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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
SRC公司 SRC1型
序列长度(AA) 分子量(Da)
536 59835
蛋白质名称
原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MGSNKSKPKD公司 ASQRRRSLEP公司 AENVHGAGG公司 AFPASQTPSK公司 PASADGHRGP公司
60 70 80 90 100
SAAFAPAAAE公司 PKLFGGFNSS公司 DTVTSPQRAG公司 PLAGGVTTFV公司 ALYDYESRTE公司
110 120 130 140 150
TDLSFKKGER公司 LQIVNNTEGD公司 WWLAHSLSTG公司 QTGYIPSNYV公司 APSDSIQAEE公司
160 170 180 190 200
WYFGKITRRE公司 SERLLLNAEN公司 PRGTFLVRES公司 ETTK公司G公司A类C类L(左)S公司 V(V)S公司D类F类D类N个A类K(K)德国劳埃德船级社
210 220 230 240 250
NVKHYKIRK公司L(左) D类S公司G公司G公司F类T型S公司R(右) tqfnslklv公司 AYYSKHADGL公司 CHRLTTVCPT公司
260 270 280 290 300
SKPQTQGLAK公司 DAWEIPRESL公司 RLEVKLGQGC公司 FGEVWMGTWN公司 GTTRVAIKTL公司
310 320 330 340 350
KPGTMSPEAF公司 LQEAQVMKKL公司 雷克尔夫QLYA 维塞皮耶夫 TEYMSKGSLL公司
360 370 380 390 400
DFLKGETGKY公司 LRLPQLVDMA公司 AQIASGMAYV公司 埃尔姆尼夫赫R(右)D类L(左) R(右)A类A类N个L(左)V(V)发电机
410 420 430 440 450
LVCKVADFGL公司 阿列德奈特 ARQGAKFPIK公司 WTAPEAALYG公司 RFTIKSDVWS公司
460 470 480 490 500
FGILLTELTT公司 KGRVPYPGMV公司 NREVLDQVER公司 GYRMPCPPEC公司 PESLHDLMCQ公司
510 520 530 536
CWRKEPERP公司 TFEYLQAFLE公司 DYFTSTEPQY公司 QPGENL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-3072的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
SRC公司
肽修饰顺序
GAYC[+57.0]LSVSDFDNAK公司
修改类型
甲酰胺(C)
蛋白质-修饰位点
189
肽-修饰位点
4
肽开始
185
肽末端
198
CPTAC ID
CPTAC-3072型
肽分子质量
1,545.6770
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 4.7 6 3.5 6.6 5.8 3.6 8.1 8.3 5 15 15 15
8岁(1+) 5.5 5.4 3.6 5.4 5.6 3.5 7.7 7.8 5 15 15 15
7岁(1+) 4.4 6.7 5.5 6.1 3.7 7 9.1 4.8 15 15 15
总和 4 6 3.2 5.4 5.8 3.5 6.7 8.3 4.7 15 15 15


其他资源和意见

评论

CPTAC-3071的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
SRC公司
顺序
LDSGGFYITSR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
210
肽末端
220
CPTAC标识
CPTAC-3071型
肽分子质量
1,214.5932
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 5.1 9.4 5.9 6.2 11 6.3 8 14.5 8.6 15 15 15
y5(1+) 5.2 6.4 4.6 7.2 8.1 6 8.9 10.3 7.6 15 15 15
9岁(1+) 6.2 7.6 4.3 8 9.4 6.5 10.1 12.1 7.8 15 15 15
总和 5.4 7.5 4.5 7 9.3 6 8.8 11.9 7.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-905的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
SRC公司
肽修饰顺序
列德尼[+80.0]焦油
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
419
肽-修饰位点
7
肽开始
388
肽末端
397
CPTAC标识
CPTAC-905型
肽分子质量
1,302.5493
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120Å
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 25.3 11.9 11.2 31.4 14.5 15.2 40.3 18.8 18.9 15 15 15
y4(1+) 14.3 11.6 8.5 14.5 14.4 7.6 20.4 18.5 11.4 15 15 15
y5(1+) 21.1 10.3 8.4 23.6 11.5 10.9 31.7 15.4 13.8 15 15 15
y6(1+) 6.5 6.9 7.7 11.6 9 9.6 13.3 11.3 12.3 15 15 15
7岁(1+) 14.4 8.1 7.4 12.6 8.3 9.9 19.1 11.6 12.4 15 15 15
8岁(1+) 12.9 7.1 7.1 14.9 8.6 8 19.7 11.2 10.7 15 15 15
总和 3.4 5.9 4.6 6 7.2 6 6.9 9.3 7.6 15 15 15


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