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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
液化石油气 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
509 58001
蛋白质名称
酪氨酸蛋白激酶Lck
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MGCGCSSHPE公司 DDWMENIDVC公司 ENCHYPIVPL公司 DGKGTLLIRN公司 GSEVRDPLVT公司
60 70 80 90 100
YEGSNPPASP公司 LQDNLVIALH公司 SYEPSHDGDL公司 GFEKGEQLRI公司 LEQSGEWKA公司
110 120 130 140 150
QSLTTGQEGF公司 IPFNFVAKAN公司 SLEPEPWFFK公司 NLSRKDAERQ公司 LLAPGNTHGS公司
160 170 180 190 200
佛罗里达州 GSFSLSVRDF公司 DQNQGEVVKH公司 伊基尔N个L(左)D类N个 F类Y(Y)S公司R(右)ITFP公司
210 220 230 240 250
GLHELVRHYT公司 NASDGLCTRL公司 SRPCQTQKPQ公司 KPWWEDEWEV公司 PRETLKLVER公司
260 270 280 290 300
LGAGQFGEVW公司 MGYYNGHTKV公司 AVKSLKQGSM SPDAFLEAN公司 LMKQLQHQRL公司
310 320 330 340 350
VRLYAVVTQE公司 PIYIITEME(皮耶伊) NGSLVDFLKT公司 PSGIKLTINK公司 LLDMAAQIAE公司
360 370 380 390 400
GMAFIEERNY公司 IHRDLRAANI公司 LVSDTLSCKI公司 ADFGLAR公司L(左)电子 D类N个电子Y(Y)T型A类R(右)EGA公司
410 420 430 440 450
KFPIKWTAPE公司 AINYGTFTIK公司 SDVWSFGILL公司 TEIVTHGRIP公司 YPGMTNPEVI公司
460 470 480 490 500
QNLERGYRMV公司 RPD公司 QLMRLCWKER公司 PEDRPTFDYL公司 RSVLEDFFTA公司
509
TEGQYQPQP公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-929的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
液化石油气
肽修饰顺序
NLDNGGFY[+80.0]ISPR公司
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
192
肽-修饰位点
8
肽开始
185
肽末端
196
CPTAC标识
CPTAC-929型
肽分子质量
1431.6184个
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
IMAC公司
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Kennedy JJ、Yan P、Zhao L、Ivey RG、Voytovich U、Moore HD、Lin C、Pogosova-Agadjanyan EL、Stirewalt DL、Reding KW、Whiteaker JR、,Paulovich AG。固定化金属亲和色谱结合多重反应监测可实现重复定量磷酸-唾液酸。分子和细胞蛋白质组学。最大持续功率。O115.054940号


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTrap 5500(Sciex)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
纳米LC-2D(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 18.3 8.3 9.6 19.1 13.1 14.3 26.5 15.5 17.2 15 24 15
9岁(1+) 40.9 15.3 17.6 32.6 14.8 16.2 52.3 21.3 23.9 15 24 15
y10(1+) 31.7 12.1 6 25.8 12.3 9.2 40.9 17.3 11 15 24 15
总和 28.7 8.6 7.4 21.6 10.7 7.3 35.9 13.7 10.4 15 24 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1775的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
液化石油气
肽修饰顺序
列德尼[+80.0]焦油
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
394
肽-修饰位点
7
肽开始
388
肽末端
397
CPTAC ID
CPTAC-1775型
肽分子质量
1,302.5493
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
大肠杆菌裂解物
提交实验室
约翰·霍普金斯大学/潘迪
提交实验室PI
阿克希利什·潘迪

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Orbitrap Fusion Lumos公司
内部标准
100亿摩尔
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1200系统
色谱柱填料
C18 2微米100A
立柱尺寸
内径75微米x 50厘米
流速
300nl/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 3.9 9.1 5.5 4.2 8 8.5 5.7 12.1 10.1 15 15 15
y4(1+) 4.6 9.2 5 5.7 8.8 8 7.3 12.7 9.4 15 15 15
y5(1+) 4.8 11.1 4.4 4.9 9.4 9.8 6.9 14.5 10.7 15 15 15
y6(1+) 4.7 10.3 6.7 6.4 10.4 10.3 7.9 14.6 12.3 15 15 15
7岁(1+) 5.1 8.7 5.9 6 8.9 9.4 7.9 12.4 11.1 15 15 15
8岁(1+) 3.7 9.3 7 6.1 9.4 8.8 7.1 13.2 11.2 15 15 15
总和 4 9.3 5.6 5.6 9 8.7 6.9 12.9 10.3 15 15 15


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