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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
RIPK1段 RIP、RIP1
序列长度(AA) 分子量(Da)
671 75931
蛋白质名称
受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MQPDMSLNVI公司 KMKSSDFLES公司 AELDSGGFGK公司 VSLCFHRTQG公司 lmimktvyk公司
60 70 80 90 100
PNCIEHNEAL公司 LEEAKMMNRL公司 RHSRVVKLLG公司 VIIEEGKYSL公司 VMEYMEKGNL公司
110 120 130 140 150
MHVLKAEMST公司 PLSVKGRIL公司 EIIEGMCYLH公司 GKGVIHKDLK公司 PENILVDNDF公司
160 170 180 190 200
徒步一个D类G公司一个 S公司F类K(K)MWSKLNN公司 EEHNELREVD公司 GTAKKNGGTL公司 YYMAPEHLND公司
210 220 230 240 250
VNAKPTEKSD公司 VYSFAVVLWA公司 IFANKEPYEN公司 AICEQQLIMC公司 IKSGNRPDVD公司
260 270 280 290 300
DITEYCPREI公司 ISLMKLCWEA公司 NPEARPTFPG公司 IEEKFRPFYL公司 SQLEESVEED公司
310 320 330 340 350
VKSLKKEYSN公司 ENAVKR公司S公司 D类C类V(V)一个V(V)S公司 S公司R(右)SNSATEQP公司 GSLHSSQGLG公司
360 370 380 390 400
MGPVEESWFA公司 PSLEHPQEEN公司 EPSLQSKLQD公司 EANYHLYGSR公司 中长期定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量定量
410 420 430 440 450
QNVAYNREEE公司 RRRRVSHDPF公司 AQQRPYENFQ公司 NTEGKGTAYS公司 SAASHGNAVH公司
460 470 480 490 500
QPSGLTSQPQ公司 VLYQNNGLYS公司 SHGFGTRPLD公司 PGTAGPRVWY公司 RPIPSHMPSL公司
510 520 530 540 550
HNIPVPETNY公司 LGNTPTMPFS公司 SLPPTDESIK公司 YTIYNSTGIQ公司 伊格尼梅格
560 570 580 590 600
GTSSSLLDST公司 NTNFKEEPAA公司 K(K)Y(Y)一个F类D类N个T型T型 S公司T型D类K(K)HLDPI公司 伦格霍恩
610 620 630 640 650
CARKLGFTQS公司 齐迪德耶 RDGLKEKVYQ公司 MLQKWVMREG公司 IKGATVGKLA公司
660 670 671
QALHQCSRID公司 LLSSLIYVSQ公司 N个

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1053的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RIPK1段
顺序
IADLGLASFK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
154
肽末端
163
CPTAC标识
CPTAC-1053型
肽分子质量
1,033.5808
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 4.4 3.6 3.3 4.9 4.6 4.1 6.6 5.8 5.3 15 15 15
8岁(1+) 7.3 3.1 2.1 7.5 3.4 2.9 10.5 4.6 3.6 15 15 15
y7(1+) 6.5 3.4 3.1 6.6 4.5 3.3 9.3 5.6 4.5 15 15 15
y6(1+) 8.3 2.8 2.5 7.9 3.5 3.5 11.5 4.5 4.3 15 15 15
y5(1+) 7 7.2 6.6 7.8 6.4 8.3 10.5 9.6 10.6 15 15 15
y4(1+) 12.8 4.8 2.6 10.3 5.5 4 16.4 7.3 4.8 15 15 15
y3(1+) 6.8 6.4 4.4 4.1 9.3 5.3 5.1 15 15 15
b3(1+) 8.5 3.9 3.5 10.5 4.5 3.7 13.5 6 5.1 15 15 15
b5(1+) 9.5 4.5 6.1 9 5.2 9 13.1 6.9 10.9 15 15 15
总和 5.3 2 1.2 4.3 2.5 6.8 3.6 2.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-900的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RIPK1段
肽修饰顺序
MQS[+80.0]LQLDC[+57.0]VAVPSSR公司
修改类型
膦(ST),氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
320, 325
肽-修饰位点
3、8
肽开始
318
肽末端
332
CPTAC标识
CPTAC-900型
肽分子质量
1,769.7842
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 43.5 19 21.4 44.8 14 22.1 62.4 23.6 30.8 15 15 15
y4(1+) 16.2 6.7 8.7 18.2 5.9 9.1 24.4 8.9 12.6 15 15 15
y5(1+) 22 10.5 12.4 22.3 11.8 11.5 31.3 15.8 16.9 15 15 15
y6(1+) 12.5 6.7 8.4 14.7 8.6 9.3 19.3 10.9 12.5 15 15 15
y7(1+) 41.7 19.1 12.4 49 12.3 13.2 64.3 22.7 18.1 15 15 15
8岁(1+) 24.6 30.4 25 31 25 22.7 39.6 39.4 33.8 15 15 15
9岁(1+) 98.7 36.9 40.2 107.7 37.2 33.8 146.1 52.4 52.5 15 15 15
y10(1+) 123.9 78.6 77.6 135.9 77.2 60.5 183.9 110.2 98.4 15 15 15
y11(1+) 92.9 119.6 86.9 85.6 98.6 95.5 126.3 155 129.1 14 12 14
y12(1+) 173.2 141.4 71.5 141.4 173.2 57.9 223.6 223.6 92 5 7 7
b12(1+) 24.5 173.2 200 174.9 7 6 6
b11(1+) 173.2 120.3 153.2 173.2 129.1 132 244.9 176.5 202.2 7 9 8
b10(1+) 141.4 119.4 127.6 157.3 143.1 141.2 211.5 186.4 190.3 11 11 12
b9(1+) 123 68.4 37.1 144 98.8 57.2 189.4 120.2 68.2 12 10 11
b8(1+) 103.9 52.5 39.1 90.3 52.4 41.4 137.7 74.2 56.9 15 15 15
b7(1+) 61.1 35.7 15.7 61.4 35.4 16.4 86.6 50.3 22.7 15 15 15
b6(1+) 38.5 32.4 25 42.4 37 23.1 57.3 49.2 34 15 15 15
b5(1+) 24.9 11.2 20.5 25.9 16.7 20.6 35.9 20.1 29.1 15 15 15
b4(1+) 64.1 36 40.1 78.6 32.8 53 101.4 48.7 66.5 15 15 15
b3(1+) 68.3 20.9 22.5 88.1 23.3 16 111.5 31.3 27.6 15 15 15
总和 8.8 4.6 4.9 8.2 5.8 5.1 12 7.4 7.1 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-901的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RIPK1段
肽修饰顺序
MQSLQLDC[+57.0]VAVPSSR
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
325
肽-修饰位点
8
肽开始
318
肽末端
332
CPTAC标识
CPTAC-901型
肽分子质量
1,689.8178
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米LC(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 10.7 6.6 9.1 11 6.5 8.2 15.3 9.3 12.2 15 15 15
y5(1+) 19.2 15.1 8.1 18.7 17.6 10.5 26.8 23.2 13.3 15 15 15
y6(1+) 21 8.4 9.6 18.6 9.6 8.9 28.1 12.8 13.1 15 15 15
8岁(1+) 14.2 14.8 6.3 16.1 15.9 7.9 21.5 21.7 10.1 15 15 15
9岁(1+) 15.3 10.1 7.7 17.3 11.4 6 23.1 15.2 9.8 15 15 15
y10(1+) 12 8.6 9.4 15.4 9 10.1 19.5 12.4 13.8 15 15 15
y13(1+) 12 13.3 15 14 11.1 15.7 18.4 17.3 21.7 15 15 15
总和 6 3.4 2.9 7.1 3.7 9.3 5 4.2 15 15 15


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评论

CPTAC-902的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
RIPK1段
顺序
YQAIFDNTTSLTDK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
572
肽末端
585
CPTAC标识
CPTAC-902型
肽分子质量
1,615.7730
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800毫升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 14.4 8.5 9.3 15.6 8 8.6 21.2 11.7 12.7 15 15 15
y4(1+) 16.9 9.7 9 18.1 9.9 8.5 24.8 13.9 12.4 15 15 15
y5(1+) 16.5 4.7 8 16 5.9 8.7 23 7.5 11.8 15 15 15
y6(1+) 11.8 8.9 10.1 14.8 7.2 9.3 18.9 11.4 13.7 15 15 15
7岁(1+) 12.8 12.2 11.2 12.2 13.9 12.1 17.7 18.5 16.5 15 15 15
8岁(1+) 17 7.9 7.1 21.1 11.9 7.3 27.1 14.3 10.2 15 15 15
9岁(1+) 14.5 8.6 5.4 16.2 5.8 7.1 21.7 10.4 8.9 15 15 15
y10(1+) 14.4 5.2 5.3 15 7.3 8.2 20.8 9 9.8 15 15 15
y11(1+) 11.5 6.8 8.5 14.3 9.8 9 18.4 11.9 12.4 15 15 15
y12(1+) 14.5 7.8 5.6 16.7 8.3 6.6 22.1 11.4 8.7 15 15 15
b3(1+) 8.2 6.3 5.3 8.2 6.7 5.2 11.6 9.2 7.4 15 15 15
总和 3.4 3.6 2.6 4.3 3.4 2.5 5.5 5 3.6 15 15 15


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