显示导航
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
PCNA公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
261 28769
蛋白质名称
增殖细胞核抗原
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MFEAR公司V(V)G公司S公司 KKVLEAL公司 DLINEACWDI公司 SSSGVNLQSM公司 DSSHVSLVQL软件
60 70 80 90 100
TLRSEGFDTY公司 RCDRNLAMGV公司 NLTSMSKILK公司 CAGNEDIITL公司 R(右)一个E类D类N个一个D类T型一个
110 120 130 140 150
V(V)F类E类一个P(P)N个E类K VSDYEMKLMD公司 LDVEQLGIPE公司 QEYSCVVKMP公司 胃溃疡D类
160 170 180 190 200
S公司H(H)G公司D类一个V(V)V(V) S公司C类一个KD类G公司V(V)KF类S公司 一个S公司G公司E类G公司N个G公司N个 KLSQTSNVDK公司 EEEAVTIEMN公司
210 220 230 240 250
EPVQLTFALR公司 YLNFFTKATP公司 LSSTVTLSMS公司 ADVPLVVEYK公司 IADMGHLKYY公司
260 261
拉皮代格 S公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-3243的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
AEDNADTLALVFEAPNQEK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
92
肽末端
110
CPTAC标识
CPTAC-3243型
肽分子质量
2,073.9855
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流量
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 39.2 16.6 20 16.1 29 37.2 42.4 33.4 42.2 15 15 15
y6(1+) 42.5 19 21.2 25.2 31.4 36.5 49.4 36.7 42.2 15 15 15
8岁(1+) 44.2 21.8 23.6 28 33.9 34.5 52.3 40.3 41.8 15 15 15
y10(1+) 34.9 19.3 20.3 29.9 29.5 34.7 46 35.3 40.2 15 15 15
9岁(1+) 32.6 22.8 18 30.6 33.8 34.9 44.7 40.8 39.3 15 15 15
总和 36.1 17.6 19.9 23.2 31.4 34.8 42.9 36 40.1 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-3244的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
162
肽-修饰位点
13
肽开始
150
肽末端
164
CPTAC标识
CPTAC-3244型
肽分子质量
1,583.7977
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流量
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b9(1+) 26.5 11.4 11.5 45.2 11.3 13.2 52.4 16.1 17.5 15 15 15
y6(1+) 21.4 13 7.3 28.2 17.2 11.4 35.4 21.6 13.5 15 15 15
7岁(1+) 23.2 19.9 10.7 47.6 27.1 13.1 53 33.6 16.9 15 15 15
总和 22.5 9.8 8.4 35.6 10.9 11 42.1 14.7 13.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-6231的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
DLSHIGDAVVISC[+57.021464]阿拉斯加州
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
7
肽开始
150
肽末端
164
CPTAC标识
CPTAC-6231型
肽分子质量
1,583.7977
物种
人类 智者
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
冷冻组织
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
扩展重肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
埃克西根特
色谱柱填料
阻遏C18,3um
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流量
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 6.3 3.1 3.5 8.2 3.4 4.1 10.3 4.6 5.4 15 15 15
y6(1+) 7.2 3.4 2.5 8.6 3.9 4.1 11.2 5.2 4.8 15 15 15
b9(2+) 30.2 9.9 5.6 32.8 12 5.8 44.6 15.6 8.1 15 15 15
总和 6.4 2.7 2.5 8.2 3.2 3.6 10.4 4.2 4.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3245的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
dlshigdavisc[+57.0]AK[+114.0]DGVK
修改类型
氨基甲基半胱氨酸,泛素
蛋白质-修饰位点
162, 164
肽-修饰位点
13, 15
肽开始
150
肽末端
168
CPTAC标识
CPTAC-3245型
肽分子质量
2,097.0525
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的检测方法,用于响应DNA损伤的磷酸信号的稳健定量。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流量
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 20 13.3 7.5 19.6 15.4 8.9 28 20.3 11.6 15 15 15
8岁(1+) 21.2 23 17.1 24.9 30.7 13.9 32.7 38.4 22 15 15 15
y6(1+) 24.3 19.1 18.5 41.9 26.3 20.4 48.4 32.5 27.5 15 15 15
7岁(1+) 35.3 14.5 13.8 42.5 17.2 11.4 55.2 22.5 17.9 15 15 15
b8(1+) 39.5 10.7 13.4 41 19.6 18.5 56.9 22.3 22.8 15 15 15
b9(2+) 38.6 19.8 12.8 45.6 21 16.7 59.7 28.9 21 15 15 15
总和 12.2 13.8 7.6 15.2 15.1 8.7 19.5 20.5 11.6 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-6232的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
DLSHIGDAVVISC[+57.0214464]AK[+114.043]DGVK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
7
肽开始
150
肽末端
168
CPTAC标识
CPTAC-6232型
肽分子质量
2,097.0525
物种
人类 智者
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
冷冻组织
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
扩展重肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
埃克西根特
色谱柱填料
阻遏C18,3um
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流量
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 14.3 8.1 7.7 14 6.8 10.1 20 10.6 12.7 15 15 15
8岁(1+) 12.4 4.7 5.2 13 5.9 8.6 18 7.5 10 15 15 15
7岁(1+) 10.4 4.5 9.7 11.2 10.5 11.3 15.3 11.4 14.9 15 15 15
y6(1+) 13 7 14.7 10.5 5.6 13.1 16.7 9 19.7 15 15 15
总和 10.7 4.6 6.3 11 5.6 8.5 15.3 7.2 10.6 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-722的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
LVQGSILK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
6
肽末端
13
CPTAC标识
CPTAC-722型
肽分子质量
856.5382
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
等离子体
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

用于免疫多反应监测质谱分析的抗肽单克隆抗体很可能支持Western blot和ELISA。Schoenherr RM、Saul RG、Whiteaker JR、Yan P、Whiteley GR、Paulovich AG。分子细胞蛋白质组学。2015年2月;14(2):382-98. doi:10.1074/mcp。安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省。Epub 2014年12月15日。PMID:25512614


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个陷阱
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Eksigent NanoLC 2D
色谱柱填料
ReproSil-Pur C18-AQ 3微米
立柱尺寸
100毫米x 75微米内径
流量
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 26.8 8.2 3.3 23.8 8.4 5.5 35.8 11.7 6.4 15 15 15
7岁(2+) 32.6 7.8 2.3 29.5 9.5 4.2 44 12.3 4.8 15 15 15
y4(1+) 43.7 16.1 5.5 47.7 17.2 5.5 64.7 23.6 7.8 15 15 15
y5(1+) 17.2 5.1 1.4 19.1 6.7 25.7 8.4 3.3 15 15 15
总和 17.6 4.7 1.1 14.2 5.5 3.6 22.6 7.2 3.8 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-3242的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
LVQGSILK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
6
肽末端
13
CPTAC标识
CPTAC-3242型
肽分子质量
856.5382
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流量
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 19.4 7.4 8.3 19.8 11.3 9 27.7 13.5 12.2 15 15 15
7岁(2+) 47.5 10.4 14.8 31.8 14.9 14.5 57.2 18.2 20.7 15 15 15
y4(1+) 27.4 21.5 8.9 27.8 22.1 11.5 39 30.8 14.5 15 15 15
总和 17.3 6.8 7.1 15.4 10.4 6.3 23.2 12.4 9.5 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-6236的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
LVQGSILK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
7
肽开始
6
肽末端
13
CPTAC标识
CPTAC-6236型
肽分子质量
856.5382
物种
人类 智者
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
冷冻组织
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
扩展重肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
埃克西根特
色谱柱填料
阻遏C18,3um
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流量
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 4.5 2.2 4.8 11.6 9.7 8.5 12.4 9.9 9.8 15 15 15
y4(1+) 12.8 4.4 3.6 13.9 8.4 9.2 18.9 9.5 9.9 15 15 15
总和 3.7 2.3 4.7 11.2 9.6 8.5 11.8 9.9 9.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-124的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
162
肽-修饰位点
13
肽开始
150
肽末端
164
CPTAC标识
CPTAC-1224型
肽分子质量
1,583.7977
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流量
0.5微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 16.5 12.1 19.9 25.9 14.5 15.8 30.7 18.9 25.4 15 15 15
y5(1+) 13.3 11.9 15.6 13.3 10.8 14.4 18.8 16.1 21.2 15 15 15
y6(1+) 11.5 6.2 9.6 13.6 10.5 11.6 17.8 12.2 15.1 15 15 15
总和 11 9.3 14.2 13.9 9.2 12.2 17.7 13.1 18.7 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1225的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
FSASGELGNGNIK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
169
肽末端
181
CPTAC标识
CPTAC-1225型
肽分子质量
1,292.6361
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流量
0.5微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 12.5 7.8 8.4 17.7 8.5 10.1 21.7 11.5 13.1 15 15 15
7岁(1+) 12 6.5 10.4 14.1 8.9 9.3 18.5 11 14 15 15 15
y10(1+) 12.7 6.5 10.5 18 10.2 9.7 22 12.1 14.3 15 15 15
总和 6.4 6.4 9.3 13.3 8.4 9.4 14.8 10.6 13.2 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-558的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
肽修饰顺序
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
162
肽-修饰位点
13
肽开始
150
肽末端
164
CPTAC标识
CPTAC-558型
肽分子质量
1,583.7977
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流量
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 26.6 17.7 9.1 36 19.2 13 44.8 26.1 15.9 25 15 15
y6(1+) 8.4 18.5 5.9 7.3 15 6.3 11.1 23.8 8.6 25 15 15
y5(1+) 10.6 16.8 3.4 10.6 15.7 5.2 15 23 6.2 25 15 15
总和 8.8 17.3 4.2 8.3 15.3 4.8 12.1 23.1 6.4 25 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-559的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
PCNA公司
顺序
FSASGELGNGNIK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
169
肽末端
181
CPTAC标识
CPTAC-559型
肽分子质量
1,292.6361
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


在首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流量
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 18.7 5.6 4.7 30.8 10 3.9 36 11.5 6.1 15 25 15
9岁(1+) 26.8 7 4.1 26.2 8.1 5.3 37.5 10.7 6.7 15 25 15
7岁(1+) 31.9 5.8 4.9 37.2 6.9 6.8 49 9 8.4 15 25 15
总和 14.6 4.1 3.9 25.7 6.6 4.3 29.6 7.8 5.8 15 25 15


其他资源和评论

评论