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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发测定并建立本出版物中描述的测定的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
CAT公司 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
527 59756
蛋白质名称
过氧化氢酶
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MADSRDPASD公司 QMQHWKEQRA公司 AQKADVLTTG公司 AGNPVGDKLN公司 VITVGPRGPL公司
60 70 80 90 100
LVQDVVFTDE公司 马赫夫德里普 ERVVHAKGAG公司 AFGYFEVTHD公司 ITKYSKAKVF公司
110 120 130 140 150
EHIGKKTPIA公司 VRFSTVAGES公司 GSADTVRDPR公司 GFAVKFYTED公司 GNWDLVGNNT公司
160 170 180 190 200
PIFFIRDPIL公司 FPSFIHSQKR公司 NPQTHLKDPD公司 MVWDFWSLRP公司 ESLHQVSFLF公司
210 220 230 240 250
SDRGIPDGHR公司 HMNGYGSHTF公司 克罗地亚语 YCKFHYKTDQ公司 GIKNLSVEDA公司
260 270 280 290 300
ARLSQEDPDY公司 GIRDLFNAIA公司 TGKYPSWTFY公司 IQVMTFNQAE公司 TFPFNPFDLT公司
310 320 330 340 350
KVWPHKDYPL公司 IPVGKLVLNR公司 NPVNYFAEVE公司 QIAFDPSNMP协议 PGIEASPDKM公司
360 370 380 390 400
LQGRLFAYPD公司 THRHRLGPNY公司 LHIPVNCPYR公司 ARVANYQRDG公司 PMCMQDNQGG公司
410 420 430 440 450
APNYYPNSFG公司 APEQP销售 HSIQYSGEVR公司 R(右)F类N个T型A类N个D类D类N个V(V) T型V(V)R(右)A类F类Y(Y)V(V)N个V(V)
460 470 480 490 500
L(左)N个E类E类R(右)KRLC公司 埃尼亚格尔克达 QIFIQKKAVK公司 N个F类T型E类V(V)H(H)P(P)D类Y(Y)G公司 S公司H(H)IQALLDKY公司
510 520 527
奈克普克奈赫 TFVQSGSHLA公司 阿雷坎尔

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细化验信息
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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-473的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CAT公司
顺序
AFYVNVLNEEQR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
445
肽末端
456
CPTAC标识
CPTAC-473型
肽分子质量
1,480.7310
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 21.5 16.7 7.8 33.8 18.3 11.7 40.1 24.8 14.1 15 15 15
7岁(1+) 52.4 40.8 20.8 55.7 38.9 24.6 76.5 56.4 32.2 15 15 15
y6(1+) 28.9 14.2 9.8 30.1 14.4 11.6 41.7 20.2 15.2 15 15 15
总和 26 14.4 8.3 30.8 13.2 9.5 40.3 19.5 12.6 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-472的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
CAT公司
顺序
FNTANDDNVTQVR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
432
肽末端
444
CPTAC标识
CPTAC-472型
肽分子质量
1492.6906美元
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀(Youngsoo Kim)

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 6.5 2.6 2 8.8 3.2 7.4 10.9 4.1 7.7 25 15 15
9岁(1+) 5 3.7 2.2 7.4 4.7 4.9 8.9 6 5.4 25 15 15
7岁(1+) 5.9 4 2.7 7.9 4.1 7.6 9.9 5.7 8.1 25 15 15
总和 5.3 3.1 2 7.5 4 5.7 9.2 5.1 6 25 15 15


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非CPTAC-3639的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
顺序
NFTDVHPDYGAR公司
修改类型
未经修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
481
肽末端
492
CPTAC标识
非CPTAC-3639
肽分子质量
1,390.6266
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年电子采集。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(2+) 13.5 13.2 12.9 29.1 15.9 14.3 32.1 20.7 19.3 15 15 15
9岁(2+) 19.5 8.8 6.5 25.9 9.1 10 32.4 12.7 11.9 15 15 15
y10(2+) 12.2 5 7.5 10.7 7.9 8.7 16.2 9.3 11.5 15 15 15
y4(1+) 16.4 22.6 11.1 34 15 17 37.7 27.1 20.3 15 15 15
y6(1+) 21.1 11.2 8.8 17.9 13.9 12.1 27.7 17.9 15 15 15 15
总和 7 3.9 5.5 11.1 6.9 7.7 13.1 7.9 9.5 15 15 15


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