显示导航→
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
GLS公司 GLS1、KIAA0838
序列长度(AA) 分子量(Da)
669 73461
蛋白质名称
谷氨酰胺酶肾亚型,线粒体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MMRLRGSGML公司 RDLLLRSPAG公司 VSATLRRAQP公司 LVTLCRRPG公司 GGRPAAGPAA公司
60 70 80 90 100
AARLHPWWGG公司 GGWPAEPLAR公司 GLSSSPSEIL公司 QELGK公司G公司T型H(H)P(P) P(P)G公司V(V)P(P)P(P)A类A类P(P)
110 120 130 140 150
A类A类P(P)G公司P(P)K(K)DGPG公司 ETDAFGNSEG公司 凯尔瓦森克 IKQGLLPSLE公司 DLLFYTIAEG公司
160 170 180 190 200
QEKIPVHKFI公司 通话 SDPRLKECMD公司 MLRLTLQTTS公司 DGVMLDKDLF公司
210 220 230 240 250
KKCVQSNIVL公司 LTQAFRRKFV公司 IPDFMSFTSH公司 理想萨克 QSGGKVADYI公司
260 270 280 290 300
PQLAK公司F类P(P)D类L(左) W公司G公司V(V)V(V)C类T型V(V)D类G公司 R(右)高速TGDTKV PFCLQSCVKP公司 LKYAIAVNDL公司
310 320 330 340 350
GTEYVHRYVG公司 KEPSGLRFNK公司 LFLNEDDKPH公司 NPMVNAGAIV公司 VTSLIKQGVN公司
360 370 380 390 400
NAEKFDYVMQ公司 FLNKMANGEY公司 VGFSNATFQS公司 ERESGDRNFA公司 IGYYLKEKKC公司
410 420 430 440 450
FPEGTDMVGI公司 LDFYFQLCSI公司 EVTCESASVM公司 AATLANGGFC公司 PITGERVLSP公司
460 470 480 490 500
EAVRNTLSLM公司 HSCGMYDFSG公司 QFAFHVGLPA公司 KSGVAGGILL公司 VVPNVMGMMC公司
510 520 530 540 550
WSPPLDKMGN公司 SVKGIHFCHD公司 LVSLCNFHNY公司 DNLRHFAKKL公司 DPRREGGDQR公司
560 570 580 590 600
VKSVINLLFA公司 AYTGDVSALR公司 RFALSAMMME公司 QRDYDSRTAL公司 HVAAAEGHVE公司
610 620 630 640 650
VVK应答 VNPFPKDRWN公司 NTPMDEALHF公司 GHHDVFKILQ公司 EYQVQYTPGG公司
660 669
DSDNGKENQT公司 VHKNLDGLL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-517的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GLS公司
肽修饰顺序
FSPDLWGVSVC[+57.0]TVDGQR
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
266
肽-修饰位点
11
肽开始
256
肽末端
272
CPTAC标识
CPTAC-517型
肽分子质量
1,921.8992
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金英秀

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化检测方法以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 16.5 8 18.5 23.8 15.6 18.9 29 17.5 26.4 15 25 15
y10(1+) 33.5 20.9 22.4 42 24.4 27 53.7 32.1 35.1 15 25 15
9岁(1+) 19 10.7 16.3 33.5 15.3 19.5 38.5 18.7 25.4 15 25 15
总和 11 9.4 16.8 20.9 15.1 18.9 23.6 17.8 25.3 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-516的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
GLS公司
顺序
GSTHPQPGVSPPAAPAPGPK
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
86
肽末端
106
CPTAC标识
CPTAC-516型
肽分子质量
1,919.9854
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 53.7 19.2 19.7 58.5 29.2 23.1 79.4 34.9 30.4 15 25 15
y10(1+) 18.9 12.5 8.1 18 18.1 13.8 26.1 22 16 15 25 15
8岁(1+) 28.1 41.7 16.9 23.4 33.3 32.2 36.6 53.4 36.4 15 25 15
总和 16.7 12.7 8.2 15.8 15.3 8.6 23 19.9 11.9 15 25 15


其他资源和评论

评论