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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PNP公司 NP公司
序列长度(AA) 分子量(Da)
289 32118
蛋白质名称
嘌呤核苷磷酸化酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
孟泰迪 KNTAEWLSH公司 TKHRPQVAII公司 CGSGLGGLTD公司 KLTQAQIFDY公司
60 70 80 90 100
GEIPNFPRST公司 VPGHAGRLVF公司 GFLNGRACVM公司 MQGRFHMYEG公司 YPLWKVTFPV型
110 120 130 140 150
RVFHLLGVDT(RVFHLGVDT) LVVTNAAGGL公司 NPKFEVGDIM公司 LIR公司D类H(H)N个L(左)P(P)G公司 F类S公司G公司N个P(P)L(左)R(右)普通合伙人
160 170 180 190 200
NDERFGDRFP无损检测报告 AMSDAYDRTM公司 RQRALSTWKQ MGEQRELQEG公司 TYVMVAGPSF公司
210 220 230 240 250
ETVAECRVLQ公司 KLGADAVGMS公司 特佩维瓦尔 CGLR公司V(V)F类G公司F类S公司L(左) T型N个K(K)VIMDYE公司
260 270 280 289
SLEKANHEEV公司 拉格夸克 LEQFVSILMA公司 SIPLPDKAS公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-570的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PNP公司
顺序
DHINLPGFSGQNPLR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
134
肽末端
148
CPTAC标识
CPTAC-570型
肽分子质量
1,663.8431
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 26.7 24.8 21.7 46.5 29.9 35.6 53.6 38.8 41.7 15 25 15
y10(1+) 35 8.4 7.7 42 17.2 13.7 54.7 19.1 15.7 15 25 15
9岁(1+) 46.9 39.8 24.6 47 44.1 30.6 66.4 59.4 39.3 15 25 15
总和 26.9 8.3 7.3 33.5 16.5 15.3 43 18.5 17 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-571的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PNP公司
顺序
VFGFSLITNK公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
235
肽末端
244
CPTAC标识
CPTAC-571型
肽分子质量
1,124.6230
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 10.2 6.6 5 17.5 7.4 4.1 20.3 9.9 6.5 15 25 15
7岁(1+) 20.1 8 6 32.6 10.4 7.2 38.3 13.1 9.4 15 25 15
y6(1+) 12.3 6.6 5.4 17.5 7.6 6.6 21.4 10.1 8.5 15 25 15
总和 9.6 6.1 4.7 15.1 6.8 3.8 17.9 9.1 6 15 25 15


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