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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
ICAM2公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
275 30654
蛋白质名称
细胞间粘附分子2
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSSFGYRTLT公司 VALFTLICCP公司 GSDEKVFEVH公司 VRPKKLAVEP公司 千克重量
60 70 80 90 100
TCNQPEVGGL公司 ETSLDKILLD公司 EQAQWKHYLV公司 SNISHDTVLQ公司 CHFTCSGKQE公司
110 120 130 140 150
SMNSNVSVYQ公司 PPRQVILTLQ公司 PTLV平均KSF TIECRVPTVE公司 可编程逻辑器件L(左)T型L(左)F类L(左)F类
160 170 180 190 200
R(右)GNETLHYET公司 FGK公司A类A类P(P)A类P(P)E类 A类T型A类T型F类N个T型A类D类 R(右)EDGHRNFSC公司 LAVLDLMSRG公司
210 220 230 240 250
GNIFHKHSAP公司 KMLEIYEPVS公司 DSQMVIV电视 VSVLLSLFVT SVLLCFIFGQ公司
260 270 275
HLRQQRMGTY公司 GVRAAWRLP公司 QAFRP公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-677的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ICAM2公司
肽修饰顺序
aapapqetatfn[+1.0]标准
修改类型
脱酰胺(NQ)
蛋白质-修饰位点
176
肽-修饰位点
13
肽开始
164
肽末端
181
CPTAC标识
CPTAC-677型
肽分子质量
1,818.8384
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
N-连接糖肽固相萃取
矩阵
血清
提交实验室
约翰霍普金斯大学
提交实验室PI
Daniel Chan、Hui Zhang、Zhen Zhang

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Q-精确(ThermoFisher)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Dionex UltiMate 3000 RSLCnano LC(ThermoFisher)
色谱柱填料
Acclaim PepMap100 C18,5um(陷阱);Acclaim PepMap RSLC C18,2um(分析)
立柱尺寸
300um x 5mm(存水弯);75um x 25cm(分析)
流速
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰·霍普金斯大学-A

CPTAC-648:
APMAP。
AGPN[+1.0]GTLFVADAYK公司
CPTAC-649:
AFM公司。
DIENFN[+1.0]STQK公司
CPTAC-650型:
AFM公司。
FN[+1.0]埃特克
CPTAC-651:
SERPINA1号机组。
YLGN[+1.0]ATAIFFLPDEGK公司
CPTAC-652:
亚太经合组织。
FN[+1.0]SSYLQGTNQITGR公司
CPTAC-653:
亚太经合组织。
YDFN[+1.0]SSM[+16.0]利斯塔克
CPTAC-654:
APOH公司。
VYKPSAGN[+1.0]NSLYR公司
CPTAC-655:
BTD公司。
FN[+1.0]DTEVLQR
CPTAC-656:
CDH13。
IN[+1.0]NTHALVSLQNLNK公司
CPTAC-657:
CPB2。
QVHFFVN[+1.0]ASDVDNVK公司
CPTAC-658:
CTSD。
GSLSYLN[+1.0]录像机
CPTAC-659:
JCHAIN公司。
EN[+1.0]ISDPTSPLR(英语:ISDPTSPLR)
CPTAC-660:
内容提供商。
EHEGAIYPDN[+1.0]TTDFQR
CPTAC-661:
CLU公司。
EDALN[+1.0]ETR公司
CPTAC-662:
CLU公司。
局域网[+1.0]LTQGEDQYYLR
CPTAC-663:
DKFZp779M0311。
QSVPAHFVALN[+1.0]葛兰素史克
CPTAC-664:
ATRN公司。
IDSTGN[+1.0]垂直NELR
CPTAC-665:
C4A。
FSDGLESN[+1.0]SSTQFEVK公司
CPTAC-666:
C4A。
GLN[+1.0]VTLSSTGR公司
CPTAC-667:
C8A。
GGSSGSGGLAQN[+1.0]R(GGSSGGLAQ编号:+1.0])
CPTAC-668:
CD44。
AFN[+1.0]STLPTM[+16.0]AQM[+16.0]EK(空军基地编号:+16.0])
CPTAC-669:
IGHG1。
EEQYN[+1.0]风格
CPTAC-670:
LGALS3BP。
阿尔及利亚[+1.0]
CPTAC-671:
惠普。
VVLHPN[+1.0]YSQVDIGLIK公司
CPTAC-672:
SERPINA4系列。
飞行时间[+1.0]分时[+16.0]年
CPTAC-673:
IGHG4。
EEQFN[+1.0]样式
CPTAC-674:
IGHA2。
TPLTAN[+1.0]ITK公司
CPTAC-675:
IGHG2。
EEQFN[+1.0]STFR公司
CPTAC-676:
ITIH2公司。
加菲森[+1.0]FSM[+16.0]TVDGK
CPTAC-677:
ICAM2。
AAPAPQEATATFN[+1.0]标准
CPTAC-678:
LRG1。
LPPGLLAN[+1.0]FTLLR有限责任公司
CPTAC-679:
李维1。
ANQQLN[+1.0]FTEAK公司
CPTAC-680:
TIMP1。
FVGTPEVN[+1.0]数量YQR
CPTAC-681:
LCN2。
同步[+1.0]VTSVLFR
CPTAC-682:
KLKB1。
IYPGVDFGEELN[+1.0]VTFVK
CPTAC-683:
KLKB1。
伊朗伊斯兰共和国[+1.0]同上
CPTAC-684:
SERPING1号机组。
DTFVN[+1.0]ASR(澳大利亚标准化协会)
CPTAC-685:
猪。
VPGN[+1.0]VTAVLGETLK
CPTAC-686:
PTGDS。
SVVAPATDGGLN[+1.0]LTSTFLR公司
CPTAC-687:
KNG1。
LNAENN[+1.0]ATFYFK公司
CPTAC-688:
灯2。
LN[+1.0]SSTIK公司
CPTAC-689:
灯2。
VQPFN[+1.0]VTQGK
CPTAC-690:
悉尼威立雅运输公司。
编号[+1.0]GSLFAFR

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y12(1+) 15.4 18.7 19.4 15 17.7 20.8 21.5 25.7 28.4 15 15 15
y10(1+) 14.1 15.6 17.9 14.9 14.4 15.7 20.5 21.2 23.8 15 15 15
8岁(1+) 23.3 20.5 20.9 32.5 34.7 26.6 40 40.3 33.8 15 15 15
总和 6.7 12.2 12.3 7.6 16.3 12.8 10.1 20.4 17.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

非CPTAC-3315的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
伊卡M2
顺序
LTLSLLR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
144
肽末端
151
CPTAC标识
非CPTAC-3315
肽分子质量
814.5276
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接PRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

分析复用 展开分析面板

约翰斯·霍普金斯大学-A

CPTAC-648:
APMAP。
AGPN[+1.0]GTLFVADAYK公司
CPTAC-649:
AFM公司。
DIENFN[+1.0]STQK公司
CPTAC-650型:
原子力显微镜。
FN[+1.0]埃特克
CPTAC-651:
SERPINA1号机组。
YLGN[+1.0]ATAIFFLPDEGK公司
CPTAC-652:
亚太经合组织。
FN[+1.0]SSYLQGTNQITGR公司
CPTAC-653:
亚太经合组织。
YDFN[+1.0]SSM[+16.0]利斯塔克
CPTAC-654:
APOH公司。
VYKPSAGN[+1.0]NSLYR公司
CPTAC-655:
BTD公司。
FN[+1.0]DTEVLQR
CPTAC-656:
CDH13。
IN[+1.0]NTHALVSLQNLNK公司
CPTAC-657:
CPB2。
QVHFFVN[+1.0]ASDVDNVK公司
CPTAC-658:
CTSD。
GSLSYLN[+1.0]录像机
CPTAC-659:
JCHAIN公司。
EN[+1.0]ISDPTSPLR标准
CPTAC-660公司:
内容提供商。
EHEGAIYPDN[+1.0]TTDFQR
CPTAC-661:
CLU公司。
EDALN[+1.0]ETR公司
CPTAC-662:
CLU公司。
局域网[+1.0]LTQGEDQYYLR
CPTAC-663公司:
DKFZp779M0311。
QSVPAHFVALN[+1.0]葛兰素史克
CPTAC-664:
ATRN公司。
IDSTGN[+1.0]垂直NELR
CPTAC-665:
C4A。
FSDGLESN[+1.0]SSTQFEVK公司
CPTAC-666:
C4A。
GLN[+1.0]VTLSSTGR公司
CPTAC-667:
C8A。
GGSSGSGGLAQN[+1.0]R(GGSSGGLAQ编号:+1.0])
CPTAC-668:
CD44。
AFN[+1.0]STLPTM[+16.0]AQM[+16.0]EK(空军基地编号:+16.0])
CPTAC-669:
IGHG1。
EEQYN[+1.0]风格
CPTAC-670:
LGALS3BP。
ALGFEN[+1.0]ATQALGR公司
CPTAC-671:
惠普。
VVLHPN[+1.0]YSQVDIGLIK公司
CPTAC-672:
SERPINA4系列。
每年FLN[+1.0]DTM[+16.0]
CPTAC-673:
IGHG4。
EEQFN[+1.0]样式
CPTAC-674:
IGHA2。
TPLTAN[+1.0]ITK公司
CPTAC-675:
IGHG2。
EEQFN[+1.0]短期融资券
CPTAC-676:
ITIH2公司。
加菲森[+1.0]FSM[+16.0]TVDGK
CPTAC-677:
ICAM2。
AAPAPQEATATFN[+1.0]标准
CPTAC-678:
LRG1。
LPPGLLAN[+1.0]FTLLR有限责任公司
CPTAC-679:
李维1。
ANQQLN[+1.0]FTEAK公司
CPTAC-680:
TIMP1。
FVGTPEVN[+1.0]数量YQR
CPTAC-681:
LCN2。
同步[+1.0]VTSVLFR
CPTAC-682:
KLKB1。
IYPGVDFGEELN[+1.0]VTFVK
CPTAC-683:
KLKB1。
IYSGILN[+1.0]LSDITK公司
CPTAC-684:
SERPING1号机组。
DTFVN[+1.0]ASR(澳大利亚标准化协会)
CPTAC-685:
PIGR公司。
VPGN[+1.0]VTAVLGETLK公司
CPTAC-686:
PTGDS。
SVVAPATDGGLN[+1.0]LTSTFLR公司
CPTAC-687:
KNG1。
LNAENN[+1.0]ATFYFK公司
CPTAC-688:
灯2。
LN[+1.0]标准时间
CPTAC-689:
灯2。
VQPFN[+1.0]VTQGK
CPTAC-690:
悉尼威立雅运输公司。
编号[+1.0]GSLFAFR

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 5.7 4.8 4.4 12.8 9 4.8 14 10.2 6.5 15 15 15
y4(1+) 6.4 4.7 3.7 12.3 7.5 5.5 13.9 8.9 6.6 15 15 15
y3(2+) 114.4 86.4 64.2 132.1 123.8 57.4 174.8 151 86.1 15 15 15
y5(1+) 5.3 2.4 3.3 13.4 7.8 4.2 14.4 8.2 5.3 15 15 15
y6(1+) 8.1 7.2 5.3 13.3 9.9 9.3 15.6 12.2 10.7 15 15 15
总和 1.8 1.6 1.6 11.9 7.4 3.9 12 7.6 4.2 15 15 15


其他资源和评论

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