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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
TBK1型 纳克
序列长度(AA) 分子量(Da)
729 83642
蛋白质名称
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶TBK1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MQSTSNHL公司 LSDILGQGAT公司 ANVFRGRKK公司 TGDLFAIKVF公司 NNISFLRPVD公司
60 70 80 90 100
VQMREFEVLK公司 KLNHKNIVKL公司 费耶特 香港时间 CGSLYTVLEE公司
110 120 130 140 150
PSNAYGLPES公司 EFLIVLRDVV公司 GGMNHLRENG公司 IVHRDIKPGN公司 IMRVIGEDGQ公司
160 170 180 190 200
SVYKLTDFGA公司 阿列德基金 VSLYGTEEYL公司 HPDMYERAVL公司 RKDHQKKYGA公司
210 220 230 240 250
TVDLWSIGVT FYHAATGSLP公司 FRPFEGPRRN公司 KEVMYKIITG公司 KPSGAISGVQ公司
260 270 280 290 300
坎皮德斯 GDMPVSCSLS公司 RGLQVLLTPV公司 连卡佛 KCWGFDQFFA公司
310 320 330 340 350
ETSDILHRMV公司 IHVFSLQQMT公司 AHKIYIHSYN公司 TATIFHELVY公司 KQTK公司S公司S公司N个
360 370 380 390 400
E类Y(Y)E类G公司R(右)RLV(RLV) LEPGRLAQUF公司 PKTTEENPIF公司 可变电压开关E类P(P)N个T型 G公司Y(Y)E类K(K)ISLP公司
410 420 430 440 450
KVHPRYDLDG公司 DASMAKAITG公司 VVCYACRIAS公司 TLLLYQELMR公司 克格列利
460 470 480 490 500
KDDYNETVHK公司 KTEVVITLDF公司 CIRNIEKTVK公司 VYEKLMKINL公司 EAAELGEISD公司
510 520 530 540 550
IHTKLLRLSS公司 SQGTIETSLQ公司 DIDSRLSPGG公司 斯拉达瓦赫 总投资
560 570 580 590 600
KLQVLLNCMT公司 EIYYQFKKDK公司 AERR公司一个Y(Y)N个E类E类 H(H)K(K)FDKQKL公司 YYHATKAMTH公司
610 620 630 640 650
FTDECVKKYE公司 AFLNKSEEWI公司 RKMLHLRKQL公司 LSLTNQCFDI公司 EEEVSK公司Y(Y)E类Y(Y)
660 670 680 690 700
T型N个E类E类T型P(P) K(K)MFTASSGIK公司 HTMTPIYPSS公司 NTLVEMTLGM公司 KKLKEEMEGV公司
710 720 729
VKELAENNHI公司 LERFGSLTMD公司 GGLRNVDCL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-910的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TBK1型
顺序
EPLNTIGLIYEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
385
肽末端
396
CPTAC标识
CPTAC-910型
肽分子质量
1,388.7551
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 3.4 3.4 2.5 3.7 3.3 5 4.7 3.9 15 15 15
y4(1+) 3.5 3.3 3.5 9.5 3.6 5.3 10.1 4.9 6.4 15 15 15
y5(1+) 15.2 11.8 6.9 16.2 10.6 6.2 22.2 15.9 9.3 15 15 15
y6(1+) 4.9 4.6 3.3 3.8 3.7 2.6 6.2 5.9 4.2 15 15 15
7岁(1+) 8.6 4.4 5.1 8.4 5.2 5.4 12 6.8 7.4 15 15 15
8岁(1+) 11.6 4.2 6.9 15.9 4.3 6.8 19.7 6 9.7 15 15 15
9岁(1+) 13.7 6.3 6.5 14.4 6.7 6.9 19.9 9.2 9.5 15 15 15
y10(1+) 20.5 9 8.6 17.8 9.6 6.8 27.1 13.2 11 15 15 15
总和 2.5 1.6 1.6 3.4 1.7 1.8 4.2 2.3 2.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2973的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TBK1型
顺序
IISSNQELIYEGR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
345
肽末端
357
CPTAC标识
中国石油天然气集团公司-2973
肽分子质量
1,520.7835
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300毫升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 8 5.4 7.2 3.9 3.4 10.8 6.7 4.5 15 15 15
y4(1+) 4.9 4.2 2 8.7 3.8 1.7 10 5.7 2.6 15 15 15
y6(1+) 4.9 4.4 3.5 6.2 3.8 3.7 7.9 5.8 5.1 15 15 15
总和 5 4.5 2.2 7 3.6 2.4 8.6 5.8 3.3 15 15 15


其他资源和意见

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CPTAC-2972的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TBK1型
顺序
莱茵基克
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
575
肽末端
584
CPTAC标识
中国石油天然气集团公司-2972
肽分子质量
1,243.6197
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德-汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 4.4 5 5.2 5.6 2.9 6.8 7.5 4.2 15 15 15
y5(1+) 8.8 4.2 5.9 10.4 4.7 4.3 13.6 6.3 7.3 15 15 15
y6(1+) 4.4 5.2 4.4 3.9 6.5 3.9 5.9 8.3 5.9 15 15 15
总和 3.8 3.9 3.5 4.6 5 2.7 6 6.3 4.4 15 15 15


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CPTAC-911的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
TBK1型
顺序
YQEYTNELQETLPQK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
647
肽末端
661
CPTAC标识
CPTAC-911公司
肽分子质量
1,882.8949
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源的异种移植物乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德-汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米LC(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 5.9 3.6 4.4 6.7 4.4 4.5 8.9 5.7 6.3 15 15 15
y6(1+) 27.7 10 8.9 26.3 10.6 8.4 38.2 14.6 12.2 15 15 15
b3(1+) 23.5 8.9 7.5 26.2 11.4 6.3 35.2 14.5 9.8 15 15 15
总和 6.4 2.4 3.5 7.6 4.1 4.1 9.9 4.8 5.4 15 15 15


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