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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
NSUN2号机组 萨基,TRM4
序列长度(AA) 分子量(Da)
767 86471
蛋白质名称
tRNA(胞嘧啶(34)-C(5))-甲基转移酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
管理RRSRGRRL QQQQRPEDAE公司 DGAEGGGKRG公司 EAGWEGGYPE公司 IVKENKLFEH公司
60 70 80 90 100
YYQELKIVPE公司 GEWGQFMDAL公司 REPLPATLRI公司 TGYKSHAKEI公司 LHCLKNKYFK公司
110 120 130 140 150
ELEDLEVDGQ公司 KVEVPQPLSW公司 YPEELAWHTN公司 LSRKILRKSP公司 HLEKFHQFLV公司
160 170 180 190 200
SETESGNISR(设置GNISR) QEAVSMIPPL公司 LLNVRPHHKI公司 LDMCAAPGSK公司 TTQLIEMLHA公司
210 220 230 240 250
DMNVPFPEGF公司 维也纳 CYLLVHQAKR气缸 LSSPCIMVVN公司 HDASSIPRLQ公司
260 270 280 290 300
IDVDGRKEIL公司 FYDRILCDVP公司 CSGDGTMRKN公司 IDVWKKWTTL公司 NSLQLHGLQL公司
310 320 330 340 350
RIATRGAEQL公司 AEGGRMVYST系统 CSLNPIEDEA公司 威士乐(VIASLLEKSE) 加莱拉德文森
360 370 380 390 400
ELPGLKWMPG公司 ITQWKVMTKD公司 GQWFTDWDAV公司 PHSRHTQIRP公司 TMFPPKDPEK公司
410 420 430 440 450
LQAMHLERCL公司 RILPHHQNTG公司 GFFVAVLVKK公司 SSMPWNKRQP公司 KLQGKSAETR公司
460 470 480 490 500
E类S公司L(左)S公司P(P)A类D类L(左) E类G公司K(K)P(P)D类P(P)S公司K(K) LESPSFTGTG公司 DTEIAHATED公司 LENGSKKDG公司
510 520 530 540 550
VCGPPPSKKM公司 KLFGFKEDPF公司 VFIPEDDPLF公司 PPIEKFYALD公司 PSFPRMNLLT公司
560 570 580 590 600
RTTEGKKRQL公司 伊姆夫舍尔恩夫 LLNNSEKMKV公司 INTGIKVWCR公司 NNSGEEFDCA公司
610 620 630 640 650
FRLAQEGIYT公司 利芬斯里 电视节目 LTQENPFFRK公司 LSSETYSQAK语言
660 670 680 690 700
DLAKGSIVLK公司 YEPDSANPDA公司 LQCPIVLCGW公司 RGKASIRTFV公司 PKNERLHYLR公司
710 720 730 740 750
MMGLEVLGEK公司 KKEGVILTNE公司 SAASTGQPDN公司 DVTEGQRAGE公司 巴布亚新几内亚
760 767
SPDVTAGCDP公司 AGVHPPR公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-984的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
NSUN2号机组
肽修饰序列
ESTQLS[+80.0]PADLTEGKPTDPSK公司
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
456
肽-修饰位点
6
肽开始
451
肽末端
470
CPTAC ID
CPTAC-984型
肽分子质量
2,179.9886
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
IMAC公司
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Kennedy JJ、Yan P、Zhao L、Ivey RG、Voytovich U、Moore HD、Lin C、Pogosova-Agadjanyan EL、Stirewalt DL、Reding KW、Whiteaker JR、,Paulovich AG。固定化金属亲和色谱结合多重反应监测可实现重复定量磷酸-唾液酸。分子和细胞蛋白质组学。最大持续功率。O115.054940号


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTrap 5500(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
纳米LC-2D(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120Å
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y15(2+) 33.8 12.7 13.3 23.2 13.8 14.7 41 18.8 19.8 15 24 15
y16-98(2+) 30.3 13.7 22.5 22.6 19.4 17 37.8 23.7 28.2 15 24 15
y16(2+) 29.2 11.8 19.3 20.9 16.6 21.7 35.9 20.4 29 15 24 15
总和 27.5 10.9 11.9 19.4 14.1 13.5 33.7 17.8 18 15 24 15


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