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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
2012财年 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
615 67792
蛋白质名称
凝血因子XII
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MRALLLLGFL公司 LVSLESTLSI公司 PPWEAPKEHK公司 K(K)一个电子电子H(H)T型V(V)V(V)L(左) T型V(V)T型G公司电子PCHFP项目
60 70 80 90 100
FQYHRQLYHK公司 CTHKGRPGPQ公司 PWCATTPNFD公司 QDQRWGYCLE公司 PKKVKDHCSK公司
110 120 130 140 150
HSPCQKGGTC公司 VNMPSGPHCL公司 CPQHLTGNHC公司 QKEKCFEPQL公司 LRFFHKNEIW公司
160 170 180 190 200
T型电子一个一个V(V)一个R(右) CQCKGPDAHC公司 QRLASQACRT公司 NPCLHGGRCL公司 EVEGHRLCHC公司
210 220 230 240 250
PVGYTGAFCD公司 VDTKASCYDG公司 RGLSYRGLAR公司 TTLSGAPCQP公司 WASEATYRNV公司
260 270 280 290 300
TAEQARNWGL公司 GGHAFCRNPD公司 NDIRPWCFVL公司 NRDRLSWEYC公司 DLAQCQTPTQ公司
310 320 330 340 350
AAPPTPVSPR公司 LHVPLMPAQP公司 APPKPQPTTR公司 TPPQSQTPGA公司 LPAKR公司电子P(P)P(P)S公司
360 370 380 390 400
L(左)T型R(右)NGPLSCG公司 QRLRKSLSSM公司 信托收据V(V)V(V)G公司G公司L(左)V(V)一个L(左) R(右)GAHPYIAAL公司 YWGHSFCAGS公司
410 420 430 440 450
LIAPCWVLTA公司 AHCLQDRPAP公司 EDLTVVLGQE公司 RRNHSCEPCQ公司 TLAVRSYRLH公司
460 470 480 490 500
EAFSPVSYQH公司 DLALLRQED公司 ADGSCALLSP公司 YVQPVCLPSG公司 AARP设置LC
510 520 530 540 550
QVAGWGHQFE公司 GAEEYASFLQ公司 EAQVPFLSLE公司 RCSAPDVHGS公司 SILPGMLCAG公司
560 570 580 590 600
FLEGGTDACQ公司 GDSGGPLVCE公司 DQAAERRLTL公司 QGIISWGSGC公司 GDRNKPGVYT公司
610 615
DVAYYLAWIR公司 电子健康电视系统

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3541的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
2012财年
顺序
DAPDGPTVVLTVDGR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
31
肽末端
45
CPTAC标识
非CPTAC-3541
肽分子质量
1,510.7627
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托弗·博彻斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y13(2+) 3.6 3.2 2.5 11.4 3.2 6.7 12 4.5 7.2 15 15 15
y2(1+) 4.9 2.9 2.8 19 7.9 11.5 19.6 8.4 11.8 15 15 15
y6(1+) 6.6 5.3 4.2 10.9 4.9 9.7 12.7 7.2 10.6 15 15 15
7岁(1+) 4.4 3.2 2.2 15.7 4.4 4.7 16.3 5.4 5.2 15 15 15
y10(1+) 6.2 5.4 4.6 12.2 8 12.1 13.7 9.7 12.9 15 15 15
总和 3.1 1.6 1.7 12 6 12.4 3.4 6.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-2650的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
2012财年
顺序
EQPPSLTR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
346
肽末端
353
CPTAC标识
非CPTAC-2650
肽分子质量
926.4821
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400µL/min

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(2+) 10.1 7 4.7 15 9.7 6.2 18.1 12 7.8 15 15 15
b2(1+) 19.6 5.1 6.8 27.5 10.1 8 33.8 11.3 10.5 15 15 15
y5(2+) 25.2 9.7 8.2 41 11.6 10.4 48.1 15.1 13.2 15 15 15
y6(1+) 12.5 5.8 6.9 14 10.1 8.1 18.8 11.6 10.6 15 15 15
y5(1+) 13.8 5.7 6.8 16.5 7.3 8.3 21.5 9.3 10.7 15 15 15
总和 7.4 5.4 3.9 13.5 8.8 5.9 15.4 10.3 7.1 15 15 15


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非CPTAC-3707的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
2012财年
顺序
TGPGGVAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
153
肽末端
160
CPTAC标识
非CPTAC-3707
肽分子质量
713.3820
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
紫外线基因组BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(2+) 8.4 7.9 8.1 17 11.6 8.1 19 14 11.5 15 15 15
y4(1+) 31.3 26.8 13.6 36.5 35.3 19.8 48.1 44.3 24 15 15 15
y5(1+) 8.6 14.3 5.2 21.4 13.8 8.5 23.1 19.9 10 15 15 15
y6(1+) 16.7 14 7.4 14.9 18 11.9 22.4 22.8 14 15 15 15
7岁(1+) 25.7 57.4 10.1 24.4 46.1 20.3 35.4 73.6 22.7 15 15 15
总和 5.5 5 5.4 16.5 10.5 5.1 17.4 11.6 7.4 15 15 15


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非CPTAC-1100的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
2012财年
顺序
VVGGLVALR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
373
肽末端
381
CPTAC标识
非CPTAC-1100
肽分子质量
882.5651
物种
人类 智人 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 10.9 6.2 4.9 18.5 6.6 5.9 21.5 9.1 7.7 15 15 15
7岁(1+) 5.8 3.6 5.1 10.8 7.6 6 12.3 8.4 7.9 15 15 15
8岁(1+) 17.4 4.5 4.3 15.3 4.4 5.7 23.2 6.3 7.1 15 15 15
总和 5 3.4 4.3 10.8 6.9 4.7 11.9 7.7 6.4 15 15 15


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