显示导航
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
LDHA公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
332 36689
蛋白质名称
L-乳酸脱氢酶A链
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
材料D类L(左)Y(Y) N个L(左)L(左)K(K)EEQTPQ公司 NKITVVGVGA公司 VGMACAISIL公司 MKDLADELL公司
60 70 80 90 100
VDVIEDKLKG公司 EMMDLQHGSL公司 FLRTPKIVSG公司 KDYNVTANSK公司 L(左)V(V)T型A类G公司A类R(右)
110 120 130 140 150
QEGESRLNLV公司 QRNVNIFKFI公司 IPNVVKYSPN公司 CKLLIVSNPV公司 迪尔蒂瓦夫基
160 170 180 190 200
SGFPKNRVIG公司 SGCNLDSARF公司 RYLMGERLGV公司 HPLSCHGWVL公司 GEHGDSSVPV公司
210 220 230 240 250
WSGMNVAGVS公司 LKTLHPDLGT公司 DKDKEQWKEV公司 HKQVVESAYE公司 VIKLKGYTSW公司
260 270 280 290 300
艾格尔斯瓦德拉 ESIMKNLRRV公司 HPVSTMIKGL公司 YGIKDDVFLS公司 VPCILGQNGI公司
310 320 330 332
SDLVK公司V(V)T型L(左)T型S公司 电子电子电子A类R(右)LKKSA公司 DTLWGIQKEL公司 卡塔尔金融中心

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

装载

装载机

CPTAC-91的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
LDHA公司
顺序
dqiynllk公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
6
肽末端
14
CPTAC标识
CPTAC-91型
肽分子质量
1,118.6336
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C和15N K
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流量
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 14.6 8.4 5.7 36.1 21.3 11 38.9 22.9 12.4 15 25 15
y6(1+) 13.6 7.4 4.9 33.5 19.8 11 36.2 21.1 12 15 25 15
y5(1+) 18.2 7.8 5.3 34.6 20.4 10.6 39.1 21.8 11.9 15 25 15
总和 14.6 7.7 5.1 33.8 20.3 10.6 36.8 21.7 11.8 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2749的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
LDHA公司
顺序
LVIITAGAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
91
肽末端
99
CPTAC标识
CPTAC-2749型
肽分子质量
912.5757
物种
人类 Sapiens公司
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher Q-Exactive公司
内部标准
柱上13 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流量
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 9.3 5.4 8.5 9.8 5.3 9.6 13.5 7.6 12.8 15 15 15
y5(1+) 10 3.1 8.8 14 5.4 10.3 17.2 6.2 13.5 15 15 15
y3(1+) 13.1 7.1 11.6 15.6 7.6 12.4 20.4 10.4 17 15 15 15
总和 9.4 3.7 8.7 11.5 5 10 14.9 6.2 13.3 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-2750的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
LDHA公司
顺序
VTLTSEEEAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
306
肽末端
315
CPTAC标识
CPTAC-2750型
肽分子质量
1,133.5564
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
ThermoFisher Q-Exactive公司
内部标准
柱上13 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流量
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 5.1 3.2 6 5.1 3.6 7.1 7.2 4.8 9.3 15 15 15
y4(1+) 6.4 7.6 6.1 7.9 7.2 7 10.2 10.5 9.3 15 15 15
y3(1+) 13.8 6.5 10 16 8.6 10.8 21.1 10.8 14.7 15 15 15
总和 5.4 3.6 5.6 5.7 3.8 6.8 7.9 5.2 8.8 15 15 15


其他资源和评论