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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

MAP2K6(地图2K6)

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
MAP2K6(地图2K6) MEK6、MKK6、PRKMK6、SKK3
序列长度(AA) 分子量(Da)
334 37492
蛋白质名称
双特异性丝裂原活化蛋白激酶6
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSQSKGKKRN公司 PGLKIPKEAF公司 当量 RDLDSKACIS公司 IGNQNFEVKA公司
60 70 80 90 100
DDLEPIMELG公司 RGAYGVVEKM公司 R(右)H(H)V(V)S公司G公司M(M)A类 V(V)K(K)里拉特夫 QEQKRLLMDL公司
110 120 130 140 150
DISMRTVDCP公司 FTVTFYGALF公司 REGDVWICME公司 LMDTSLDKFY公司 KQVIDKGQTI公司
160 170 180 190 200
PEDILGKIAV公司 SIVKALEHLH公司 SKLSVIHR公司D类V(V) K(K)S公司N个V(V)N个A类 G公司V(V)K(K)MCDFGI公司
210 220 230 240 250
SGYLVDSVAK公司 TIDAGCKPYM公司 APERINPELN公司 QKGYSVKSDI公司 WSLGITMIEL公司
260 270 280 290 300
AILRFPYDSW公司 GTPFQQLKQV公司 VEEPSPQLPA公司 DKFSAEFVDF公司 TSQCLKNSK公司
310 320 330 334
ERPTYPELMQ公司 HPFFT螺栓 G公司T型D类V(V)A类S公司F类V(V)K(K) ILGD公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-820的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MAP2K6(地图2K6)
顺序
DVKPSNVLINALGQVK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
179
肽末端
194
CPTAC标识
CPTAC-820型
肽分子质量
1,693.9727
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800毫升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 10.9 7.5 9.6 13.2 8.2 11.5 17.1 11.1 15 15 15 15
y5(1+) 12.4 8.5 9.1 23.9 7.8 10.9 26.9 11.5 14.2 15 15 15
y6(1+) 25 14.1 13.6 24.7 14.7 12 35.1 20.4 18.1 15 15 15
7岁(1+) 15.8 11.6 10.1 16.8 16 10.2 23.1 19.8 14.4 15 15 15
8岁(1+) 20.9 11.8 8.2 22.3 10.3 8.2 30.6 15.7 11.6 15 15 15
b8(1+) 26.2 15.8 17.8 33 16.5 17.2 42.1 22.8 24.8 15 15 15
b7(1+) 13.8 8.1 6.4 17.2 10.2 5.4 22.1 13 8.4 15 15 15
b6(1+) 17.3 9.4 8.6 16.4 13 8 23.8 16 11.7 15 15 15
b5(1+) 26.7 17.8 19.1 26.5 23.4 23.1 37.6 29.4 30 15 15 15
总和 5.5 3.5 4.5 7.5 5.3 5.5 9.3 6.4 7.1 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-821的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MAP2K6(地图2K6)
顺序
GTDVASFVK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
321
肽末端
329
CPTAC标识
CPTAC-821型
肽分子质量
922.4760
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120Å
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800毫升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 14.3 12.4 8 16.5 8.7 9.4 21.8 15.1 12.3 15 15 15
y4(1+) 14.7 7.8 6.4 12.2 8.2 6.3 19.1 11.3 9 15 15 15
y5(1+) 10.2 4.5 5.9 11.4 5.4 5.1 15.3 7 7.8 15 15 15
y6(1+) 11.2 6.3 7.8 11.9 6.8 6.8 16.3 9.3 10.3 15 15 15
7岁(1+) 10.2 6.4 4.3 10.5 7.5 4.3 14.6 9.9 6.1 15 15 15
b4(1+) 17.7 6 11 16.8 8.9 12.1 24.4 10.7 16.4 15 15 15
b3(1+) 21.4 6.7 10.8 20.2 13.6 11.9 29.4 15.2 16.1 15 15 15
总和 5.3 2.6 2.6 6.4 2.3 2.9 8.3 3.5 3.9 15 15 15


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CPTAC-2907的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
MAP2K6(地图2K6)
顺序
HVPSGQIMAVK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
72
肽末端
82
CPTAC标识
中国石油天然气集团公司-2907
肽分子质量
1,165.6278
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b5(1+) 28 6 6.2 40.5 11.6 9.8 49.2 13.1 11.6 15 15 15
y3(1+) 15.7 10.9 2.6 20.6 14.7 6 25.9 18.3 6.5 15 15 15
b6(1+) 14.7 5.1 4.5 29.5 10.7 11 33 11.9 11.9 15 15 15
总和 10.5 7.2 3.6 23.2 13.1 8.3 25.5 14.9 9 15 15 15


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