8 15 15 15
y5(1+) 8 5.3 4.7 8.7 8.3 4.3 11.8 9.8 6.4 15 15 15
y6(1+) 7.6 4.1 2.8 9.7 6.3 4.8 12.3 7.5 5.6 15 15 15
总和 2.8 2.3 2 5.1 6.5 5.8 6.9 3.6 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-1153的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
AMBP公司
顺序
ETLLQDFR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
159
肽末端
166
CPTAC标识
非CPTAC-1153
肽分子质量
1,020.5240
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 12.2 7.3 4.3 12.8 6.2 4 17.7 9.6 5.9 15 15 15
y6(2+) 8.8 5.7 7.1 12.1 3.5 6.5 15 6.7 9.6 15 15 15
y3(1+) 7.1 5.1 5.9 11.1 7 5.9 13.2 8.7 8.3 15 15 15
y4(1+) 4 5.2 5.1 8.6 6.3 6.1 9.5 8.2 8 15 15 15
y5(1+) 7.5 4.6 3.7 6 5.4 3.8 9.6 7.1 5.3 15 15 15
总和 3.8 3.8 2.5 7.1 4.7 3.4 8.1 6 4.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3510的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
琥珀色
顺序
永垂不朽
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
193
肽末端
201
CPTAC标识
非CPTAC-3510
肽分子质量
1,000.5189
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(2+) 8.4 10.2 5.5 14.1 9.7 10 16.4 14.1 11.4 15 15 15
7岁(2+) 37.6 28.8 37 30.9 23.4 39.7 48.7 37.1 54.3 15 15 15
y2(1+) 15.8 14.6 15.9 20.7 18.2 16.5 26 23.3 22.9 15 15 15
y6(1+) 13.9 10.9 9.3 17.1 11.3 8.1 22 15.7 12.3 15 15 15
7岁(1+) 18.7 27.4 16 18.4 26.3 23.7 26.2 38 28.6 15 15 15
总和 8.4 7.5 5.1 11.8 6.9 8 14.5 10.2 9.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-1152的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
AMBP公司
顺序
HHGPTITAK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
141
肽末端
149
CPTAC标识
非CPTAC-1152
肽分子质量
960.5141
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 8.2 5.3 5.8 11.8 10.3 14.6 14.4 11.6 15.7 15 15 15
b2(1+) 7.5 7.3 6.9 12 10.4 11.2 14.2 12.7 13.2 15 15 15
6岁(3+) 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 0 0 0
y2(1+) 10.2 2.7 3.6 13.4 4.6 5.6 16.8 5.3 6.7 15 15 15
y3(1+) 6.4 4.8 6.1 8.7 6.1 7.6 10.8 7.8 9.7 15 15 15
总和 3.6 3.7 2.9 6.3 4.9 3.6 7.3 6.1 4.6 15 15 15


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