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在引用CPTAC分析门户时，请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）分析门户网站（assesss.Cancer.gov）用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

行动4

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
动作4 不适用
序列长度（AA） 分子量（Da）
911 104854
蛋白质名称
α-肌动蛋白-4
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MVDYHAANQS公司 YQYGPSSAGN公司 GAGGGSMGD公司 YMAQEDDWDR公司 DLLLDPAWEK公司
60 70 80 90 100
QQRKTFTAWC公司 NSHLRKAGTQ公司 IENIDEDFRD公司 GLKLMLLEV公司 ISGERLPKPE公司
110 120 130 140 150
RGKMRVHKIN公司 NVNKALDFIA公司 SKGVKLVSIG公司 爱因维德纳克 MTLGMIWTII公司
160 170 180 190 200
LRFAIQDISV公司 EETSAKEGLL公司 LWCQRKTAPY公司 K（K）N个V（V）N个V（V）问N个F类H（H）我 S公司W公司K（K）DGLAFNA公司
210 220 230 240 250
利赫佩利 EYDKLRKDDP公司 VTNLNNAFEV公司 AEKYLDIPKM公司 拉达迪夫塔
260 270 280 290 300
RPDEKAIMTY公司 VSSFYHAFSG公司 阿奎坦 ICKVLAVNQE公司 NEHLMEDYEK公司
310 320 330 340 350
拉德莱维尔 RTIPWLEDRV型 PQKTIQEMQQ公司 KLEDFRDYRR公司 VHKPPKVQEK
360 370 380 390 400
CQLEINFNTL公司 QTKLRLSNRP公司 AFMPSEGKMV公司 SDINNGWQHL公司 EQAEKGYEEW公司
410 420 430 440 450
莱纳勒 LDHLAEKFRQ公司 KASIHEAWTD公司 GKEAMLKHRD公司 叶塔尔斯迪克
460 470 480 490 500
ALIRKHEAFE公司 SDLAAHQDRV型 EQIAAIAQEL公司 NELDYYDSHN公司 VNTRCQKICD公司
510 520 530 540 550
QWDALGSLTH公司 SRREALEKTE公司 KQLEAIDQLH公司 LEYAKRAAPF公司 NNWME修正
560 570 580 590 600
LQDMFIVHTI公司 EEIEGLISAH公司 DQFKSTLPDA公司 德雷亚莱 香港EAQRIAES
610 620 630 640 650
NHIKLSGSNP公司 YTTVTPQIIN公司 SKWEKVQQLV公司 PKRDHALLEE公司 QSKQQSNEHL公司
660 670 680 690 700
RRQFASQANV公司 VGPWIQTKME公司 艾格里西姆 GTLEDQLSHL公司 KQYERSIVDY公司
710 720 730 740 750
KPNLDLLEQQ公司 HQLIQEALIF公司 DNKHTNYTME公司 希尔夫格威尔 TTIARTINEV公司
760 770 780 790 800
恩吉尔塔克 GISQEQMQEF RASFNHFDKD公司 HGGALGPEEF公司 卡里斯格利德
810 820 830 840 850
VENDRQGEAE公司 FNRIMSLVDP公司 NHSGLVTFQA公司 FIDFMSR公司E类T型T型 D类T型D类T型A类D类问V（V）我A类
860 870 880 890 900
S公司F类K（K）VLAGDKN公司 FITAEELRRE公司 LPPDQAEYCI公司 ARMAPYQGPD公司 AVPGALDYKS公司
910 911
FSTALYGESD公司 L（左）

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司


磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-8的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
行动4
肽顺序
ETTDTDTADQVIASFK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
838
肽末端
853
CPTAC标识
CPTAC-8型
肽分子质量
1,740.8054
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

化验参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法较大的图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
y11（1+） 7.8 4.2 4.1 7.9 7.2 17.4 11.1 8.3 17.9 25 15 15
y9（1+） 10.9 5.5 5.5 12.3 6.4 12.2 16.4 8.4 13.4 25 15 15
8岁（1+） 9.7 3.9 6.7 10.1 5.7 8.5 14 6.9 10.8 25 15 15
总和 7.7 4 5.1 8.9 5.7 12.5 11.8 7 13.5 25 15 15

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资源
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在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
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CPTAC-7的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
行动4
肽顺序
NVNVQNFHISWK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
182
肽末端
193
CPTAC标识
CPTAC-7型
肽分子质量
1,484.7524
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
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看法较大的图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

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  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
9岁（1+） 18.2 15 11.4 18.5 14.7 14.2 26 21 18.2 25 15 15
8岁（1+） 24.3 8.7 10.4 34 14.3 13.6 41.8 16.7 17.1 25 15 15
y7（1+） 35.3 12 12.3 79.5 18.6 19.7 87 22.1 23.2 25 15 15
总和 26.8 9.4 10.3 50.2 13.6 12.2 56.9 16.5 16 25 15 15

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