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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
CA1公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
261 28870
蛋白质名称
碳酸酐酶1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
面具 KNGPEQWSKL公司 YPIANGNNQS公司 PVDIKTSETK系列 HDTSLKPISV公司
60 70 80 90 100
辛帕塔克E类 N个V(V)G公司H(H)S公司F类H(H)V(V)N个 F类E类N个N个R(右)SVL公司 KGGPFSDSYR公司 LFQFHFHWGS公司
110 120 130 140 150
TNEHGSEHTV DGVKYSAELH公司 VAHWNSAKYS公司 斯莱亚斯卡德 GLAVIGVLMK公司
160 170 180 190 200
VGEANPKLQK公司 V(V)A类A类K(K)T型 KGKRAPFTNF公司 DPSTLLPSSL公司 DFWTYPGSLT公司
210 220 230 240 250
高压电源 IICKESISVS公司 SEQLAQFRSL公司 LSNVEGDNAV公司 PMQHNNRPTQ公司
260 261
PLKGRTVRAS公司 F类

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1302的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CA1公司
肽修饰顺序
EIINVGHSFHVNFEDNDN[+1.0]R公司
修改类型
脱酰胺(N)
蛋白质-修饰位点
76
肽-修饰位点
18
肽开始
59
肽末端
77
CPTAC标识
CPTAC-1302型
肽分子质量
2,256.0196
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
人卵巢肿瘤组织消化
提交实验室
约翰霍普金斯大学
提交实验室PI
Daniel Chan、Hui Zhang、Zhen Zhang

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
稳定同位素标记肽
肽标准纯度
原油(~60%)
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Accela 1250第四纪低泵
色谱柱填料
C18,3µm,300Å
立柱尺寸
1.0毫米内径x 15厘米
流速
50微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y14(2+) 81.6 47.3 60.4 143.7 69.1 67.4 165.3 83.7 90.5 15 15 15
8岁(1+) 104.7 49.1 62.5 121.6 79 77.9 160.5 93 99.9 15 15 15
9岁(1+) 90.8 83.7 75.6 144.5 157.8 80.1 170.7 178.6 110.1 15 15 15
总和 55.9 18.4 33 79 34.3 34.4 96.8 38.9 47.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3566的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
钙1
顺序
VLDALNSVK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
161
肽末端
169
CPTAC标识
非CPTAC-3566
肽分子质量
957.5495
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
b4(2+) 125.1 118.7 127.6 121.1 131.4 95.5 174.1 177.1 159.4 15 15 15
b2(1+) 12 7.1 7.8 12.4 8 10 17.3 10.7 12.7 15 15 15
y6(1+) 54.2 18.1 7.3 55.1 21.7 7.5 77.3 28.3 10.5 15 15 15
7岁(1+) 16 7.9 8.6 14.3 8.8 14.1 21.5 11.8 16.5 15 15 15
8岁(1+) 48.6 8.5 10.4 42 11.7 14.3 64.2 14.5 17.7 15 15 15
总和 13.1 3.4 4.3 12.1 6.8 11.1 17.8 7.6 11.9 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-1091的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CA1公司
顺序
VLDALQAIK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
161
肽末端
169
CPTAC标识
非CPTAC-1091
肽分子质量
969.5859
物种
人类 智人 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 18.7 9.1 6.6 23.6 9.2 8.6 30.1 12.9 10.8 15 15 15
y3(1+) 11.9 7.6 6.6 16.2 10.6 7.8 20.1 13 10.2 15 15 15
y4(1+) 15.8 11.3 9 20.5 11.4 7.4 25.9 16.1 11.7 12 15 14
y6(1+) 19.1 9.7 9.2 21.8 10.6 9.8 29 14.4 13.4 15 15 15
7岁(1+) 8 10.7 3.5 9 9.5 7.9 12 14.3 8.6 15 15 15
总和 7.2 9.4 3.1 7.7 8.4 6.9 10.5 12.6 7.6 15 15 15


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