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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
地图3K3 MAPKK3、MEKK3
序列长度(AA) 分子量(Da)
626 70898
蛋白质名称
有丝分裂原活化蛋白激酶激酶3
来源
UniProt公司
PhosphoSitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MDEQEALNSI公司 MNDLVALQMN公司 RRHRMPGYET公司 MKNKDTGHSN公司 RQSDVRIKFE公司
60 70 80 90 100
HNGERRIIAF公司 SRPVKYEDVE公司 香港VTTVFGQP LDLHYMNNEL公司 SILLKNQDDL公司
110 120 130 140 150
DKAIDILDRS公司 SSMKS钻孔 LSQDRNHNSS公司 SPHSGVSRQV公司 RIK公司A类S公司S公司A类G公司D类
160 170 180 190 200
N个T型Y(Y)P(P)P(P)E类P(P) R(右)SRHLSVSSQ公司 NPGRSSPPG公司 YVPERQQHIA公司 RQGSYTSINS公司
210 220 230 240 250
EGEFIPETSE公司 QCMLDPLSSA公司 ENSLSGSCQS公司 LDRSADSPSF RKSRMSR公司A类S公司
260 270 280 290 300
F类P(P)D类N个R(右)QEYSD公司 返回码kgv KGGTYPRRYH公司 VSVHHKDYSD公司 GRRTFPRIRR公司
310 320 330 340 350
HQGNLFTLVP公司 SSRSLSTNGE公司 NMGLAVQYLD公司 PRGRLR公司S公司A类D类S公司 E类N个A类L(左)S公司V(V)E类R(右)N个
360 370 380 390 400
VPTK公司S公司P(P)S公司A类P(P) N个W公司R(右)RGKLLGQ公司 GAFGRVYLCY公司 DVDTGRELAS公司 KQVQFDPDSP公司
410 420 430 440 450
ETSKEVSALE公司 CEIQLLKNLQ公司 HERIVQYYGC公司 LRDRAEKTLT公司 IFMEYMPGGS公司
460 470 480 490 500
VKDQLKAYGA公司 LTESVTRKYT公司 RQILEGMSYL公司 HSNMIVHRDI公司 KGANILRDSA公司
510 520 530 540 550
GNVKLGDFGA公司 SKRLQTIMS公司 GTGMRSVTGT公司 PYWMSPEVIS公司 格格尔卡夫
560 570 580 590 600
WSLGCTVVEM公司 LTEKPPWAEY公司 EAMAAIFKIA公司 TQPTNPQLPS公司 HISEHGRDFL公司
610 620 626
rrivearqr PSAEELLTH公司 FAQLMY公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-845的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图3K3
顺序
AQSFPDNR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
248
肽末端
255
CPTAC标识
CPTAC-845型
肽分子质量
933.4304
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
TripleTOF 5600以上(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 21.4 18 17.3 25 16.5 17.2 32.9 24.4 24.4 15 15 15
y4(1+) 9.8 7 5 8.4 7.3 2.8 12.9 10.1 5.7 15 15 15
y6(1+) 7.7 2.5 3.1 7.4 3.2 3.2 10.7 4.1 4.5 15 15 15
b3(1+) 21.2 12 10.3 18.2 11.9 10.7 27.9 16.9 14.9 15 15 15
总和 6.6 3.6 2.5 6.5 3.7 2.3 9.3 5.2 3.4 15 15 15


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评论

CPTAC-2993的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图3K3
顺序
按质量分类
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
144
肽末端
161
CPTAC标识
CPTAC-1993年
肽分子质量
1,942.9385
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 6.3 2.5 3.2 7.7 3.3 3.4 9.9 4.1 4.7 15 15 15
y4(1+) 23.5 2.5 4.5 25.9 3.7 5.7 35 4.5 7.3 15 15 15
y5(1+) 6.1 3.3 2.1 7.2 3.6 2.2 9.4 4.9 15 15 15
总和 4.8 2.5 2.4 5.8 2.4 7.5 3.9 3.4 15 15 15


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评论

CPTAC-846的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图3K3
顺序
SADSENALSVQER公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
337
肽末端
349
CPTAC标识
CPTAC-846型
肽分子质量
1,404.6481
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

化验参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 9.4 8.2 10.9 10.4 12.1 10.4 14 14.6 15.1 15 15 15
y4(1+) 12.1 9.7 9.7 16.8 10.2 9.7 20.7 14.1 13.7 15 15 15
y5(1+) 6.9 6.3 4.4 6.5 5.9 2.5 9.5 8.6 5.1 15 15 15
y6(1+) 7.8 6.4 4.3 8.9 6.6 5.2 11.8 9.2 6.7 15 15 15
7岁(1+) 7.9 6.6 5.4 8.6 6.9 6.1 11.7 9.5 8.1 15 15 15
8岁(1+) 8.6 5.7 2.6 11.7 6.2 3.1 14.5 8.4 4 15 15 15
9岁(1+) 11 11.5 8.4 11.6 10.7 8.3 16 15.7 11.8 15 15 15
y10(1+) 13.3 9.1 7.3 10.5 10.4 9 16.9 13.8 11.6 15 15 15
y11(1+) 21.7 10.8 7.7 20.7 11.1 8 30 15.5 11.1 15 15 15
b3(1+) 13.5 9.7 10.4 21.5 10.7 9.7 25.4 14.4 14.2 15 15 15
总和 3.7 3.5 2.2 4.3 3.3 2.5 5.7 4.8 3.3 15 15 15


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CPTAC-2992的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图3K3
顺序
SPSAPINWR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
355
肽末端
363
CPTAC标识
CPTAC-1992年
肽分子质量
1,026.5247
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 4.6 4 5.1 6.6 5.3 6.1 8 6.6 8 15 15 15
y5(1+) 5.2 3.9 3.9 6.8 5.2 4.8 8.6 6.5 6.2 15 15 15
y6(1+) 3.9 4.5 4.6 8.4 5.4 5.1 9.3 7 6.9 15 15 15
总和 4.7 4 4.3 6.7 5.2 5.1 8.2 6.6 6.7 15 15 15


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